杨瑞瑞
- 作品数：11 被引量：68H指数：4
- 供职机构：新疆大学生命科学与技术学院生物资源基因工程重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划新疆维吾尔自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 盐生植物盐爪爪的耐盐生理特性探讨被引量：12
- 2015年
- 当前土壤盐渍化日益严重,是限制植物生长的一个主要环境因子,然而在盐碱自然环境中生长着许多耐盐植物,为更好地了解盐生植物的耐盐机理,该文从无机离子Na+,K+,Ca2+含量、脯氨酸水平、水势变化、丙二醛含量和盐胁迫的表型等生理参数以及半定量RT-PCR检测脯氨酸合成关键酶基因(P5CS)的表达规律等方面探讨盐胁迫下盐爪爪的耐盐特性。结果表明:(1)随着盐浓度的升高,Na+在根和肉质化的叶中显著地富集,且叶中积累的Na+比根中更多;(2)在盐胁迫条件下,随着盐浓度的增加,脯氨酸的含量和脯氨酸合成关键酶基因的表达显著地增强;(3)Na+和脯氨酸是植物有效的渗透调节剂,可使处于低水势的植物细胞仍能从细胞外高浓度的盐溶液中吸收水分;(4)在0和700 mmol·L-1Na Cl处理下,盐爪爪肉质化叶中丙二醛的含量较其它处理高,这表明植物在这两个处理下可能受到了氧化胁迫;(5)从盐胁迫3个月的生长表型来看,低盐环境中生长的盐爪爪植株的生物量更多,肉质化的叶嫩且绿。综上所述,结合对野外生境的调查和实验室长期的盐胁迫表型结果表明盐爪爪的生长是需盐的,相对低的盐浓度环境对盐爪爪的生长是顺境,而无盐或高浓度盐环境对于盐爪爪的生长来说都是逆境。该研究结果为全面深入研究盐爪爪的耐盐特性,以及更好地利用盐爪爪的生物和基因资源改良土壤和提高作物和林木的耐盐性奠定基础。
- 杨瑞瑞曾幼玲
- 关键词：盐生植物盐爪爪耐盐生理
- 盐爪爪液泡膜H^+-ATPase B亚基基因克隆及盐胁迫液泡膜相关基因的表达
- 2015年
- 【目的】研究藜科盐生植物盐爪爪(Kalidium foliatum)V-H+-ATPase B亚基基因的克隆与液泡膜相关基因的表达分析。【方法】采用RT-PCR和RACE技术克隆盐爪爪V-H+-ATPase B亚基基因(VHAB),利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析液泡膜相关基因Kf VHA-B、Na+/H+逆向转运蛋白基因Kf NHX的表达情况。【结果】Kf VHA-B全长1 881 bp,含1 467 bp的ORF阅读框,命名为Kf VHA-B(Gen Bank登录号:EF114316),编码488个氨基酸,推测的蛋白分子量大小为54.01 k D,理论等电点为4.68,含一个保守的ATP结合位点‘323-SGSIT-327’和两个推测的多聚腺苷酸化的信号保守序列;基因编码蛋白的系统进化树分析表明,盐爪爪VHA-B与盐穗木的VHA-B聚类关系最近;qRT-PCR检测了液泡膜相关基因Kf VHA-B、Na+/H+逆向转运蛋白基因Kf NHX的表达,100、500 mmol/L Na Cl处理下,Kf VHA-B在转录水平表达量始终保持较稳定,Kf NHX基因在转录水平随盐浓度的增加其表达量呈现递增趋势,而且100 mmol/L Na Cl处理下72 h时其表达量达到最大。【结论】Kf VHA-B可能在盐爪爪应对盐胁迫中起着重要的作用。
- 易小娅杨瑞瑞曾幼玲
- 关键词：盐爪爪液泡膜H^+-ATPASEB亚基盐胁迫克隆
- 混合盐碱胁迫对灰绿藜(Chenopodium glaucum L.)种子萌发的影响被引量：31
- 2014年
- 灰绿藜广泛分布于新疆中低度盐碱地干旱区,属藜科1年生经济盐生植物。本实验研究了混合盐碱胁迫对灰绿藜种子萌发和萌发恢复的影响。结果表明:随着盐浓度和pH值的增高,灰绿藜的种子萌发率呈下降趋势;同一盐浓度不同pH处理的灰绿藜种子萌发率随pH值的升高而减少,同样,随着盐浓度和pH值的增加,灰绿藜种子的萌发速率均为下降;从各胁迫处理的种子萌发的幼苗的生长表型来看,盐浓度和pH值是两个重要的影响因素;将未萌发的种子转移至蒸馏水中复水后,最终萌发率达到90%以上,说明一定程度的混合盐碱胁迫对灰绿藜种子的萌发潜力没有太大的影响,并且萌发恢复率随着盐浓度的增加而增加;盐浓度、pH值及其相互作用对灰绿藜种子萌发有抑制作用;盐浓度是决定性的主导因素,pH值对灰绿藜种子萌发的影响次之;综上,混合盐碱胁迫对灰绿藜的种子萌发和萌发生长的表型均有明显的抑制作用。
- 古丽内尔.亚森杨瑞瑞曾幼玲
- 关键词：灰绿藜混合盐碱胁迫萌发率
- 植物miRNA的生物学特性及在环境胁迫中的作用被引量：14
- 2016年
- MicroRNA(miRNA)是一类在生物体内普遍存在的非编码、长度约为21 nt的小RNA分子,一般由内源基因编码,RNA聚合酶Ⅱ转录后,经过Dicer-Like酶等一系列的蛋白复合物将pre-miRNA(precursor miRNA)剪切成成熟miRNA,在转录及转录后水平介导靶mRNA转录沉默、降解或翻译抑制来调控基因的表达,是真核细胞基因表达的重要调控因子。第一个miRNA是在秀丽隐杆线虫(C.elegans)中发现的lin-4,与lin-14 mRNA 3′UTR的碱基序列部分互补,降解lin-14,从而抑制lin-14的表达。lin-4对靶基因lin-14的调控与线虫的生长发育密切相关。而第一个发现的植物miRNA是拟南芥mi R171,它靶向剪切编码基因Scarecrow-Like(SCL)家族的mRNA,调控其基因的表达,进而影响植物的生长发育。植物部分miRNA,如mi R156—mi R408在各植物物种中相对保守,而mi R408以后的miRNA具有物种特异性。植物在生长过程中会遭遇诸多不可预知(如同盐碱、干旱、重金属以及害虫和病原菌的侵扰等)的环境胁迫。固着生长的特性使得植物不能像动物那样通过移动来避免不利环境的影响,因此,需要自身特殊机制来应对这些环境胁迫。植物在长期逆境中已进化出极为精细复杂的生理和分子机制。miRNA与它作用的靶基因是响应环境胁迫的主要调控因子。miRNA参与了植物的生长发育、信号转导、蛋白质降解、营养胁迫、抗病原菌的入侵以及适应高盐和干旱等逆境胁迫过程,对于调节内源抗性基因表达具有一定意义。目前通过高通量测序、实时定量PCR检测和转基因等技术已经发现了很多与环境胁迫相关的miRNA,它们在逆境胁迫下的表达呈现显著差异性;miRNA的过表达植株经逆境胁迫处理可能表现出一定的抗逆或敏感性。同一家族的miRNA不同成员在响应环境胁迫时具有物种特异性。新疆地区是典型的大陆性干旱气候,降水量少,盐碱荒漠化地区多。在这样严酷的环�
- 曾幼玲杨瑞瑞
- 关键词：植物MICRORNA生物合成
- 盐穗木HcmiR172e和预测的靶基因HcTOE3的克隆及盐胁迫下的靶向关系分析
- 2016年
- 盐穗木(Halostachys caspica)广泛分布于新疆干旱盐碱地区,属于藜科极端耐盐的盐生灌木。从600 mmol?L-1 Na Cl处理48 h的盐穗木根的小RNA文库中筛选到差异极显著的HcmiR172e做为研究对象,利用盐穗木转录组数据预测其靶基因为HcTOE3,开展HcmiR172e-HcTOE3的分子克隆和胁迫表达相关性工作。通过同源克隆和RACE技术获得盐穗木HcmiR172e前体和HcTOE3全长序列;使用生物信息软件分析前体和靶基因信息及相关性;采用q RT-PCR技术检测了不同盐浓度(200、400和600 mmol?L-1 Na Cl)处理48 h的盐穗木HcmiR172e及预测的靶基因HcTOE3的表达变化。结果显示,克隆得到的HcmiR172e前体序列可形成颈环结构,各项指标符合前体要求。其靶基因HcTOE3 c DNA全长为1 744 bp,开放阅读框1 329 bp,在编码区有一个高度匹配HcmiR172e的结合位点(CTGCAGCATCATCAGGATTC);q RT-PCR分析结果表明HcmiR172e与其预测的靶基因HcTOE3均响应盐的处理,二者呈现一定的负相关性。后续将通过实验逐步阐明盐穗木HcmiR172e对HcTOE3在逆境中的靶向调控作用。
- 张玉芳杨瑞瑞曾幼玲
- 关键词：盐穗木盐胁迫克隆QRT-PCR
- 盐穗木miR167d和预测靶基因ARF8在盐胁迫下的表达与相关性分析被引量：2
- 2018年
- 【目的】盐穗木(Halostachys caspica)是一种藜科多年生盐生灌木,对盐分适应性极强。miR167是作用于生长素信号通路上的内源非编码小RNA分子,它通过靶向生长素响应因子ARFs(auxin response factors)来调控生长素响应基因的表达。研究从高盐(600 mmol/L NaCl)处理48 h盐穗木根的小RNA文库中筛选到差异表达的miR167d,并从该物种的转录组数据中预测到其靶基因ARF8。该文开展了高盐胁迫下盐穗木miR167d和预测靶基因ARF8的表达模式和相关性分析。【方法】通过荧光定量PCR试验检测和分析高盐胁迫下盐穗木miR167d和预测靶基因的表达模式和相关性;利用烟草瞬时表达试验间接地鉴定盐穗木miR167d对预测靶基因ARF8的靶向关系;采用同源克隆方法结合RACE技术获得盐穗木miR167d的靶基因ARF8的全长序列,并进行生物信息学分析。【结果】(1) 600 mmol/L NaCl处理盐穗木,其同化枝中miR167d和ARF8的表达均受到诱导,胁迫48 h时,miR167d的表达最高并与靶基因的表达呈现显著的负相关性,HcARF8基因的表达随胁迫处理时间的延长呈现先增加后下降的趋势,推测盐穗木miR167d和ARF8两基因可能在响应盐胁迫过程中发挥作用。(2)构建融合GFP的含预测靶基因HcARF8的植物表达载体并转化农杆菌,烟草瞬时表达试验的结果表明,拟南芥miR167d对盐穗木ARF8基因具有剪切作用,间接证明盐穗木miR167d对预测的靶基因HcARF8具有靶向切割作用。(3)克隆获得的盐穗木ARF8基因全长2 861 bp,ORF 2 442 bp,编码813个氨基酸,在编码区与盐穗木miR167d高度互补匹配。生物信息学分析该基因编码的蛋白高度保守,与同科植物甜菜ARF8同源性达到87%,都具有能与生长素相关元件(B3 DNA绑定元件、生长素响应元件,生长素诱导转录IAA超家族的元件)结合的功能域。【结论】盐穗木miR167d和HcARF8基因具有靶向关系,高盐胁迫处理盐穗木,其同化枝中两基因的表达�
- 张慧珍黄世平杨瑞瑞曾幼玲
- 关键词：盐穗木盐胁迫
- 植物miRNA的研究方法概述被引量：4
- 2015年
- microRNA(miRNA)是动植物中广泛存在的内源性非编码小RNA分子,通过与靶基因mRNA的特定位点结合,在转录后水平负调控靶标基因的表达。植物miRNA几乎调控所有的生物学和代谢过程,包括生长发育、细胞维持和分化、信号转导以及对逆境胁迫的响应。随着第二代深度测序技术和生物信息学的快速发展,miRNA的相关研究已从模式植物扩展到非模式植物,发现了大量新的miRNA,并确定了小部分miRNA的生物学功能。由于miRNA序列短小,与靶标基因作用的不确定以及调控网络的复杂性,研究难度较大。本文从研究方法的角度对miRNA的鉴定、靶基因的验证和miRNA功能研究等方面所涉及的方法进行总结,试图为植物miRNA的研究提供一些思路和启发。
- 易小娅杨瑞瑞曾幼玲
- 关键词：植物MIRNA靶基因研究方法
- 盐胁迫下盐穗木miR393b与预测靶基因Hc TIR1的表达及相关性
- 2019年
- 【目的】研究盐胁迫下盐穗木生长素通路中miR393b和预测的靶基因 TIR1 的表达模式和相关性。【方法】采用生物信息学方法预测盐穗木miR393b的靶基因;通过qRT-PCR方法检测盐胁迫下盐穗木miR393b及预测靶基因 HcTIR1 ( transport inhibitor response1 )的相对表达模式,并分析其相关性。【结果】 miR393b成熟体在不同植物种中高度保守;盐穗木miR393b预测的靶基因为 TIR1;盐胁迫处理,盐穗木同化枝中两基因响应高盐胁迫,并具有一定的负相关性。【结论】盐穗木miR393b和预测的靶基因响应高盐胁迫,二者具有一定的负相关。该结果为进一步探讨盐穗木miR393b与预测靶基因 TIR1 的生物学功能奠定基础。
- 王鹏举黄世平杨瑞瑞曾幼玲
- 关键词：盐穗木盐胁迫
- PR10的结构、信号转导以及功能的研究进展被引量：3
- 2014年
- PR10蛋白是植物在受到各类生物和非生物胁迫后产生的一种病程相关蛋白。本研究首先回顾和总结了PRs以及PR10近年来的研究进展。主要介绍了PR10蛋白的序列和结构特征,并结合国内外的研究成果总结了PR10的信号转导途径;分析了PR10蛋白在不同方面的功能,比如具有核酸酶活性,抵抗病原微生物等生物与非生物胁迫,以及与宿主细胞程序化死亡密切相关等方面,最后提出了PR10蛋白在目前研究中依然存在的问题及对未来的展望,所以研究该抗病基因的功能和作用机制对于今后在改良农作物的品质,提高作物产量方面具有重要的意义。
- 杨瑞瑞易小娅曾幼玲
- 关键词：信号转导
- 不同引物对和退火温度对盐生植物盐穗木内参基因β-actin扩增效率的影响被引量：2
- 2017年
- 【目的】以盐生植物盐穗木为材料,研究不同引物对和不同退火温度对盐穗木内参基因β-actin扩增效率的影响。【方法】设计扩增β-actin基因的两对引物,标记为β-actin1和β-actin2,分别建立这两对引物扩增盐穗木β-actin基因和特异性引物扩增该物种的过氧化物酶基因POD(盐响应的代表性基因),在不同退火温度下的标准曲线和扩增曲线。【结果】不论55还是58℃退火温度,引物对β-actin1比引物对β-actin2有更好的扩增效率;在55℃退火温度下,引物对β-actin1有更高的扩增效率。在这两个退火温度下,分别以β-actin1和β-actin2引物对扩增β-actin基因作为内参,盐穗木POD基因的相对表达水平具有一定的差异性。【结论】引物和退火温度会影响荧光定量PCR的扩增效率,进而会影响靶基因的相对表达水平。
- 白雪芹杨瑞瑞曾幼玲
- 关键词：盐穗木退火温度Β-ACTIN
