孙铁东
- 作品数:4 被引量:4H指数:1
- 供职机构:吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学理学更多>>
- 分子模拟研究电场对人I型电压依赖阴离子选择性通道的影响
- 孙铁东
- 关键词:分子动力学模拟膜蛋白
- 分子动力学模拟极端嗜热核糖结合蛋白的热力学稳定性被引量:1
- 2012年
- 采用分子动力学模拟方法研究极端嗜热性核糖结合蛋白(tteRBP)的嗜热机理.在常温(300 K)和最佳活性温度(375 K)时,分别对tteRBP分子进行动力学模拟,结果表明,整体分子均保持结构稳定,但分子内部的协调运动不同.在375 K时蛋白整体柔性显著提高,使分子能够局部调整构象以适应极端高温.蛋白结构变化的分析也确认了高温时构象局部微调对蛋白极端高温稳定性的关键作用.
- 冯献礼赵熹于辉王乙博孙铁东黄旭日
- 关键词:RIBOSEBINDING
- 分子模拟研究电场对人Ⅰ型电压依赖阴离子选择性通道的影响
- 在生命科学领域中,蛋白质的结构与功能的关系是一个基础而重要的问题。我们对于蛋白质结构和功能的认识是随物理、化学理论的进步而逐渐深入的。现代观点认为,蛋白质分子的结构和构象是动态的,而这种特性对于其发挥生理功能是必须的。蛋...
- 孙铁东
- 关键词:分子动力学模拟膜蛋白
- 文献传递
- 采用分子动力学模拟方法评价人类VDAC通道蛋白晶体结构的生物活性被引量:3
- 2011年
- 为研究电压依赖阴离子选择性通道(VDAC)分子的调控机制,在有无电场存在情况下,对Ⅰ型人类VDAC分子(hVDAC1)分别进行了分子动力学模拟研究.结果表明,外加电场的有无与方向变化对hVDAC1分子的运动模式和离子通过过程影响不明显,hVDAC1分子仍然保持以N端α螺旋在β桶内横向运动为主的运动模式.综合模拟结果和相关的实验结果,推测hVDAC1晶体结构不是其发挥生理功能的结构状态.
- 孙铁东赵熹黄旭日
- 关键词:通透性分子动力学模拟