张新 作品数:79 被引量:706 H指数:14 供职机构: 北京市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 北京市科技新星计划 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 理学 更多>>
临床分离沙门菌的耐药性及超广谱β-内酰胺酶类耐药基因 被引量:12 2018年 目的研究北京地区2012—2015年沙门菌临床分离株的血清型分布、耐药状况及超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)耐药基因特征。方法采用最小抑菌浓度法测定北京市肠道门诊分离的677株沙门菌株对16种抗菌药物的耐药情况,采用聚合酶链反应(PCR)方法对244株β-内酰胺酶类耐药菌株进行耐药基因检测。结果677株沙门菌分为68种血清型,其中肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌和山夫登堡沙门菌位居前3位。沙门菌对氨苄西林和阿莫西林/克拉维酸的耐药率分别为42.54%、40.77%,至少耐3种以上抗菌药物的菌株占57.16%。244株对氨苄西林和阿莫西林/克拉维酸耐药的沙门菌,携带至少一种ESBLs基因的菌株174株(71.31%),146株bla_(TEM-1)型,30株bla_(OXA-1)型,18株bla_(CTX-M)型(其中7株bla_(CTX-M-15),6株bla_(CTX-M-55)和5株bla_(CTX-M-14));20株同时携带2种耐药基因。结论该地区沙门菌携带ESBLs耐药基因水平较高,以bla_(TEM-1)为主,同时伴有bla_(OXA-1)和3种bla_(CTX-M)基因亚型,呈现基因多样性。 曲梅 黄瑛 张新 吕冰 钱海坤 王全意关键词:沙门菌 血清型 超广谱Β-内酰胺酶 耐药基因 耐药性 世界卫生组织和世界动物卫生组织禽流感检测流程的比较 2012年 目的了解世界卫生组织(World Health Organization,WHO)和世界动物卫生组织(Office International DesEpizooties,OIE)的禽流感检测流程的差异,旨在相互借鉴,以建立更加完善的检测流程。方法重点比较WHO和OIE推荐的禽流感RT-PCR检测流程中对于初步阳性、可疑和阴性的样本处理程序,以及发出报告的确证程序,来探讨和完善科学的检测模式。结果 WHO的禽流感检测流程中为防止假阴性结果,还需要进行人流感病毒的进一步检测,为防止假阳性,需要进行测序确证;OIE的禽流感检测流程中为防止假阴性结果,还需要再次采样进行确证,为防止假阳性,还需要与病毒分离培养结果综合定论。结论 WHO和OIE的检测流程都能有效的防止假阴性和假阳性的结果产生,但仍需要补充和完善禽流感其他亚型检测流程。 崔淑娟 张新 石伟先 黄芳 王全意关键词:禽流感 WHO OIE 2015年北京一起鼠伤寒沙门菌暴发流行的病原学检测分析 被引量:3 2016年 2015年5月北京一家大型企业发生聚集性腹泻疫情,流行病学调查后收集现场样本,经过实验室检测确认该次疫情为鼠伤寒沙门菌暴发流行。分离到的18株鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱带型一致,在北京市沙门菌PFGE数据库中未发现相同带型。药物敏感试验结果显示有一株菌株对12种抗生素耐药。这种耐药模式的出现提示需加强耐药监测。 吕冰 贾蕾 张新 曲梅 张海艳 严寒秋 黄瑛 李洁 林长缨 高志勇 梁志超 王全意关键词:鼠伤寒沙门菌 脉冲场凝胶电泳 耐药 初步比较6种荧光PCR试剂盒对肠道病毒核酸的检测效果 2024年 目的初步比较6种品牌肠道病毒EV-A71/CVA16/肠道通用核酸检测试剂盒CVA6/CVA10核酸检测试剂盒的灵敏度和特异性,为检测试剂的选择及疾病监测提供参考。方法选择EV-A71、CVA16、CVA6和CVA10四种血清型毒株作为样本盘,分别10倍梯度稀释。使用数字PCR对梯度稀释的病毒进行核酸定量后,制备混合样本盘并进行倍比稀释,使用实时荧光PCR方法检测。分析各试剂盒的检出限及灵敏度;检测非肠道病原的核酸,分析其特异度;通过分组打分和量化评分法评价扩增曲线特征及Ct值结果,进行综合评分。结果对灵敏度的比较分析中,试剂盒E、A和F检测较为灵敏;在扩增曲线及Ct值分析中,按分值排名检测EV通用的试剂前3为A、C、E;检测EV-A71中前3名为E、A、F;检测CVA16的试剂中,前3名为A、D、E;检测CVA6的试剂前3名为E、D、F;检测CVA10的试剂中,前3名的为E、A、C。各品牌的特异性均较好。结论在EV-A71/CVA16/EV通用3重荧光PCR检测试剂盒中,A、E、C和D综合评分较高,在CVA6/CVA10双重荧光PCR检测试剂盒中E、F综合评分较高,建议在检测肠道病毒相关的监测及疫情样本时,常备两种品牌及以上试剂盒对检测结果相互比较验证,并对扩增曲线和Ct值结果综合判断。本研究的量化评分方法可为其他荧光PCR检测试剂盒评价提供参考。 梁志超 林长缨 杨扬 崔淑娟 高志勇 黄瑛 张新 李仁清关键词:手足口病 肠道病毒 实时荧光PCR 北京地区2009年5-12月急性上呼吸道感染病毒病原学调查 被引量:34 2010年 目的:了解2009年5月-12月间北京地区人群急性上呼吸道感染非甲型流感病毒感染的病毒病原学情况,探讨常见急性上呼吸道感染病毒性病原谱的构成,为北京地区急性呼吸道传染病预防策略的制定提供依据。方法:采用多重RT-PCR方法,对626份甲型流感病毒检测阴性的咽拭子样本同时检测人偏肺病毒、腺病毒、人冠状病毒229E/NL63、副流感1、2、3亚型,乙型流感、人冠状病毒OC43/HUK1,鼻病毒A/B、呼吸道合胞病毒A、B亚型等11种常见呼吸道病毒。结果:626份甲型流感阴性样本中检出其他病毒的阳性样本有115份,阳性率为18.37%,其中有2种以上病毒混合感染14份,占阳性样本的12.17%。5、6、7月份以副流感病毒检出率最高,其中15岁以下患者以1型副流感病毒检出阳性率最高,15岁以上患者中以3型副流感病毒检出阳性率最高;8、9、12月份以鼻病毒检出率为最高。结论:副流感病毒与鼻病毒为2009年5-12月间北京地区人群急性上呼吸道感染的非甲型流感的主要病毒性致病原。 吕燕宁 黄芳 高志勇 张新 崔淑娟 郭靖 张代涛 李伟红 曲梅 严寒秋 卢桂兰 王全意关键词:甲型H1N1流感病毒 多重PCR法 病毒病原学 1例输入性类鼻疽病例病原学特征及耐药分析 2024年 目的 描述1例境外输入类鼻疽患者的流行病学特征、实验室诊断和耐药性特征,为类鼻疽的监测、诊断治疗及防控提供依据。方法 收集患者流行病学调查信息,采集患者全血、血清、尿液、皮疹部位涂抹拭子及肺泡灌洗液样本进行细菌分离培养。培养物采用生化试验进行鉴定,使用肉汤稀释法药敏试验分析耐药情况。结果 患者皮疹部位涂抹拭子及肺泡灌洗液样本经过72 h分离培养,从皮肤涂抹拭子及肺泡灌洗液的样本中分离到2株菌株,经生化鉴定确定为类鼻疽伯克霍尔德菌。耐药性分析显示,该菌株对头孢唑啉、头孢噻肟、庆大霉素、多黏菌素B、氨曲南和链霉素6种药物耐药,患者经治疗后痊愈出院。结论 疾病诊断应关注患者旅行史和接触史,细菌性疾病应关注菌株耐药情况。 梁志超 乔富宇 王小梅 李爽 窦相峰 曲梅 吕冰 李夫 金昊源 张新 任振勇 林长缨关键词:类鼻疽 类鼻疽伯克霍尔德菌 滤膜驱动分离培养法在一起空肠弯曲菌腹泻疫情中的应用 被引量:10 2019年 目的应用滤膜驱动分离培养法对一起腹泻疫情的系列样本进行空肠弯曲菌的检测和培养,并对该方法及其增菌效果进行评价。方法收集一起腹泻疫情的18份粪便标本,采用实时荧光PCR方法为疫情定性为空肠弯曲菌感染,应用滤膜驱动分离培养法对粪便标本进行空肠弯曲菌增菌和分离培养,并对增菌效果进行比较分析。结果采用荧光PCR方法检测到18份标本中有11份空肠弯曲菌核酸阳性,阳性率为61.11%(11/18);应用滤膜驱动分离培养法,对18份标本进行空肠弯曲菌的分离和鉴定,共分到8株菌,分离率为44.44%(8/18);其中3份核酸阳性标本,由于菌液含量低,无法用培养方法检出。11份核酸阳性粪便标本经增菌培养后,Ct平均值由原来的27.44变为23.50,增菌效果显著(P<0.05)。结论采用滤膜驱动分离培养法对粪便标本尤其是冻融粪便进行空肠弯曲菌的增菌和分离培养,能有效提高菌株的分离率,避免资源浪费,可做为常规监测或大规模样本筛检的可行性检测方法。 张新 曲梅 梁志超 林长缨 贾蕾 王全意关键词:空肠弯曲菌 实时荧光PCR 腹泻 北京市348例手足口病临床诊断病例的临床症状与实验室检测分析 被引量:8 2012年 目的:通过对北京市2010年348例手足口病临床诊断病例进行病原学监测,为手足口病预防和控制工作提供实验依据。方法:收集2010年1月-2010年12月间348例手足口病临床诊断病例患者咽拭子标本,进行Realtime-PCR检测,并统计分析。结果:在348例患者的咽拭子标本中,285例检测结果为阳性,其中98例为EV71阳性(34.39%);112例为CoxAl6阳性(39.30%);4例为EV71和CoxA16两种病毒核酸阳性(1.40%);71例为其他肠道病毒阳性(24.91%)。流病学资料中发病季节主要集中于3月-6月份,阳性标本中男女性别比为(1.52∶1),发病年龄主要集中在1岁~6岁儿童(92.98%)。结论:2010年手足口病发病主要集中在3月-6月份,以1-6岁儿童为主,病原为EV71和CoxA16交替流行,以CoxA16略占优势,而EV71感染更易表现为重症。 张新 曲梅 李洁 黄瑛 李爽 李锡太 黎新宇 黄芳 王全意关键词:手足口病 EV71 COXA16 病原学监测 北京地区宋内志贺菌分子流行病学特征分析 被引量:5 2013年 目的了解北京地区宋内志贺菌毒力基因分布及分子流行病学特征。方法采用实时荧光PCR方法检测毒力基因、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型,多位点序列分型(MLST)及多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)等方法对北京地区2001~2009年50株志贺菌菌株进行分子流行病学特征分析。结果 50株菌中,ipaH、set1、sen三种毒力基因的携带率分别为98%,18%和78%。选取19株流行病学和遗传背景无关的菌株,进行MLST、MLVA与PFGE分型方法的比较,MLST为1个序列型ST152 complex:adk(11)、fumC(63)、gyrB(7)、icd(1)、mdh(14)、purA(7)、recA(7);MLVA被分成15个型别,D值为0.9708;PFGE分成12个型别,D值为0.9532。MLVA初筛得到的8个可变数目串联重复(VNTR)位点用于扩大菌株分析,发现50株志贺菌被分为21个MLVA的型别,TS002和TS001为主要型别。结论北京地区近年来流行的宋内志贺菌存在毒力基因的丢失,MLVA分子型别复杂,存在多克隆来源,提示需要进行连续系统的分子流行病学监测。 刘桂荣 曲梅 张新 吴晓娜 李锡太 贾蕾 严寒秋 梁志超 王全意关键词:宋内志贺菌 分子分型 多位点序列分型 北京市2007-2014年O1群霍乱弧菌病原学特征分析 被引量:10 2016年 目的分析北京市2007-2014年分离到的O1群霍乱弧菌的病原学特征。方法对霍乱感染者、水产品和外环境来源的O1群霍乱弧菌,采用血清分型、荧光定量PCR检测霍乱毒素基因ctxAB、K-B法8种药物(多西环素、环丙沙星、诺氟沙星、复方新诺明、丁胺卡那霉素、庆大霉素、头孢曲松和呋喃妥因)进行敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型方法,研究不同来源菌株在各方面的异同。结果北京市2007-2014年共分离得到不同来源O1群霍乱弧菌125株(感染者75株,水产品37株,外环境涂抹13株),小川型96株,稻叶型29株。其中16株菌ctxAB基因阳性(感染者5株,水产品9株,外环境涂抹2株),其他ctxAB基因阴性(感染者70株,水产品28株,外环境涂抹11株);小川型ctxAB基因阴性霍乱弧菌占70.40%(88/125);125株菌对庆大霉素、头孢曲松和呋喃妥因完全敏感,其中25株菌(感染者10株,水产品11株,外环境4株)对5种抗菌药物出现7种耐药型别,有6株来自感染者和水产品的菌株产生双重或三重耐药,而4株外环境的耐药菌株均为单一耐药。PFGE分子分型结果显示,125株菌株经NotⅠ酶切后可分为91种型别,7起聚集性疫情中分离到的37株菌全部为小川型,可分为6个聚类,29株稻叶型菌株可分为3个聚类。结论北京市2007-2014年O1群霍乱弧菌病原学特征复杂多样,在产毒株引起霍乱弧菌疫情减少的情况下,应关注非产毒霍乱弧菌导致的疫情。 黄瑛 赵剑虹 严寒秋 曲梅 张新 吕冰 梁志超 阚飙 陈丽娟 王全意关键词:霍乱弧菌 药物敏感试验 毒力基因 脉冲场凝胶电泳