田然
- 作品数：5 被引量：5H指数：1
- 供职机构：北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金黑龙江省研究生创新科研项目国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：理学医药卫生化学工程更多>>
- 海绵中提取的异臭椿萜类化合物作用靶标的识别被引量：1
- 2011年
- 采取了包括化学结构相似性学习、靶标聚类分析以及反向对接筛选等多种方法在内的综合性策略,尝试对中国南海海绵中提取得到的异臭椿萜类化合物进行生物学活性和作用靶标的预测.结果表明:这类化合物具有治疗心肌缺血和抗肿瘤的潜在生物学活性;表皮细胞生长因子受体(EGFR),焦点(局部)粘着斑激酶(FAK),胰岛素样生长因子1受体(IGF1-R),c-Src激酶以及血管表皮生长因子受体2(VEGF-R2)是这类化合物可能的作用靶标.IC50值从0.41g·m-3(0.41μg·mL-1)到9.8g·m-3(9.8μg·mL-1)不等.活性数据显示这些海绵提取的海洋天然产物可作为先导化合物,通过进一步的优化获得新的药物.同时还讨论了化合物与预测靶标的结合模式,结果显示四个化合物都与相应的受体有较好的结合.
- 田然刘振明金宏威张亮仁林文翰
- 关键词：抗肿瘤活性
- 5-羟色胺1A受体配体发现新思路:基于受体的药效团(英文)被引量：1
- 2009年
- 5-HT1A是治疗焦虑症、抑郁症和疼痛等精神类疾病的重要靶点。近年来寻找5-HT1A受体配体以及相关药物的发现,一直是研究的热点。本文首先采用同源模建的方法构建了一个5-HT1A受体模型,并通过与MP349进行分子对接研究,得到了一个可靠的受体-配体结合模式。在此基础上,建立了一个基于受体的药效团模型,该药效团模型包含许多配体和受体相互作用的重要特征并在后续的虚拟筛选实验中验证了这个药效团模型检验真正的5-HT1A受体配体的能力。本研究结果可用于指导今后5-HT1A配体的合成改造以及新的先导化合物的发现。
- 杨志瑜吕炜田然金宏威曾慧慧
- 关键词：5-HT1A受体同源模建分子对接药效团
- 基于蛋白质药效团匹配的化合物功能预测被引量：1
- 2007年
- 采用了基于蛋白质药效团匹配的化合物评价策略.以配体分子为提问结构对相应数据库进行反向筛选,根据筛选结果可以得到提问分子在人体内可能的作用受体,并以此为依据进行分子结构改造,以加强配体分子的结合专一性.选取环氧合酶2的专一性抑制剂Rofecoxib按照药效团匹配方法进行反向筛选评价,结果与实验事实吻合,并且提出了一个Rofecoxib的潜在靶标.此方法为未知化合物的功能预测和"老药新用"提供了一种新方法、新思路.
- 季宇彬田然刘振明张亮仁林文翰
- 关键词：药物设计
- Combretastatins类微管蛋白抑制剂的定量构效关系与结合模式研究
- ＜正＞（Ⅰ）CoMFA 模型立体场和静电场三维等势图（以化合物1和26为参考分子）：绿区——在该区域引入大体积基团有利于提高化合物的活性,黄区相反;红区——在该区域引入带负电荷的基团有利于提高化合物的活性,蓝区相反。
- 田然季宇彬刘振明金宏威张亮仁林文翰
- 关键词：定量构效关系研究
- 文献传递
- Combretastatins类微管蛋白抑制剂的定量构效关系与结合模式被引量：2
- 2007年
- 以Combretastatins的B环改造化合物为研究对象,采用遗传函数分析方法进行了二维定量构效关系研究.研究结果表明,Apol,PMI-mag,Dipole-mag,Hbond donor和RadOfGyration等描述符对该系列抑制剂活性的贡献最大.采用比较分子场分析方法(CoMFA)和比较分子相似因子分析方法(CoMSIA)进行了三维定量构效关系研究,建立的CoMFA和CoMSIA模型的交叉验证相关系数q2分别为0.630和0.634,具有较强的预测能力.利用CoMFA和CoMSIA模型的三维等势图解析了Combretastatins类化合物的构效关系,阐明了B环上各取代基对抑制微管蛋白聚合活性的影响,同时应用分子对接方法分析并验证了定量构效关系模型.
- 田然季宇彬刘振明金宏威张亮仁林文翰
- 关键词：定量构效关系
