荣利
- 作品数：3 被引量：55H指数：3
- 供职机构：生物芯片北京国家工程研究中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家教育振兴行动计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 应用基因芯片分析结核分枝杆菌常见耐药基因型的研究被引量：36
- 2006年
- 目的应用基因芯片快速检测结核分枝杆菌耐药基因型,建立一种新的分子药敏试验方法。方法以传统药敏试验和PCR-直接测序方法为对照,应用基因芯片快速检测157株结核分枝杆菌临床分离株异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB)耐药基因(katGr、poB、rp-sLr、rs和embB)的带荧光素标记的PCR产物。结果PCR-直接测序和基因芯片检测36株结核分枝杆菌药物敏感株的5种耐药基因均为野生型。121株结核分枝杆菌耐药分离株中,56株耐INH分离株,katG基因突变率为62.5%,其中katG缺失率为7.5%,315位密码子突变率为55.4%,279位密码子突变率为1.8%;104株耐RFP株,rpoB基因突变率为94.2%,最常见的突变位点为531位和526位密码子(突变率分别为60.6%、15.4%),双位点突变率为5.8%,还发现511、513、515、516、517、518和533位密码子突变;62株耐SM分离株,rpsL和rrs总突变率为88.7%(两者分别为82.3%、6.5%),rpsL突变位于43位和88位密码子(突变率分别为77.4%、4.8%),rrs突变位于513位和516位碱基(突变分别为4.8%、1.6%);57株为耐EMB株,embB基因突变率为61.4%,均为306位密码子突变,最常见的突变为ATG→GTG或ATA(突变率分别为35.1%、15.8%),还发现306位密码子ATG→ATC、ATT和CTG突变。通过基因芯片检出的突变与基因测序结果一致。结论应用基因芯片可分析大多数结核分枝杆菌耐药基因型,弥补传统药敏试验方法的不足,指导临床治疗。
- 吴雪琼张琼张俊仙梁建琴鲁红丽李洪敏张洪恩陆阳荣利吕翠环张广宇邢婉丽
- 关键词：基因芯片耐药基因型聚合酶链反应分枝杆菌结核
- SARS冠状病毒基因芯片的制作与初步临床样本验证被引量：16
- 2003年
- 为了实现对非典(SARS)冠状病毒感染患者的早期诊断,构建了一套以基因芯片为基础的SARS冠状病毒基因分析检测系统。首先从患者痰、血样本中快速分离出SARS冠状病毒的RNA,然后通过巢式RT-PCR对分离的RNA进行扩增获得特定的DNA片段,最后让固定在基因芯片上的DNA探针与扩增产物进行杂交以检验扩增产物的序列匹配性,达到最终确认SARS冠状病毒感染患者的目的。对首期两例患者痰样本和两例全血样本的分析结果表明,这4例患者样本中均存在SARS冠状病毒。
- 陶生策杨仁全李泽张治位周一鸣张琼朱沛轩杜建宇赵传赞马清梅任丽丽王璨蒋迪刘彦华杨华卫荣利安爽李喆王健伟程云刘欧郑重左焕琮闪全忠阮力吕占秀洪涛程京
- 关键词：SARS冠状病毒基因芯片
- 用DNA芯片检测结核分枝杆菌耐利福平基因突变的初步研究被引量：3
- 2005年
- 目的研制一种新型DNA芯片,用于快速检测结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因突变。方法根据结核分枝杆菌rpoB基因序列设计探针并制作DNA芯片,PCR掺入法荧光标记根据结核分枝杆菌rpoB基因突变热点的目的片断,与DNA芯片杂交,同时以DNA测序法为对照。结果18株结核分枝杆菌临床分离株中,1株敏感株DNA芯片杂交结果与标准株完全相同;17株耐RFP临床分离株中有17株检测到rpoB基因突变,其中14株单位点突变,1株511和516位双位点突变,与测序结果完全一致。另有两株为517和518、526和517位双位点突变,因为芯片上未点517位突变的探针,所以只检测到518和526位的突变,该突变与测序结果完全一致。结论用DNA芯片可快速、特异地检测出大多数结核分枝杆菌耐利福平分离株的rpoB基因突变,可用于临床耐药性的检测,指导临床用药。
- 张俊仙吴雪琼张琼荣利梁建琴李洪敏陆阳张亮
- 关键词：DNA芯片RPOB基因利福平结核分枝杆菌RPOB基因突变临床分离株
