吴松峰
- 作品数：4 被引量：10H指数：1
- 供职机构：军事医学科学院放射与辐射医学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家杰出青年科学基金北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生建筑科学更多>>
- 河南HIV感染者的HIV-1 B型株tat基因的克隆及序列分析
- 2005年
- 克隆河南人免疫缺陷病毒(HIV)感染者HIV-1B型株tat基因完整编码框序列,并分析比较其编码产物的序列结构特点。使用重叠PCR技术,从河南省1名HIV-1感染者外周血标本中扩增出tat基因第一和第二外显子并重组为完整的tat基因序列。获得的HIV-1B病毒株tat基因,第一外显子为263bp,第二外显子为214bp。将该基因编码产物与其他HIV-1株Tat蛋白经DNA软件编辑并翻译成蛋白质,使用ClustalX1.81进行多序列对比分析发现,第一外显子编码产物的3个保守区域的氨基酸组成大致相同,只有少数氨基酸存在差异。由于Tat蛋白不同病毒株间有高度保守的Cys富集区、核心区和碱性氨基酸富集区,tat基因的克隆为研究其功能并以其为靶点设计和筛选抗艾滋病的药物奠定了基础。
- 孙薏徐勤枝李敬云隋建丽李韩平吴松峰周平坤
- 关键词：HIV-1第二外显子TAT蛋白碱性氨基酸富集区
- 人胎肝转录组及新基因的规模发掘与功能研究
- 贺福初张成岗鱼咏涛瞿祥虎魏汉东马晓芸翟芸周钢桥邢桂春刘晓勤王茫桔吴松峰
- 该研究采用DNA序列自动分析技术、计算机技术并借助互联网和公共生物学数据库，在国际上首次系统地建立了胎肝转录组，并开展了与肝脏相关组织与细胞、造血组织与细胞基因表达谱的比较研究，其中已知基因的1660种，功能涉及15类，...
- 关键词：
- 基于PC/Linux的核酸序列电子延伸系统的构建及其应用被引量：10
- 2002年
- 新基因全长cDNA序列的获得常常是分子生物学工作者面临的难题。人类基因组计划及其相关计划的实施导致了大量表达序列标签 (EST)的产生。利用一定的生物信息学算法 ,这些EST序列往往可用来对新基因片段进行延伸。采用Linux操作系统 ,利用Blast软件和Phrap软件以及EST数据库在微机上构建了EST序列的电子延伸系统 ,并对来自于人胎肝的 11386条EST序列和 5 11条插入片段全长cDNA序列进行了电子延伸 ,结果显示8373条EST序列和 389条插入片段全长cDNA序列得到了程度不等的延伸 ,部分结果通过RACE实验得到证实。该套系统可高效地、规模化进行EST序列的延伸 ,可为通过实验获得新基因全长cDNA序列提供重要线索。
- 张成岗孙焕东欧阳曙光吴松峰贺福初
- 关键词：生物信息学表达序列标签CDNA微机核酸序列
- 新型人阳离子抗菌蛋白18的构建及其表达
- 2006年
- 目的:构建新型人阳离子抗菌蛋白18(NHCAP18)的氨基酸序列,合成其编码基因并在原核细胞表达。方法:设计NHCAP18氨基酸序列,经生物信息学分析后,合成其编码基因,将该基因插入表达载体pGEX-4T-1,尔后在大肠杆菌BL21中经IPTG诱导表达。结果:NHCAP18经生物信息学分析符合改造要求,构建的重组表达质粒pGEX-4T-1/NHCAP18在大肠杆菌BL21中经IPTG诱导4 h表达量约占菌体总蛋白量的39%,NHCAP18经谷胱甘肽-Sepharose 4B亲合层析纯化后对大肠杆菌有杀灭作用。结论:NHCAP18的成功改造,重组蛋白pGEX-4T-1/HCAP18在大肠杆菌BL21中高效表达及纯化,为研究NHCAP18功能打下了良好的基础。
- 王水明彭瑞云高亚兵吴松峰金华胡文化贾永峰王德文
- 关键词：抗生素类生物信息学氨基酸序列基因表达大肠杆菌
