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董梦秋
作品数:
12
被引量:15
H指数:1
供职机构:
中国科学院计算技术研究所
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发文基金:
国家重点基础研究发展计划
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
自动化与计算机技术
医药卫生
生物学
理学
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合作作者
迟浩
中国科学院计算技术研究所
贺思敏
中国科学院计算技术研究所
孙瑞祥
中国科学院计算技术研究所
樊盛博
中国科学院计算技术研究所
刘超
中国科学院计算技术研究所
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机构
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中国科学院
作者
12篇
孙瑞祥
12篇
董梦秋
12篇
贺思敏
12篇
迟浩
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刘超
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樊盛博
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宋春青
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1篇
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一种检测差异表达蛋白质的方法
本发明涉及一种检测差异表达蛋白质的方法,面向定量蛋白质组学中的基于一级谱图信息的标记和非标记的相对定量数据分析,包括肽谱匹配、可信度评价、肽段信号提取、肽段比值计算、蛋白质比值计算、统计学分析,根据某蛋白质在两种或多种样...
刘超
宋春青
迟浩
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法
本发明提供一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法,包括:1)分别对每个谱图进行单谱匹配和排序,得到对应的最优的交联二肽单谱匹配结果;提取当前每一个肽谱匹配结果的多谱匹配特征向量,其中包括SVM分数、母离子误差比例特征和...
尹吉澧
孟佳明
刘超
迟浩
陈镇霖
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
文献传递
交联蛋白鉴定软件pLink
交联质谱技术将质谱技术与交联技术相结合,为研究蛋白质的三维结构与蛋白质间的相互作用提供了新的技术手段。本课题组在前人工作的基础上研发了应用于化学交联技术的二肽交联鉴定软件系统pLink[1],并于2012年发表于Natu...
尹吉澧
孟佳明
樊盛博
迟浩
刘超
杨皓
胡蓝青
贺思敏
孙瑞祥
董梦秋
关键词:
蛋白质组学
蛋白质鉴定
质谱
文献传递
一种对多肽交联肽段进行质谱鉴定的假发现率控制方法
本发明提供一种对多肽交联肽段进行质谱鉴定的假发现率控制方法,包括:1)对于每张谱图,基于肽段匹配模型,在存储了单条肽段结构的数据库中进行搜索,得出匹配的n肽交联的鉴定结果;数据库既包括真实肽段结构也包括诱饵肽段结构;2)...
樊盛博
迟浩
孟佳明
卢珊
尹吉澧
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
文献传递
一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法
本发明提供一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法,包括:1)分别对每个谱图进行单谱匹配和排序,得到对应的最优的交联二肽单谱匹配结果;提取当前每一个肽谱匹配结果的多谱匹配特征向量,其中包括SVM分数、母离子误差比例特征和...
尹吉澧
孟佳明
刘超
迟浩
陈镇霖
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
一种交联二肽快速鉴定方法
本发明提供一种交联二肽快速鉴定方法,包括:1)提取待鉴定串联谱图中的有效谱峰,根据各个有效谱峰对应的质量,查找碎片索引得到相应的肽段序列作为候选α肽序列,其中所述碎片索引记录了各个碎片质量及其对应的肽段序列;2)对于每个...
孟佳明
樊盛博
迟浩
卢珊
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
一种检测差异表达蛋白质的方法
本发明涉及一种检测差异表达蛋白质的方法,面向定量蛋白质组学中的基于一级谱图信息的标记和非标记的相对定量数据分析,包括肽谱匹配、可信度评价、肽段信号提取、肽段比值计算、蛋白质比值计算、统计学分析,根据某蛋白质在两种或多种样...
刘超
宋春青
迟浩
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
文献传递
一种交联二肽快速鉴定方法
本发明提供一种交联二肽快速鉴定方法,包括:1)提取待鉴定串联谱图中的有效谱峰,根据各个有效谱峰对应的质量,查找碎片索引得到相应的肽段序列作为候选α肽序列,其中所述碎片索引记录了各个碎片质量及其对应的肽段序列;2)对于每个...
孟佳明
樊盛博
迟浩
卢珊
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
文献传递
电子转运裂解质谱预处理与鉴定方法
本发明提供一种电子转运裂解质谱预处理方法,包括:计算母离子的质荷比和电荷状态;计算母离子峰及其同位素峰在电子转运裂解质谱中可能出现的区域;计算母离子的系列衍生峰在电子转运裂解质谱中可能出现的区域;计算母离子的中性丢失峰在...
孙瑞祥
董梦秋
宋春青
迟浩
杨兵
王乐珩
付岩
贺思敏
文献传递
电子转运裂解质谱预处理与鉴定方法
本发明提供一种电子转运裂解质谱预处理方法,包括:计算母离子的质荷比和电荷状态;计算母离子峰及其同位素峰在电子转运裂解质谱中可能出现的区域;计算母离子的系列衍生峰在电子转运裂解质谱中可能出现的区域;计算母离子的中性丢失峰在...
孙瑞祥
董梦秋
宋春青
迟浩
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