陈玲玲
- 作品数：13 被引量：3H指数：1
- 供职机构：华中农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学自动化与计算机技术文化科学更多>>
- The comprehensive transcriptome and genome annotation of Bacillus licheniformis WX-02
- Background: Bacillus licheniformis WX-02 (B.licheniformis WX-02) is a gram-positive bacterium that has been us...
- 郭静陈守文陈玲玲程刚缑相勇邢锋李森韩以超王泷宋佳明舒成城
- 关键词：TRANSCRIPTOMEDIFFERENTIALLYEXPRESSED
- 一种含硒元素的浸种剂及其在提高植物抗盐胁迫中的应用
- 本发明涉及植物栽培技术领域，公开了一种含硒元素的浸种剂，所述浸种剂包括硒元素掺杂的碳量子点纳米拟酶，所述硒元素掺杂的碳量子点纳米拟酶的制备方法包括以下步骤：将硒代胱胺盐酸盐与间苯二胺在超纯水中混合，在无氧条件下120~2...
- 吴洪洪李召虎付程程闫嘉森顾江江陈玲玲戚杰姚雪李家其
- 生物信息学跨学科研究生培养模式探索与实践被引量：1
- 2013年
- 生物信息学是典型的交叉学科,华中农业大学生物信息学团队在研究社会对生物信息学人才质量要求的基础上,追踪调查生物信患学研究生培养情况,通过灵活招生、分层次指导、营造学术氛围、提高科研能力等一系列措施,形成了一套具有农业高校特色的生物信息学跨学科研究生培养体系。
- 祁婧张红雨陈玲玲唐广燕李金山陈春芬
- 关键词：生物信息学跨学科
- 一种筛选疾病药物靶标和靶标组合的方法及系统
- 本发明公开一种筛选疾病药物靶标和药物靶标组合的方法及系统，该方法包括：根据蛋白质在疾病细胞系与正常组织间的差异表达数据构建自动编码器；根据所述自动编码器计算基因的敲除效应，构建敲除网络；根据所述敲除网络预测疾病相关蛋白质...
- 陈玲玲常继伟丁毓端高俊祥
- 文献传递
- 酵母和大肠杆菌基因表达谱与蛋白质相互作用的相关性分析
- 2011年
- 为了研究酵母和大肠杆菌基因表达谱与蛋白质相互作用的关系,构建了蛋白质相互作用正负样本集.结合基于Pearson相关系数的共表达基因,分析了在受到外界刺激后,生物体内有相互作用的蛋白对与非相互作用的蛋白对之间的关系.结果显示,大肠杆菌和酵母在应激反应之后至恢复稳态的时间内,有相互作用的蛋白对与非相互作用的蛋白对之间的变化存在显著差异,对比发现非相互作用的蛋白对的基因表达谱具有较高的变化幅度.进一步分析了两物种的基因共表达网络,并阐述了作用机理.
- 张琳常继伟陈玲玲
- 关键词：基因共表达蛋白质相互作用
- 生物氧化还原反应的计算生物学与计算化学研究
- 张红雨纪洪芳申亮陈玲玲孔德信马彬广
- 1)课题来源与背景：该研究团队长期从事生物分子氧化还原反应的理论研究，先后获得四项国家自然科学基金的资助。2)研究目的与意义：氧化还原是生物分子进行的最基本反应之一。生命的正常活动在很大程度上依赖于氧化还原反应，氧化还原...
- 关键词：
- 关键词：计算生物学地球化学演化
- 一种筛选疾病药物靶标和靶标组合的方法及系统
- 本发明公开一种筛选疾病药物靶标和药物靶标组合的方法及系统，该方法包括：根据蛋白质在疾病细胞系与正常组织间的差异表达数据构建自动编码器；根据所述自动编码器计算基因的敲除效应，构建敲除网络；根据所述敲除网络预测疾病相关蛋白质...
- 陈玲玲常继伟丁毓端高俊祥
- 文献传递
- 软腐欧文氏菌代谢网络重构及其在靶标筛选中的应用被引量：1
- 2012年
- 欧文氏杆菌(Erwinia)是一类重要的农作物致病细菌,侵染宿主范围广,在世界范围内造成了严重的经济损失,其中Erwinia carotovora subsp. atroseptica SCRI1043 (Eca SCRI1043) 可导致马铃薯感染黑胫软腐病,危害极大。本文构建了Eca SCRI1043基因组的代谢网络,并进行拓扑结构和流平衡分析,以此筛选出网络的中心节点。若中心节点所代表的酶收录在TTD数据库中,则此酶可作为农用杀菌剂的候选靶标。随后选取靶标十一异戊二烯焦磷酸酶(Upps),采用specs公司的商品化合物数据库作为小分子数据库,对靶标进行高通量虚拟筛选,对综合打分结果最好的前400个化合物进行目筛后得到73种先导化合物,这73种先导化合物可以进一步进行后续生测实验以确定其杀菌活性。
- 王君王成孔德信陈玲玲
- 关键词：同源模建
- 蛋白质三级拓扑结构对热稳定性贡献的初步探讨被引量：1
- 2009年
- 搜集来自数据库和文献的127个已测定熔解温度和PDB结构的热稳定蛋白,计算了每个蛋白PDB结构的9种拓扑参数,并对各个参数与其自身熔解温度做了线性相关性分析。现有数据结果表明只有CC这个参数与Tm的相关性系数达到了0.33。CC参数表征蛋白结构作为天然接触的网络来处理时的簇系数,因此这一关系表明组成蛋白的基团接触的越紧密,蛋白的热稳定性就越高,这与之前的研究结论相一致。而其它的参数没有发现与Tm有显著的关系。作者从拓扑结构这个方面进行研究为蛋白质的热适应机理研究提供了新的思路。
- 王霁张士璀陈玲玲
- 关键词：蛋白质热稳定性
- 一种基于存在/缺失变异的泛基因组构建方法
- 本发明提供了一种基于存在/缺失变异的泛基因组构建方法，涉及泛基因组构建技术领域。本发明所述构建方法，输入非常简单，只需要一个个体的基因组以及相应的注释文件作为参考基因组，其他个体的基因组和注释文件作为查询(query)基...
- 陈玲玲朱玺桐穆罕默德·塔希尔·乌尔·卡马尔邢锋
- 文献传递
