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陈格飞: 作品数：16 被引量：15H指数：3; 供职机构：东华大学生物科学与技术研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家教育部博士点基金更多>>; 相关领域：生物学一般工业技术更多>>

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次壶腹腺丝蛋白功能模块的研究被引量：3: 2014年; 蜘蛛丝是天然的生物材料,具有潜在的巨大应用价值。研究蜘蛛丝蛋白质的结构与功能,有助于破解蜘蛛丝蛋白质的成丝机理,为制备优良材料学性能的仿生蜘蛛丝纤维提供理论依据。以MiSp蜘蛛丝的重复区和C端非重复区蛋白多肽为研究对象,在不同pH值和离子条件下,在体外研究其二级结构与成丝的关系。CD图谱显示:表达纯化的重组蜘蛛丝蛋白R1R2在pH 7.5、6.5和5.5时二级结构相似,均为无规则卷曲,而R1R2CT则主要呈现为α螺旋构象;扫描电镜结果表明:在以上3种pH条件下,只有pH 5.5时R1R2和R1R2CT才形成重组丝纤维,R1R2CT纤维形态较平整,类似于天然蛛丝纤维形态,而R1R2丝纤维则呈条带状,表面粗糙。另外,氯化钠不利于形成形态平整的丝纤维。该成果为研究蛛丝蛋白的成丝机理奠定基础,也为制备仿生蛛丝蛋白纤维提供理论依据。; 贾小娜陈格飞孟清; 关键词：Α螺旋纤维

大腹园蛛鞭状腺蛛丝蛋白N端结构域的克隆表达及圆二色谱分析被引量：1: 2017年; 鞭状腺蛛丝是6种蛛丝中延展性最好的丝,由鞭状腺蛛丝蛋白(FlSp)构成,具有极大的潜在应用价值。目前,有关FlSp的末端功能模块(NT和CT)编码基因的报道极少,且其结构和功能均尚未明确,这在一定程度上限制了鞭状腺蛛丝的仿生。现利用5′-RACE的方法,以大腹园蛛总RNA和基因组DNA为模板,首次获取了大腹园蛛FlSp NT模块(FlSp_A.v-NT)的完整编码基因,并对其成功进行了克隆、表达及纯化,产量可达60 mg/L;同时,利用圆二色谱(circular dichroism,CD)对FlSp_A.v-NT的二级结构进行了分析,结果显示其主要以α螺旋构象存在,这是首次对FlSp NT的二级结构进行探索,为后续FlSp NT结构功能的研究提供了材料,奠定了研究基础。; 李雪陈格飞张晓玲孟清; 关键词：大腹园蛛蛛丝蛋白克隆表达

大腹圆蛛Fosmid文库的构建及MaSp基因筛选方法的探讨被引量：3: 2010年; 介绍了构建大腹圆蛛Fosmid基因组文库及牵引丝蛋白(MaSp)基因克隆筛选的全过程.采用改良CTAB法提取大片段基因组DNA,通过自主构建的电洗脱核酸回收装置分离回收30～40kbDNA片段,经补平磷酸化、与pCC2FOS载体连接、体外包装和转染EPI300TM-T1R,首次构建了无偏向性的大腹圆蛛Fosmid文库,其滴度为4.5×105cfu/mL,覆盖基因组倍数为10.以α-32P标记寡核苷酸探针对文库进行初步筛选,获得含MaSp基因的12个阳性克隆.该文库符合Fosmid文库的品质要求,为进一步筛选并研究大腹圆蛛MaSp基因序列奠定了基础.; 张云龙陈格飞陈国亮林森珠张蒙恩孟清; 关键词：大腹圆蛛 FOSMID文库

DNA展示系统介导的断裂蛋白质内含子体外定向进化方法的研究: 2016年; 蛋白质内含子对于外显子的选择性限制了它的应用范围。目前,已经建立的卡那霉素定向进化系统适用于微小蛋白质内含子,但不适用于断裂蛋白质内含子。为了研究适用于断裂蛋白质内含子的定向进化的方法,我们引入了DNA展示系统。在该系统中,生物素化基因在人工细胞中与其表达的融合蛋白(内含子C端-外显子-生物素结合蛋白)形成DNA-蛋白质连接体。只有能与后续加入的N端蛋白质内含子前体(Flag-内含子N端)发生剪接反应的DNA-蛋白质连接体,才能被加上旗帜标签(Flag),从而被抗旗帜标签抗体纯化柱(Anti Flag antibody M2 agarose)筛选富集。为了验证该系统的可行性,实验构建了2个基因,即含有具剪接活性的蛋白质内含子的阳性基因IRC和含有不具剪接活性的蛋白质内含子的阴性基因IRCM。实验首先通过Western印迹和琼脂糖凝胶电泳证明,人工细胞中的体外转录翻译系统不仅可高表达500个氨基酸的蛋白质,而且表达的蛋白中内含子仍保持原有的剪接能力。生物素结合蛋白能结合95%的DNA,并且形成的DNA-蛋白质连接体可以被筛选富集,最终证明了该系统用于断裂蛋白质内含子定向进化筛选的可行性。随后,为了检测系统的富集效率,制备了人为的基因"突变库",即将基因IRC和IRCM以摩尔比1:10的比例混合,经过2轮筛选后,阳性基因IRC可以被10倍富集,进一步证明了体外筛选方法的可行性。该方法为后续针对不同宿主进化出不同的断裂蛋白质内含子提供筛选方法支持,也为断裂蛋白质内含子的在生物技术和研究领域的应用奠定了基础。; 林森珠陈格飞孟清; 关键词：体外定向进化

蜘蛛HMW-gDNA的电洗脱纯化提取被引量：3: 2009年; 该文研究了蜘蛛大分子量基因组DNA(HMW-gDNA)的提取以及一种高效电洗脱纯化装置的构建。以蜘蛛胸部肌肉组织为原料,通过自改良CTAB法提取蜘蛛HMW-gDNA,利用透析膜和2mL离心管构建一种新的HMW-gDNA快速凝胶回收装置,并对蜘蛛HMW-gDNA进行电洗脱分离回收。结果显示,改良CTAB法可高效提取蜘蛛HMW-gDNA(>48.5kb),且通过透析膜的截留作用,对普通琼脂糖凝胶中目的HMW-gDNA进行快速电洗脱分离,其回收率超过75%,OD260/OD280处于1.8～2.0之间,对HMW-gDNA完整性无影响。综合结果表明,改良CTAB法可用于蜘蛛HMW-gDNA的提取,此电洗脱纯化装置可从普通琼脂糖中高效回收HMW-gDNA,是一种低成本、简捷、高效且实用性强的凝胶回收方法。; 陈格飞张云龙林森珠李文孟清; 关键词：蜘蛛电洗脱

大腹园蛛主壶腹腺丝基因的筛选及序列分析被引量：1: 2015年; 为研究蛛丝蛋白编码基因和蛋白的组成结构模式、进化,并为蛛丝仿生提供更多的基因资源,运用3D/PCR(three-dimensional polymerase chain reaction)技术对大腹园蛛(A.ventricosus)Fosmid基因组文库进行主壶腹腺丝(MaSp1)编码基因的筛选,并对部分序列进行分析.通过筛选实验室前期构建的Fosmid文库获得含有MaSp1基因的阳性克隆Av11-19-5,通过shotgun测序得到MaSp1部分基因序列MaSp1RC.MaSp1RC长786bp,编码的262个氨基酸(AvMaSp1RC)可划分为保守的C端非重复区(CT)和重复区(Rep).Rep主要由poly-Ala,Glyx和GlyGlyx等模块组成,Ala和Gly含量占总氨基酸的78%;CT中参与形成离子键的氨基酸及helix 4上的疏水模块高度保守.研究结果为蛛丝蛋白二聚化及仿生学研究提供了更多的基因资源.; 张雪陈格飞孟清; 关键词：大腹园蛛

Euprosthenops australis牵引丝蛋白的原核表达被引量：1: 2013年; 参照GenBank收录的牵引丝蛋白编码序列,经过密码子优化,人工合成3段cDNA序列:NT、CT和4Rep,由Ⅰ型限制性内切酶BsaⅠ和BspMⅠ介导无缝拼接,分别构建4RepCT、NT4RepCT、NT8RepCT和NT12RepCT重组模块.通过改造表达载体和优化培养温度,成功提高了4RepCT的表达量(30 mg/L).另外还首次成功表达NT4RepCT和NT8RepCT重组蛋白模块,表达量分别为21 mg/L和8.5 mg/L.4RepCT表达量的提高及NT4RepCT和NT8RepCT的成功表达证实了融合标签TRX有利于提高蛛丝蛋白的表达水平,为E.australis全长牵引丝蛋白的表达奠定了基础.; 张秀丽陈格飞林瑛李佳孟清; 关键词：基因克隆融合蛋白原核表达

大腹园蛛次壶腹腺丝的表达被引量：3: 2013年; 基于大腹园蛛次壶腹腺丝Minor Ampullate Spidroin全长编码基因最新报道,研究了该基因的表达。利用PCR扩增该基因重复区一段长1 348 bp的片段P1,融合his-tag标签,构建酵母表达载体,在毕赤酵母菌GS115进行表达。同时构建大肠杆菌表达载体,在大肠杆菌BL21(DE3)中进行表达。SDS-PAGE和Western blotting检测结果表明,P1在两种表达系统中均可实现表达。研究结果显示:P1在GS115中的表达经优化后产量、产率有较大提高,且远高于BL21(DE3)中的表达,相应的纯化效率GS115也远高于对照BL21(DE3)的表达。研究表明酵母表达系统更适合重复度高、且富含Gly/Ala的天然蛛丝蛋白基因的表达,为表达全长天然MiSp编码序列提供前期实验基础,也为大规模蛛丝蛋白的重组表达建立了平台。; 杨子江陈格飞孟清; 关键词：毕赤酵母表达系统大肠杆菌表达系统

蛛丝蛋白MiSp重组模块R1R2CT表达及其纤维化动力学研究被引量：1: 2015年; 为探索蛛丝蛋白模块单元在成丝过程中的作用,研究了大腹园蛛MiSpR1R2CT功能模块在不同pH条件下的纤维化动力学特性。大腹园蛛MiSp蛋白的R1R2CT功能模块与硫氧还蛋白融合,并在BL21（DE3）中进行表达,表达量约为15mg/LLB培养基。R1R2CT蛋白在pH7.5和6.5时较为稳定,在22h之内不发生纤维化;当pH值降至5.5时,R1R2CT在前2h内快速纤维化,3～5h趋势较为平缓;5h之后R1R2CT蛋白再次出现ThT信号的快速增长,7h后保持缓慢增长至22h。R1R2CT的增长速率及幅度高于单独的CT（C-termi-nal）蛋白,而单独的R1R2在pH7.5、6.5和5.5时均保持稳定,表明重复区依赖CT模块的快速纤维化模式。已有研究表明,CT在重复区纤维化过程中起晶核作用,该成果也从反面证实CT的晶核理论。; 王锋陈格飞孟清; 关键词：晶核

蛛丝蛋白MiSp全长基因克隆、表达及结构和功能研究: 圆网蜘蛛可分泌六种蛛丝蛋白纤维，分别在蜘蛛生命活动中扮演不同的角色。次壶腹腺丝(minor ampullate silk)主要用于构建蛛网核心框架和包裹猎物等，具有显著的机械性能和优异的生物亲和性，加之在水环境中不会发生...; 陈格飞; 关键词：大腹园蛛蛋白结构仿生制备

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