程良红
- 作品数：82 被引量：416H指数：13
- 供职机构：深圳市血液中心更多>>
- 发文基金：深圳市科技计划项目广东省医学科学技术研究基金广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学政治法律化学工程更多>>
- A_3等位基因的分子遗传分析被引量：9
- 2005年
- 为了研究血型血清学鉴定为A3型的 4例样本 ,其中 2例样本为一个家系 ,用血清学方法检定其 3例为A3型 ,1例为A3B型 ,通过PCR SSP与测序分析其Exon 6与Exon 7及部分内含子 ,与A10 1等位基因参比序列进行了比较。结果发现在 2例A3型样本中单倍体分别为常见的A10 2等位基因与O1- 2等位基因 ,1例A3样本中单倍体分别为常见的A10 2等位基因与少见的O1V - 4等位基因 ,1例A3B样本在A基因中发现 838C→T(Leu2 80Phe) ,此研究结果提示血清学表现为A3型的分子遗传背景存在多态性 ,A3B型的 838C→T可能是A3低转移酶活性的分子基础。
- 喻琼梁延连邓志辉吴国光苏宇清张旋程良红
- 关键词：分子遗传学分析
- 人类白细胞抗原及单倍型与中国北方汉族急性非淋巴细胞白血病相关性研究被引量：2
- 2009年
- 急性非淋巴细胞白血病（AML）是我国白血病分类构成中最常见的一类，其疾病的发生、发展机制目前尚不十分清晰，可能与遗传因素、外界环境因素和自身免疫因素等有关。人类白细胞抗原（HLA）与肿瘤的免疫监视作用密切相关，H／A与白血病相关性研究国内外文献均有报道，但结论不一。
- 高素青程良红卢亮金士正王大明程曦邹红岩邓志辉
- 关键词：急性非淋巴细胞白血病人类白细胞抗原中国北方汉族单倍型自身免疫因素免疫监视
- 人类白细胞抗原A座位内含子全长序列分析
- 2011年
- 目的对中国部分汉族人群人类白细胞抗原（humanleukocyteantigen，HLA）A座位常见等位基因的内含子进行全长序列研究。方法从“中国造血干细胞捐献者资料库广东分库”中抽取165份样本，用美国Gentra公司的试剂盒快速提取全血DNA。自行设计引物，特异性扩增HL艮A座位的目的3kb片段，共涵盖8个外显子和7个内含子。凝胶电泳回收目标条带，连接于T载体，E．coliDH5a转化，挑选阳性克隆正反向测序。采用MEGA4．0软件进行分析，并用ClustalW比对序列，相邻连接法构建进化树。其中距离矩阵通过p-distance计算，采用自举法评价这些树的准确性，重复取样部分数据1000次。结果共获得33个HLA—A等位基因全长序列，长度为2902～2918bp。7个内含子共发现138个点突变以及9个插入或缺失，具有明显的组特异性。第1内含子的多态性、GC含量和平均遗传距离D值最高。根据全长及第1～7内含子序列分别构建进化树。其中，以全长序列构建的进化树将HLA_A基因分为5组：I组包括A＊0I／03／11／30；1I组包括A＊23／24（A9）；III组包括A＊02／68／69（A2／28）；IV组包括A＊26／34（A10）；V组包括A＊29／31／32／33／74（A19）。其中I～Ⅱ组属于同一世系，Ⅲ～V组属于另一世系。用7个内含子序列构建的进化树在结构上有小的差异，较为特殊的是Ⅱ组和A＊30。Ⅱ组的第2～5内含子与I组处于同一世系，而第1和7内含子却处于相对立的另一世系。A＊30与A＊03家族的关系最近，而与A19家族较远。结论18个等位基因全长序列填补了GenBank数据库的空白，并得到了免疫基因标记数据库的确认。HLA—A等位基因的内含子多态性具有显著的组特异性，并对基因的重组具有重要意义。A＊30可能是一个具有高突变率和高重组率的特殊组系。
- 李桢程良红邹红岩金士正
- 关键词：人类白细胞抗原内含子多态性进化树
- 应用完整外显子2/3序列解决HLA-DRB1座位基因分型的歧义结果被引量：1
- 2011年
- 背景:人类白细胞抗原基因测序分型中,当等位基因的差异碱基位于测序范围之外或不同等位基因对的杂合序列相同时,无法得到清晰的结果。目的:通过完整外显子2/3序列的测定,解决常规HLA-DRB1基因分型中的高比例歧义结果。方法:初次分型采用常规的测序方法检测320份样本的HLA-DRB1外显子2第一高变区以外的序列,测序反应设置codon86。后期采用一次性扩增外显子2/3,测序反应针对外显子2设置组特异性引物:DRB1*04/07/09为一组,其它基因家族为一组,设置conden86,对初次分型后为歧义结果的样本重新分型。结果与结论:初次分型有180份样本为歧义结果,占总样本数的56.25%。其中A类为差异碱基位于测序范围之外,共114例;B类为等位基因对的杂合序列相同,共17例;C类为两种情况同时存在,有49例。3种类别的歧义等位基因数分别为119个、34个、98个,占等位基因总数的33.06%、9.44%、27.22%。完整外显子2/3序列的测定使歧义结果比例从56.25%下降到14.37%,其中A类103例、B类8例、C类23例样本的等位基因得到确认。此次研究中发现了一个新等位基因,与跟它最相近的等位基因DRB1*110101相比,其外显子3的第381位碱基G>T,导致第98位氨基酸AAG(赖氨酸Lys)>AAT(天冬酰氨Asn)。序列已提交Genbank,编号HM807583,2010-08被世界卫生组织HLA因子命名委员会命名为HLA-DRB1*1197(编号HWS10010999)。提示,完整外显子2/3序列的测定能大幅降低歧义分型结果的比例。
- 李桢杨鹃程良红邹红岩
- 关键词：人类白细胞抗原外显子
- 短串联重复序列检测在异基因造血干细胞移植植入状态中的应用(英文)
- 2007年
- 背景:移植后造血干细胞植活的判断主要依赖于体内各种遗传标记,其在敏感性和有效性方面各不相同,故亟待建立一种鉴别力强、敏感性高、不受性别限制的检测方法。目的:观察异基因造血干细胞移植供受者移植前及受者移植后不同时间段的血样DNA短串联重复序列遗传位点检测情况。设计:观察测量实验。单位:深圳市血液中心输血医学研究所免疫遗传重点实验室。对象:选择2004-02/2005-12在深圳市血液中心输血医学研究所免疫遗传实验室配型成功并进行造血干细胞移植的18对供受者血样,18例患者中,男10例,女8例,平均35岁。接受血缘关系供者移植6例,无关供者移植12例。所有受试对象均对检测项目知情同意。方法:采用荧光标记复合扩增短串联重复序列(STR)检测技术,对18例进行造血干细胞移植的血液病患者移植后的系列血样及移植前供、受者的血样进行15个STR位点和1个性别位点的检测,找出供受者间的差异基因,观察移植后供者的STR基因在受者体内的植入情况及变化过程,找出最早检测到供者STR基因的时间及完全嵌合体最早出现的时间。主要观察指标:①观察移植前供受者差异基因。②供者STR基因及完全嵌合体最早出现时间。结果:供受者18对均进入结果分析。①供受者中能区分出彼此差别的平均STR差异位点数为12.4(8～15)个。②患者移植后最早可检测到供者STR基因的平均时间为8(5～14)d,由受者型向完全供者型转化的平均时间为14(9～23)d。植入状态由供受者嵌合型转为完全供者嵌合型。结论:荧光标记复合扩增STR检测方法可精确地描述异基因造血干细胞移植植入状态及其演变过程,可为临床提供一个准确、可靠的实验依据。
- 邹红岩李桢孙革李茜魏天莉程良红邓志辉
- 关键词：外周血干细胞移植嵌合体
- 中国人群HLA-DRB1*1454等位基因和HLA-DRB1第3外显子鉴定意义(英文)被引量：4
- 2009年
- 目的:在中国人群中鉴定人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)DRB1*1454等位基因,分析供受者HLA-DRB1第3外显子DNA序列信息对器官移植、细胞移植及人类遗传学研究的重要现实意义。方法:应用聚合酶链反应-直接测序分型方法对58例等待造血干细胞移植供受者进行人类白细胞抗原测序分型,1268例广东地区随机健康供者采用聚合酶链式反应-序列特异寡核苷酸探针反向杂交法进行HLA-DRB1中高分辨基因分型,部分模棱两可结果采用聚合酶链式反应-序列特异引物PCR-SSPHLA-DRB*14高分辨方法分型法。结果:在1268例广东地区随机健康人群中检出HLA-DRB1*1403,1406,1410,1412,1418,1425和1454等位基因,HLA-DRB*1401/1434/1454等位基因模棱两可结果的8例样本被确认为HLA-DRB1*1454等位基因,DRB1*1454等位基因可能是广东人群最为常见的HLA-DRB1*14基因。中国人群HLA-DRB1*14第3外显子存在多态性。结论:中国人群HLA-DRB1*1454等位基因确认了DRB1等位基因第3外显子多态性的存在,进一步明确了开展中国汉族人群及少数民族HLA-DRB1第3外显子检测的意义。
- 高素青程曦邹红岩程良红卢亮邓志辉
- 关键词：人类白细胞抗原DNA测序外显子
- DRB1＊1454：中国汉族人群人类白细胞抗原-DRB1＊14的常见等位基因被引量：4
- 2009年
- 目的研究中国南方和北方汉族人群人类白细胞抗原（human leukocyte antigens，HLA）-DRB1＊14组等位基因的分布并比较其分布差异。方法采用聚合酶链反应（polymerase chain reaction，PCR）-测序分型（sequence-based—typing，SBT）技术对从436名南方和713名北方汉族造血干细胞志愿捐献者进行HLA—DRB1分型，并采用高分辨PCR序列特异性引物（sequence specific primer，SSP）技术对其中的DRB1＊1401／1439／1454不确定的等位基因进行精确分型，同时对54名原检测结果为“DRB1＊1401”的临床移植配型标本进行再次分型。进而采用卡方检验方法对南北方汉族群体的DRB1＊14等位基因分布进行比较。结果81个DRB1＊1401／1439／1454不确定等位基因和54例原结果为“DRB1＊1401”的临床标本全部证实为DRB1＊1454。436名南方汉族人群中，可见6种DRB1＊14等位基因，其分布比例分别为DRB11454（69．57％），DRB1＊1402（1．45％），DRB1＊1403（1．45％），DRB1＊1404（4．35％），DRB1＊1405（20．29％），DRB1＊1407（2．90％）；713名北方汉族中，7种DRB1＊14等位基因的分布比例分别为DRB1＊1454（35．48％），DRB1＊1403（12．90％），DRB1＊1404（6．45％），DRB1＊1405（37．63％），DRB1＊1407（4．30％），DRB1＊1411（1．08％），DRB1＊1412（2．15％）。结论中国汉族人群中的主要等位基因是DRB1＊1454和DRB1＊1405，南北汉族间DRB1＊14等位基因的分布格局明显不同，DRB1＊1405在两个群体中的分布比例比较接近，而DRB1＊1454在南方汉族中的分布比例明显高于北方汉族。
- 程良红金士正邹红岩高素青李桢王大明
- 关键词：人类白细胞抗原中国汉族
- 广东汉族人群HLA单倍型遗传中基因重组的研究被引量：2
- 2010年
- 目的 分析广东汉族人群人类白细胞抗原（HLA）Ⅰ、Ⅱ经典5位点A、Cw、B、DRB1及DQB1的连锁单倍型及单倍型遗传中基因重组事件.方法 采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针（PCR-SSO）法及聚合酶链反应-序列特异性引物（PCR-SSP）法,分别对2000年8月至2009年12月深圳市血液中心进行HLA配型的198个广东汉族家系共939名个体的外周血样本进行HLA-A、B、DRB1位点及HLA-Cw、DQB1位点的低分辨基因分型,再通过遗传家系分析确定HLA基因重组相关位点 对其中发生基因交换重组的52名家系成员的样本进一步采用基因测序分型（SBT）技术进行序列分析,以判断重组交换是否发生在某基因座位上.结果 198个广东汉族家系543名子一代个体中,发现有9名个体HLA单倍型基因座位发生了交换重组,频率为1.657%.3例为A/Cw座位间的交换,6例为B/DRB1座位间的交换.其中4例重组事件发生在广东汉族人群最常见的单倍型A＊3303-Cw＊0302-B＊5801-DRB1＊0301-DQB1＊0201上.在9例重组事件中有5例来自母系染色体交换,4例来自父系染色体交换 3例表现为A/Cw座位间交换的个体均为女性,6例表现为B/DRB1座位间交换的个体中5例为男性、1例为女性.结论 HLA连锁单倍型遗传过程中的基因重组主要见于A/Cw座位间及B/DRB1座位间,且基因重组的发生具有单倍型特异性及性别特异性.
- 邹红岩金士正李桢高素青王大明徐筠娉何柳媚魏天莉程良红邓志辉
- 关键词：HLA抗原单倍型
- 中国南方汉族人群HLA-A、B、DRB1基因的序列分析和单体型分布被引量：19
- 2009年
- 目的分析中国南方汉族人群HLA-A、-B、-DRB1基因的序列多态性和单体型的分布情况。方法PCR-测序分型方法(sequence-based typing,SBT)对421名随机南方汉族个体的HLA-A、-B、-DRB1基因进行序列分析,进而采用最大似然性方法计算等位基因和单体型的分布频率。结果26个HLA-A等位基因中,频率>0.05的6种常见等位基因A*1101、A*2402、A*0207、A*0201、A*3303和A*0203的频率总和为78.15%;53个HLA-B等位基因中,频率>0.05的5种常见等位基因B*4001、B*4601、B*5801、B*1502和B*1301的频率总和为50.59%;36个HLA-DRB1等位基因中,频率>0.05的7种常见等位基因DRB1*0901、DRB1*1501、DRB1*1202、DRB1*0803、DRB1*1101、DRB1*0405和DRB1*0301的频率总和为60.21%。372条A-B、494条B-DRB1和1658条A-B-DRB1单体型中,分别有39、43和26条单体型,频率>0.005,其频率总和分别为66.07%、58.91%和34.30%,A*0207-B*4601、B*4601-DRB1*0901和A*0207-B*4601-DRB1*0901分别为其最主要单体型。结论获得了中国南方汉族人群HLA-A、-B、-DRB1基因的高分辨等位基因频率和单体型分布数据,进一步为人类学、法医学、移植配型和疾病相关研究提供了信息。
- 朱为刚鲍自谦蓝欲晓金士正李桢程曦王大明程良红邹红岩
- 关键词：等位基因人类白细胞抗原单体型PCR-SBT汉族
- 定期无偿献血者T细胞免疫功能的研究被引量：8
- 2010年
- 目的通过对定期无偿全血捐献者、定期无偿血小板捐献者2个特殊健康人群的T细胞数量以及细胞活化、细胞因子分泌功能的研究,评价定期献血对机体T细胞免疫功能的影响。方法采用流式细胞术对3组人群(定期无偿全血捐献者、定期无偿血小板捐献者、对照组)外周血中T细胞总数、CD4+T细胞群及CD8+T细胞群进行数量分析;分离外周血淋巴细胞体外培养,加丝裂原植物凝集素PHA刺激T细胞活化,流式细胞术检测CD4+CD25+活化T细胞群;Lum inex 100多功能液相分析平台检测细胞因子IL-2的分泌量。结果定期无偿全血捐献组及定期无偿血小板捐献组的T细胞总数及CD4+T细胞群、CD8+T细胞群的数量与对照组的差异无统计学意义(P>0.05);T细胞活化指标CD25+、CD69+均在培养d4(72h)表达最高;定期无偿捐献全血组CD4+CD25+活化T细胞以及IL-2分泌量与对照组的差异无统计学意义(P>0.05);定期无偿捐献血小板组CD4+CD25+活化T细胞以及IL-2的分泌量高于对照组(P<0.05)。结论机体通过强大的正负免疫调节,使定期献血者T细胞的数量和功能维持稳定状态。
- 李桢熊文唐斯程良红程曦
- 关键词：T细胞免疫功能流式细胞术细胞活化
