赵喜全
- 作品数：2 被引量：6H指数：1
- 供职机构：中国科学院计算技术研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- KSI：面向TB级别的DNA序列匹配软件库被引量：1
- 2015年
- 为了满足对不同物种进行DNA序列分析的需求和适应DNA序列数据的快速增长,针对目前DNA序列分析软件大都各自实现一套序列存储和查询功能,工作重复且没有考虑并行性、扩展性和分布式系统或环境的缺陷,基于DNA序列分析的基本操作k-mer匹配,设计并实现了一个面向TB量级的DNA序列匹配软件库——k-mer查找接口(KSI)。KSI提供了一套分布式环境下的编程接口,并且针对生物计算领域的DNA序列匹配进行优化。实验显示,KSI为DNA序列匹配提供了一个高效的解决方案。
- 赵喜全李旭吕慧伟谭光明
- 关键词：生物信息学应用程序编程接口
- 基于FPGA的TOE网卡设计与实现被引量：5
- 2011年
- 为进一步减轻CPU的负担,有效增加系统性能,描述一种基于FPGA的TCP减负引擎系统的设计与实现。该TOE网卡将部分TCP协议软件处理下移到FPGA中实现,以硬件的方法实现报文分类和TCP流还原等流量处理功能。实验数据表明,使用TOE网卡可以大幅降低主机的CPU占用率。
- 赵喜全刘兴奎邵宗有刘朝辉窦晓光赵晓芳
- 关键词：硬件加速现场可编程门阵列
