张莉 作品数:8 被引量:10 H指数:3 供职机构: 南开大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家教育部博士点基金 天津市自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 更多>>
牛泡沫病毒两类启动子活性的比较和机制探讨 被引量:1 2000年 Two promoters, LTR (long terminal repeat) and IP (internal promoter), exist in genomes of foamy viruses. Cell transfection and transient expression assay demonstrated that: the basal activity of BFV (bovine foamy virus) IP is much higher than that of BFV LTR; transactivator of BFV—Borf 1, which activates gene expression directed by BFV LTR, also functions on BFV IP with an activation fold higher than that on LTR. The results suggest that BFV IP and LTR may regulate viral gene expression by different mechanisms, and that Borf 1 may stimulate BFV IP and LTR in different ways. In addition, an in vivo DNA competition assay demonstrated that a common transcription factor may be involved in both mechanisms of the two promoters. 王世珍 张莉 刘佳建 刘淑红 陈启民 耿运琪关键词:牛泡沫病毒 长末端重复序列 启动子 牛泡沫病毒内部启动子的克隆、结构和功能分析 1999年 张莉 乔文涛 王金忠 刘淑红 耿运琪 陈启民关键词:牛泡沫病毒 瞬时表达分析 病毒结构蛋白 开放阅读框架 BSV LTR和Tas的克隆及调节机制研究 刘淑红 耿运琪 陈启民 马明 王金忠 孙庆 刘佳建 张莉 乔文涛 王世珍 该项目发现并证实Borf-1蛋白不仅是牛泡沫病毒编码的反式激活因子,而且是序列特异性DNA结合蛋白,可直接结合LTR中的TREII及IP中的TREIP,而不依赖于细胞因子的介导。TREII与TREIP之间在结合Tas的过...关键词:关键词:泡沫病毒 LTR TAS 反式激活HIV-1LTR的HHV-6基因片段B701的缺失研究 1999年 HHV-6在体外可以激活HIVLTR引导的基因表达[1],其基因组中一基因片段B701已被证明与这种激活作用有关[2].B701编码143个氨基酸的蛋白质,可与HHV-6基因组中其它基因片段协同作用提高对HIVLTR的激活效力.对B701进行缺失突变,得到突变体RSV-B701-d1(3′端缺失181个bp)、RSV-B701-d6(3′端缺失353个bp),将这两个缺失突变体分别与HIV-Luc共转染受体细胞,通过LUC活性分析发现,缺失突变体d1、d6不但仍具有激活能力,而且d6的激活能力要远远大于d1.二级结构预测初步揭示了B701对HIV-LTR的反式激活作用机制,为阐明HHV-6基因产物与AIDS的病理关系提供了依据. 魏莘 张莉 刘淑红 陈启民 耿运琪关键词:HHV-6 缺失突变 反式激活 疱疹病毒 牛泡沫病毒调节蛋白功能及其在LTR上应答元件的研究 被引量:6 2000年 牛泡沫病毒 (BFV)具有复杂的基因组结构 ,其基因组除编码反转录病毒共有的 gag、pol、env 三个结构基因之外 ,在其env和 3′LTR之间有两个重叠的读码框 (ORF - 1和ORF - 2 ) ,编码Borf- 1、Borf- 2、Bet等多种调节蛋白 ,其中Borf- 1(2 49aa)为BFV反式激活因子 (Tas)。为研究Borf - 1的结构与功能 ,Borf - 1在LTR上的应答元件及作用机制 ,Borf- 2、Bet等调节蛋白在BFV基因表达调控中的作用 ,本研究以本室分离鉴定的BFV30 2 6中国毒株为材料 ,克隆Borf- 1等基因片段构建系列质粒 ,与带有luc报告基因的LTR系列缺失质粒共转染 ,作瞬时表达分析。结果表明 ,Borf- 137aa~ 114aa、C端 2 18aa~ 2 49aa为其行使激活功能所必需区域 ;Tas在BFVLTR上的应答元件 (TRE)位于 - 983/ - 6 6 8(TREI)、- 470 / - 140 (TREII)和RU5区 ,其中TREI、TREII均位于U3区 ,为正调控元件 ,RU5区为负调控元件。进一步研究证明 ,TREII能在异源启动子 (BIVLTR)上行使功能 ,且与其自身的方向无关 ,类似于增强子元件。此外还发现 ,RU5区具有抑制其下游基因表达的功能 ,该区在异源启动子 (BIVLTR)之后使其下游基因表达量降低。计算机分析结果表明 ,BFVRU5区的负调控作用可能是因为该区mRNA具有稳定的二级结构 。 刘佳建 王世珍 张莉 乔文涛 陈启民 耿运琪关键词:牛泡沫病毒 调节蛋白 基因表达 牛泡沫病毒内部启动子的克隆及功能分析 被引量:4 2000年 以该实验室分离并鉴定的牛泡沫病毒 (BFV)中国毒株 (BFV3 0 2 6)为材料 ,用PCR方法首次克隆了位于 env 基因 3′端的内部启动子 ,经序列分析后 ,引入luc基因作瞬时表达分析。结果表明 ,该内部启动子不但基础活性高于LTR ,而且转录活性在Tas参与下被大大激活 ,其激活活性也远远高于LTR。同源分析表明 ,非灵长类泡沫病毒内部启动子之间的同源性高于其与灵长类泡沫病毒内部启动子之间的同源性。 张莉 王世珍 刘佳建 刘淑红 陈启民 耿运琪关键词:牛泡沫病毒 ENV基因 LTR 牛泡沫病毒反式激活因子在内部启动子上应答元件的研究 被引量:4 2000年 泡沫病毒的基因转录依赖至少两个不同的启动子 :LTR调节病毒结构蛋白的表达 ,而内部启动子 (IP)则起始调节蛋白mRNA的转录。牛泡沫病毒 (BFV)在env与 3′LTR之间有两个重叠的开放阅读框架orf 1和orf 2 ,分别编码BFVORF 1、ORF 2等多种调节蛋白。这些蛋白中BFVORF 1为转录激活因子 ,称为Tas。Tas对LTR及IP均有反式激活作用。BFV中第二类启动子IP的存在反映了泡沫病毒基因调控的复杂性。已从BFV3 0 2 6中国毒株中克隆了基因组区段 85 72~ 95 0 9,并通过测序和功能分析证明该区段包含了BFVIP。为了对IP进行更精确的定位 ,对其进行了进一步的缺失分析 ,将完整的IP定位在 9117~ 940 5之间。该启动子的TATA盒位于 912 80~92 85 ,是IP必不可少的元件之一。杂合启动子和缺失分析表明 ,TATA盒上游 16 0bp的区域内包含了IP的Tas应答元件 (TREIP) ,其功能类似于增强子。Tas对IP具有强烈的激活作用 ,而C端缺失的ORF 1蛋白或ORF 2蛋白均不足以激活IP的表达。 张莉 乔文涛 刘淑红 王金忠 陈启民 耿运琪关键词:牛泡沫病毒 反式激活HIV-1LTR的人疱疹病毒6型(HHV-6)基因片段的初步研究 1998年 艾滋病(AIDS)主要是由人免疫缺陷病毒(HIV)侵入人体后,破坏人的免疫系统造成的。许多流行病学研究已证明,疱疹病毒与HIV的共感染可以导致对HIV-1启动子的激活,并加速细胞的病理性反应〔1〕,从而加大个体对HIV感染的敏感和加快疾病的进程。人疱... 魏莘 王岱 张莉 刘淑红 陈启民 耿运琪关键词:人疱疹病毒6型 HHV-6 HIV-1 共转染