邱永雄
- 作品数：1 被引量：7H指数：1
- 供职机构：华南农业大学农学院广东省植物分子育种重点实验室更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”番禺区科技计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 细菌聚类新方法:ddT聚类技术分析香根草联合固氮菌多样性被引量：7
- 2010年
- 利用高分辨率的聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,采用新型遗传分析仪Li-COR 4300L,结合测序的双脱氧链终止法原理,建立了基于16S rDNA序列T碱基分布特征的一种新的细菌多样性聚类技术——ddT聚类技术.应用该新的ddT聚类技术对分离自香根草的47株联合固氮菌多样性进行了聚类分析,获得了6个不同的主要类群,表明香根草联合固氮菌具有较大的遗传资源多样性.应用SDS-PAGE全细胞蛋白质电泳和DNA指纹图谱方法对该聚类结果进行验证,结果表明,该新聚类技术可以应用于细菌的多样性聚类分析.16SrDNA序列测定和系统发育分析表明,供试的联合固氮菌分别与γ-变形杆菌纲(γ-proteobacteria)的阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae),Enterobacter ludwigii,Pantoeaan anatis,恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida),荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)和β-变形杆菌(β-proteobacteria)的中型假食酸菌(Pseudaci-dovorax intermedius),Mitsuaria chitosanitabida,越南伯克氏菌(Burkholderia vietnamiensis),佛莱辛草螺菌(Herbaspirillum frisingense)亲缘关系相近,其中肠杆菌属、伯克氏菌属和泛菌属是香根草联合固氮菌的优势类群,分别占分离菌株总数的45%,19%和13%,它们一起构成了分离菌株总数的77%.
- 赵现伟彭桂香张志英邱永雄张泽民张桂权谭志远
- 关键词：SDS-PAGEDNA指纹图谱香根草联合固氮菌
