杨羚
- 作品数：12 被引量：38H指数：4
- 供职机构：广州医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广州市医药卫生科技项目四川省应用基础研究计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生文化科学更多>>
- 铜绿假单胞菌PA902耐药分子机制的基因组水平分析被引量：2
- 2017年
- 目的:应用高通量基因组测序技术研究铜绿假单胞菌PA902的耐药分子机制。方法:用Illumina Miseq平台对PA902进行高通量测序,用生物信息学技术对数据进行拼接和分析。结果:PA902对除阿米卡星以外的多种临床常用抗生素高度耐药,对测序数据进行分析发现,发现编码β-内酰胺耐药基因3个(blaOXA-10、blaPER-1和blaVIM-2),氨基糖苷类耐药基因4个(aph(3‘)-Ⅱd、aac(6’)-Ⅰb-cr、aacA4和aadA2),磺胺类耐药基因1个(sul1);四环素耐药基因1个(tet G);氯霉素耐药基因1个(floR),另发现多个染色体上可能与耐药相关的基因,基因分析结果与临床药敏结果完全吻合。对contigs进行分析,发现多个耐药基因常可定位在同一个contig上,并与可移动元件相关联。MLST分析发现PA902属于ST389,在国内属首次发现。结论:运用高通量测序技术阐明了PA902的耐药分子机制,其发现与临床药敏结果相吻合,可为传统微生物检验技术提供有力的支持。
- 陈定强向波杨羚
- 关键词：铜绿假单胞菌耐药性高通量测序分子机制
- 香港海鸥型菌对喹诺酮耐药性的检测分析被引量：2
- 2014年
- 目的:研究香港海鸥型菌对喹诺酮药物的耐药性情况,并评估琼脂稀释法和纸片扩散法对药敏结果的影响。方法:采用琼脂稀释法和纸片扩散法,对不同来源香港海鸥型菌分离株进行4种喹诺酮类抗生素药敏实验,并对两种检测方法所得结果进行比较。结果:136株香港海鸥型菌对4种常见喹诺酮类抗生素敏感率依次为左氧氟沙星>环丙沙星>诺氟沙星>萘啶酮酸。鱼分离株对左氧氟沙星均敏感,对诺氟沙星和环丙沙星的敏感率达到90%以上。蛙分离株对左氧氟沙星、诺氟沙星、环丙沙星和萘啶酮酸的敏感率分别为62.50%、37.50%、48.21%、19.64%。采用两种方法检测鱼分离株对左氧氟沙星和环丙沙星两种药物的药敏试验结果具有较好的一致性(>95%),对诺氟沙星具有完全一致性(100%)。对于蛙分离株,两种方法的一致性则较差。结论:香港海鸥型菌对喹诺酮类抗生素的耐药率较高,在蛙分离株中尤为明显。两种方法测定喹诺酮耐药性结果有一定差异,建议使用稀释法进行药敏测试。
- 朱丽东肖锋杨羚陈定强
- 关键词：喹诺酮类药物敏感性
- 香港海鸥型菌四环素耐药性及其耐药分子机制研究被引量：3
- 2013年
- 目的:了解香港海鸥型菌分离株对四环素的耐药性及四环素耐药基因的分布情况。方法:采集草鱼和青蛙的肠道标本,用选择性培养基分离、生化鉴定和16SrRNA基因鉴定的方法分离出香港海鸥型菌。用纸片扩散法对香港海鸥型菌分离株进行四环素类抗生素的耐药性测定,用PCR方法检测四环素耐药株中5种四环素耐药基因的携带情况,并将检测阳性的PCR产物进行序列测定。结果:从614份肠道标本中共分离出157株香港海鸥型菌,其中鱼分离株82株,蛙分离株75株,鱼和蛙的分离率分别为18.51%和43.86%。5株四环素耐药株均来自蛙分离株,其中有2株检测出四环素耐药基因tetA及其阻遏基因tetR,其他四环素耐药基因则未检出。tetA基因的氨基酸序列与已报道的香港海鸥型菌的TetA蛋白同源性为100%。结论:不同宿主的香港海鸥型菌对四环素的耐药性存在显著差异。该菌携带的四环素耐药基因以tetA为主,某些耐药菌株的耐药机制仍然未知。
- 罗毓婷陈定强杨羚林勇平吴爱武
- 关键词：四环素耐药性四环素耐药基因
- 结核感染T细胞斑点试验在活动性结核诊断中的效果被引量：9
- 2017年
- 目的:评价结核感染T细胞斑点(T-SPOT.TB)试验在活动性结核诊断中的价值。方法:收集行T-SPOT.TB试验的住院患者975例,对其临床资料与相关检验结果进行分析,并采用受试者工作曲线(ROC)确定该试验区分活动性结核的最佳阈值。结果:T-SPOT.TB试验结果显示,非活动性结核患者组(n=793)的阳性率为29.26%,活动性结核患者组(n=182)则为91.21%,表明该试验在活动性结核检测中有显著作用(P<0.001)。T-SPOT.TB试验的检测敏感度为0.912,特异度为0.707,综合而言优于传统的检测方法。对检测阈值进行优化发现当ESAT-6抗原刺激后斑点数阈值为11,CEP-10抗原刺激后斑点数阈值为9时,T-SPOT.TB试验对活动性结核的检测效能为最高。结论:T-SPOT.TB试验对活动性结核诊断效果较好,并可进一步对检测阈值进行优化,以更好地服务临床。
- 陈定强杨羚向波
- 关键词：结核感染T细胞斑点试验活动性结核
- 肺炎克雷伯菌质粒pNDM-LJ的高通量测序分析被引量：2
- 2016年
- 目的:通过对肺炎克雷伯菌质粒pNDM-LJ的高通量测序分析,研究其与肺炎克雷伯菌耐药的相关性。方法:利用Illumina Miseq高通量测序平台进行测序,然后用Edena软件拼接测序数据,再利用RAST网上工具将拼接得到的contigs进行注释,并用BLAST网上工具进行分析。结果:pNDM-LJ为54 kb大小的环状质粒,GC含量约为49%,预测编码52个功能基因,在不相容群分类中属于Inc X3群质粒。该质粒与已知的Inc X质粒序列有较高的相似性,blaNDM-1基因所在的基因环境比较复杂,推测其是由多个转座事件共同构建的。在pNDM-LJ中,blaNDM-1基因的5′端和3′端分别与ISAba125和IS26两种插入序列相连,形成大小约为10.8 kb的转座子样结构。结论:pNDM-LJ质粒携带碳青霉烯类耐药基因blaNDM-1,可能对我国的广泛传播blaNDM-1基因发挥重要作用。
- 杨羚唐海玲陈定强裘宇容
- 关键词：肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶
- 不同来源菌株中8种mcr亚型基因筛查及阳性菌株药敏分析
- 2020年
- 目的了解8种mcr亚型基因在不同来源临床标本细菌中的分布及阳性菌株的药敏情况。方法采用PCR法分别对128株粪便标本分离的耐黏菌素菌株和130株临床感染标本分离的耐碳青霉烯菌株检测8种mcr亚型基因及mcr阳性菌株的碳青霉烯酶基因,对阳性基因扩增产物进行测序分析;对mcr阳性的菌株进行质谱鉴定和药敏分析;质粒接合实验验证mcr基因的可转移性;采用PCR法对质粒进行分型和检测12种毒力基因的存在情况。结果128株耐黏菌素菌株均没有发现mcr2、mcr3、mcr4、mcr5、mcr6、mcr7、mcr8基因;130株耐碳青霉烯菌株中没有发现mcr2、mcr3、mcr4、mcr5、mcr6、mcr7、mcr8基因。该mcr1阳性株不携带碳青霉烯酶基因,药敏结果显示多重耐药性,对黏菌素为中介,对磺胺类、喹诺酮、碳青霉烯类、绝大部分头孢类药物等耐药,产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)。mcr1阳性菌株质粒接合成功;mcr1阳性菌株携带6种质粒型及3种毒力基因。结论在肠道中耐黏菌素菌株和临床上耐碳青霉烯分离株中mcr1存在一定的流行率,其余7型的mcr基因流行率尚低;为探究mcr基因与ESBLs和碳青霉烯酶之间的关系提供一定的临床依据。
- 赖斯华黄欢欢谢闺娥曾文创杨羚徐霞
- 关键词：肠道菌群碳青霉烯耐药
- 基于高通量测序的多重耐药大肠埃希菌HX43耐药分子机制分析被引量：4
- 2017年
- 目的通过高通量测序法对多重耐药大肠埃希菌HX43进行耐药分子机制的研究。方法用Illumina Miseq平台对HX43进行高通量测序,用Edena、RAST、Res Finder、MLST和BLAST等生物信息学工具或数据库进行数据分析,获得耐药基因相关序列数据。结果 HX43对多种临床常用抗生素均不敏感,仅对碳氢霉烯类药物敏感。对高通量测序数据的分析研究发现,该菌存在多种耐药基因,包括β-内酰胺类耐药基因3个(blaCMY-42、blaCTX-M-14和blaOXA-30),氨基糖苷类耐药基因5个(aac(3)-IIa、aad A5、strA、str B和aac(6')-Ib-cr),喹诺酮类耐药基因1个(aac(6')-Ib-cr),磺胺及甲氧苄啶类耐药基因3个(sul1、sul2和dfrA17),四环素耐药基因1个(tet(B)),氯霉素耐药基因2个(cat B3和cml A1),大环内酯类耐药基因2个(erm(B)和mph(A))。对包含blaCMY-42的contigs进行分析,发现该基因与ISEcp1插入序列、blc和sug E等基因相关联。质粒分型发现HX43携带5种不相容群的质粒。多位点序列分型(MLST)分析发现HX43属于ST3835,为国内外较少见的序列型。结论高通量测序技术可准确获得临床菌株抗生素耐药的相关基因信息,为临床抗菌治疗提供重要的实验室数据支持。
- 陈定强杨羚
- 关键词：大肠埃希菌抗生素耐药高通量测序耐药机制
- 360度评价法对医院住院医师规范化培训学员进行教学管理的现状与对策探讨
- 2023年
- 医学教育的核心在于不断提高医学生人才培养质量。传统的教学管理模式形式单一,主观性强,并不能全面客观地反映住院医师规范化培训(简称“规培”)学员的综合素质。近些年来引入的360度评价法(360°feed back)以调查问卷的形式,从与之发生密切工作关系的多方主体获得被评价者的信息,从而更有利于了解学员培训效果和教学质量并广泛应用于各地医院的考核评价中。如何建立全面、客观的教学管理体系,不断提高规培学员培养质量是笃力前行的目标。本文通过回顾性总结近5年360度评价法在医院规培学员中进行教学管理的应用,尝试推敲更适合于我国目前住院医师规培的对策,对今后的改进方向提出建设性建议。
- 杨羚唐家新刘利东林勇平
- 关键词：医学教育住院医师
- 鲍曼不动杆菌8种RND外排泵介导替加环素耐药表型的研究被引量：9
- 2018年
- 目的探讨鲍曼不动杆菌中8种RND外排泵基因的分布与替加环素耐药表型间的关系。方法微量肉汤稀释法检测120株鲍曼不动杆菌对替加环素的耐药性,PCR扩增8种外排泵及调控基因。琼脂二倍稀释法测定替加环素耐药菌株对18种抗菌药物的最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC),利用5种外排泵抑制判定外排泵表型。采用实时荧光定量PCR检测外排泵基因的表达水平。结果筛选出替加环素耐药菌8株,对18种抗菌药物耐药情况严重,其中6株为广泛耐药菌;3种外排泵抑制剂CCCP、PAβN及维拉帕米的表型阳性率分别为50%、37.5%和12.5%。耐替加环素菌株除ACICU_02904和ACICU_03412基因外均为阳性;替加环素敏感菌中外排泵(ade ABC-ade RS、ade FGH-ade L和ade IJK-ade N)基因检测率为38.4%,新近发现外排泵(ACICU_00143、ACICU_03066和ACICU_03646)基因检测率为50.9%,然而,ACICU_02904和ACICU_03412基因检出率为0.9%。在转录水平上,替加环素耐药组的ade B相对表达量是敏感组的23.5倍。结论鲍曼不动杆菌中ade B相对表达量伴随菌株对替加环素MIC值增加而升高,主动外排泵表达活性增加是替加环素耐药的一个重要机制。
- 张驰杨羚凌保东
- 关键词：鲍曼不动杆菌替加环素外排泵耐药机制
- VITEK-MS系统直接鉴定体液培养阳性标本的研究被引量：4
- 2016年
- 目的利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱系统(VITEK-MS)对体液培养阳性瓶进行直接鉴定,探索快速诊断临床致病菌的新策略。方法收集体液培养阳性瓶,不经琼脂平板培养,直接利用VITEK-MS进行鉴定,并与传统生化鉴定的方法进行比较分析。结果 50例体液培养阳性瓶中,传统细菌鉴定法检出47株阳性菌,3例阴性;而VITEK-MS直接鉴定法检出31株阳性菌,同样3例阴性。VITEK-MS直接鉴定法灵敏度达65.96%,特异度为100%,临床符合率为68%。鉴定时间从24小时缩短到2小时。结论利用VITEK-MS质谱系统直接鉴定体液培养阳性标本中的病原菌,能有效缩短细菌鉴定时间,准确快速地诊断临床致病菌。
- 杨羚莫晓彦陈定强
