杨琼
- 作品数：5 被引量：2H指数：1
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- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 一种用于芯片质控的通用序列标签寡核苷酸探针的设计(英文)
- 2011年
- 目的设计一种带有通用序列标签的寡核苷酸探针以应用于寡核苷酸芯片点样的质量控制。方法以HIV寡核苷酸探针作为核心序列,在其一端或两端连接上多种通用序列标签(UST)构建新型探针。然后打印芯片,以Cy5标记的通用引物(Cy5-UP,与UST互补)进行杂交,筛选出5条荧光信号强的探针,重新打印芯片。再分别以不同浓度梯度的、Cy5标记的通用引物(Cy5-UP)和随机引物(Cy5-RP)与芯片杂交,比较两者杂交效率。结果 Cy5-UP的杂交结果显著优于Cy5-RP的杂交结果,特别是在较低浓度时。结论利用Cy5标记的通用引物检测探针上的通用序列标签,可以为芯片点样的质量控制提供一种更有效的方法。
- 杨琼沈年汉蔡翠霞周珏宇李凌郑文岭
- 关键词：寡核苷酸芯片探针设计
- 血液病原联合检测基因芯片技术的研究
- 为保证临床用血安全,血液在经采集进入血库前要经过严格检测。人类获得性免疫缺陷综合症、乙型肝炎、丙型肝炎以及梅毒作为血液筛查的常规项目,通常要经过严格的初筛和复筛,使用两种不同厂家的试剂由不同的检测人员进行两次检测,且两次...
- 杨琼
- 关键词：寡核苷酸芯片基因芯片
- 戊型肝炎病毒诊断基因芯片制备的初步研究被引量：2
- 2010年
- 目的制备戊型肝炎病毒诊断基因芯片并进行杂交验证。方法利用Oligo6.0软件针对戊型肝炎病毒诊断基因保守区域设计多对寡核苷酸探针,用芯片点样仪将其按照阵列设计打印在玻片上制备成基因芯片。样品标记采用限制性显示技术,样品标记后进行杂交,进而在芯片扫描仪中对得到的探针数据进行分析并实验验证。结果芯片杂交后得到的探针荧光强度好,信噪比高,符合临床样品的基因亚型,RT-PCR验证后得到的电泳结果与芯片实验一致。结论实验设计并制备的寡核苷酸戊型肝炎病毒诊断芯片能用于戊肝的检测,为这项疾病的实验室诊断提供了一种快速平行的检测方法。
- 王治伟马文丽夏薇杨琼郑文岭
- 关键词：戊型肝炎基因芯片
- 梅毒螺旋体寡核苷酸芯片探针的设计及筛选
- 2010年
- 【目的】设计梅毒螺旋体寡核苷酸探针,筛选出适合芯片检测的高敏感性和特异性寡核苷酸探针。【方法】根据梅毒螺旋体特异基因设计寡核苷酸探针,人工合成探针后制备寡核苷酸芯片。提取梅毒螺旋体的DNA,采用通用引物联合标记法进行标记,标记样品与芯片杂交,用芯片扫描仪检测杂交结果。【结果】设计出23条50 mer梅毒螺旋体寡核苷酸探针。标记样品与芯片杂交部分探针有较强的杂交信号,并筛选出符合要求的9条梅毒螺旋体寡核苷酸探针。【结论】以上方法能设计和筛选出敏感性和特异性较高的梅毒螺旋体寡核苷酸探针,可用于制备梅毒螺旋体寡核苷酸芯片。
- 沈年汉杨琼夏巍李凌马文丽
- 关键词：梅毒螺旋体寡核苷酸探针芯片
- 一种用于生物芯片标记效率的研究方法
- 2009年
- 目的利用自杂交的方法对芯片杂交样品的标记效率进行检测和实验质控。方法提取人红白血病K562细胞RNA后,将核酸样品等分成两等份,分别应用通用引物标记Cy3和Cy5荧光物质,然后和制备的K562芯片进行杂交,通过比较杂交后探针上Cy3和Cy5的荧光信号强度,对样品的标记效率和杂交流程进行实验分析和质控。结果杂交后的芯片探针显示为等量的Cy3和Cy5重叠后的黄色荧光,由于样品是等量的同一种核酸物质,从而证明了样品标记的效率一致性较好。结论通过自身杂交方法来比较相同样品两种荧光标记物的信号强度,对芯片本身的质量进行检测,分析标记物的标记效率,可以应用于生物芯片实验的质量控制。
- 王治伟马文丽夏巍杨琼郑文岭
- 关键词：生物芯片杂交
