王群群
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：上海大学理学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市教育委员会重点学科基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 胃癌细胞中SerpinB5与MAFbx的相互作用及其作用位点研究
- 2012年
- 目的 探讨胃癌细胞中SerpinB5能与MAFbx的相互作用及其作用位点.方法 采用酵母双杂交及免疫共沉淀方法检测SerpinB5与MAFbx之间的相互作用.分别用RNA干扰及瞬间转染pGBKT7-SerpinB5调节SerpinB5表达水平.在胃癌细胞株SUN-16中研究SerpinB5对MAFbx表达的影响.用同源建模的方法构建出MAFbx的结构信息;并以分子对接的手段来预测SerpinB5与MAFbx相互作用的位点.结果 酵母双杂交及免疫共沉淀均证实SerpinB5能与MAFbx相互作用；MAFbx的表达水平随着SerpinB5的表达水平变化而变化.同源建模和分子对接的方法预测SerpinB5与MAFbx蛋白相互作用的关键残基是PR0261、ASN361和LYS362.结论 胃癌细胞中SerpinB5能与MAFbx相互作用,且SerpinB5上的PR0261、ASN361、LYS362残基是其与MAFbx蛋白相互作用的可能位点.
- 雷科锋王翼飞王群群何香红刘炳亚陈雪华俞焙朱正纲
- 关键词：胃肿瘤MAFBX酵母双杂交
- α-synuclein蛋白与A-β肽和β-synuclein蛋白相互作用位点的预测
- 2012年
- α-synuclein蛋白的异常聚集是引起帕金森病的重要因素.实验研究发现,α-synuclein蛋白能与多个蛋白相互作用.在相互作用的蛋白质中,有的可以促进α-synuclein的异常聚集,如A-β肽;有的可以抑制α-synuclein的异常聚集,如β-synuclein蛋白,但促进或抑制α-synuclein异常聚集的机理并不明确.利用SYBYL和AUTODOK软件模拟α-synuclein蛋白与A-β肽和β-synuclein的相互作用,找到其相互作用位点,为进一步研究α-synuclein蛋白的异常聚集提供理论依据.
- 王群群答亮王翼飞
- 关键词：同源建模分子对接活性位点
- P311蛋白与金属硫蛋白ⅡA相互作用位点的计算机预测被引量：2
- 2011年
- P311蛋白广泛表达于多种组织,并参与体内细胞分化、调节其他蛋白/基因转录、创伤修复、肿瘤发生等多种正常或异常的生物学活动.研究发现,金属硫蛋白ⅡA(metallothionein ⅡA,MT2A)参与P311基因的表达,并起着关键性的调节作用,这说明二者存在着相互作用的关系.采用同源建模的方法构建P311蛋白的3D结构,使用Autodock 4.0软件将结构模型与MT2A进行分子对接,模拟蛋白质间的相互作用,预测二者的作用区域,找出可能的关键残基GLU14,SER48以及GLU56,为进一步的实验研究奠定基础.
- 薛晓怡冯铁男王群群王翼飞
- 关键词：同源建模分子对接
