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HIV-1 Tat与P-TEFb复合物的分子动力学模拟及结合自由能计算被引量：1: 2011年; P-TEFb结构中与Tat蛋白的结合位点是新型抗HIV-1药物设计和虚拟筛选的重要靶标.对含有两个锌指结构的Tat.P-TEFb复合物体系进行了14ns的分子动力学模拟,应用MM-PBSA/GBSA方法计算体系的结合自由能,以及通过基于氨基酸残基的能量分解来探究体系中蛋白质之间的相互作用.结果表明范德华作用能是复合物形成的主要驱动力,Cys261与ZN88之间的配位作用是结合自由能的最大贡献者.根据Tat.P-TEFb体系的动力学结构信息和残基能量分解结果预测了P-TEFb结构中可能的活性位点.位点Ⅰ和位点Ⅱ应可作为基于受体三维结构的抗HIV-1药物分子设计的起始位点.模拟计算的结果可以为进一步指导药物设计奠定基础.; 张寅晖张瑞生胡荣静袁永娜; 关键词：P-TEFB

分子模拟在抗HIV-1和H5N1病毒新药发现中的应用研究: 艾滋病和禽流感在全球范围内广泛传播,是当今社会两种危害人类生命健康的重大疾病。虽然目前已有一些抗HIV-1或禽流感病毒的药物问世,但是由于药物的毒副作用和病毒抗药性等问题,研发新型、高效的抗病毒药物成为亟待解决的问题。 ...; 张寅晖; 关键词：H5N1 P-TEFB FLAVOPIRIDOL; 文献传递

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张寅晖