李雅文 作品数:8 被引量:5 H指数:1 供职机构: 华南农业大学兽医学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 环境科学与工程 更多>>
猫锡兰钩虫rDNA ITS1的扩增及分子鉴定 被引量:3 2013年 为了对从猫粪便样品中分离的钩虫虫卵进行种类鉴定,本研究提取该虫卵基因组DNA,根据核糖体内转录间区1(ITS1)的保守序列设计钩虫属引物,通过PCR扩增、克隆、测序、相关软件分析,建立系统进化树,从分子水平对其进行种类鉴定。结果表明扩增出404 bp DNA片段,测序结果显示该片段包括309 bp ITS1和95 bp的5.8S rDNA,与NCBI中登录的序列进行比对以及采用Clustal X和MEGA5.1软件分析确定该钩虫为锡兰钩虫。这是我国首次建立钩虫的分子鉴定方法,也是40年来再次发现猫源锡兰钩虫,为锡兰钩虫分子生物学和分子流行病学研究奠定了基础。 刘远佳 郑国超 刘田 任邵娜 李雅文 孟祥龙 Loutou H M 李国清关键词:RDNA 猫源蓝氏贾第虫HRM快速基因分型方法的建立 被引量:1 2015年 为建立一种蓝氏贾第虫的快速基因分型方法,选取β-贾第素(β-giardin)基因作为遗传标志,采用HRM技术对华南地区常见的猫源蓝氏贾第虫A型、F型进行基因分型。根据GenBank中登录的序列KJ027416.1(A型)和JX 275388(F型)设计了qPCR-HRM引物BGF和BGR,通过对反应温度和反应体系进行优化,建立了HRM基因分型方法,并对其稳定性、敏感性和准确性进行了检测。结果显示,HRM分型方法可对蓝氏贾第虫A型、F型以及混合感染情况进行检测;批内和批间重复性均良好;当样品质量浓度低至4.27×10-4 ng/μL时,HRM检测方法依然可以分辨出基因型;其准确性与测序结果完全一致。结果表明,建立的HRM基因分型方法具有快速、稳定、敏感和准确的特点,适用于猫源蓝氏贾第虫的临床检测和贾第虫病的分子流行病学调查。 谭立娉 郑国超 李雅文 胡伟 罗琴 林丽琴 路鹏云 余新刚 武省 宋美冉 王祯 江飚 李国清关键词:蓝氏贾第虫 HRM 基因分型 佛山市南海区耕地质量调查与评价 本文以环境生态理论及科学发展观为指导,对南海区农业土壤进行了较全面的调查,采样分析了耕地土壤养分和重金属污染状况,分析测试的主要指标包括土壤pH、有机质、全氮、全磷、全钾、碱解氮、速效磷、速效钾、微量元素及重金属元素含量... 李雅文关键词:土壤养分 耕地质量 重金属污染 环境生态 犬猫贾第虫IGS序列特异性检测方法的建立 被引量:1 2013年 应用PCR技术对广州市某宠物寄养所采集的一株D型犬源贾第虫和一株F型猫源贾第虫的核糖体IGS序列进行了扩增、克隆、测序,将测序结果与GenBank已上传的贾第虫相应序列进行比对分析,基于贾第虫IGS序列建立了具有良好特异性和敏感性的PCR检测方法,并对84份临床粪样进行了检测。结果显示,D型犬源贾第虫和F型猫源贾第虫的IGS序列长分别为1355 bp和1388 bp,贾第虫IGS序列存在多态性现象,种间差异明显,可以作为区分不同基因型的分子标记;建立的PCR方法能特异性扩增犬源贾第虫核糖体IGS序列,而犬蛔虫等对照虫体DNA均不能扩增,该方法对贾第虫DNA的最小检测量为82 fg,对84份临床粪样的检出率为3.57%,比传统镜检法高出2.38%,具有一定的临床应用价值。 李雅文 刘远佳 郑国超 谭立娉 胡伟 罗琴 林丽琴 路鹏云 李国清关键词:蓝氏贾第虫 PCR检测 猫源蓝氏贾第虫HRM快速基因分型方法的建立 引言蓝氏贾第虫(Giardia lamblia)是一种寄生于小肠的机会致病性原虫,宿主范围较广,可感染包括人在内的多种哺乳动物,引起以腹泻为主的临床症状.该虫目前可分为8个主要的集聚体或基因型,即A-H.其中,A、B型为... 谭立娉 郑国超 李雅文 胡伟 罗琴 李国清猫源贾第虫EF1α和GDH基因的扩增与分析 被引量:1 2013年 为研究猫源蓝氏贾第虫EF1α和GDH基因的分子特性,本研究采用两组引物EF1-F、EF1-R和GDHeF、GDHiF、GDHiR通过普通PCR及套式PCR方法对两基因片段进行特异性扩增,用MegAlign软件对扩增片段进行同源性比对及进化树分析。结果显示,获得了200 bp及432 bp的EF1α和GDH序列,其基因登录号分别为KC510661和KC510662,EF1α基因位点分析表明该蓝氏贾第虫分离株为基因型F,GDH基因位点分析表明其可能是一个新亚型(FIII)。该研究首次对猫源蓝氏贾第虫EF1α和GHD基因双位点进行分子特性研究,为贾第虫分子分类学及分子遗传学研究奠定了基础。 郑国超 刘远佳 李雅文 胡伟 路鹏云 林丽琴 谭立娉 罗琴 李国清关键词:贾第虫 用于检测蓝氏贾第虫人畜共患基因型的HRM引物及其应用 本发明公开了一种用于检测蓝氏贾第虫人畜共患基因型的HRM引物及其应用。HRM引物的核苷酸序列为:TPI1:5'-CTTCATCGGYGGTAACTT-3',TPI3:5'-GGCACGCTTMGCCTTCTT-3';TP... 李国清 张萍 李结 刘远佳 李雅文 朱海波 米多用于检测蓝氏贾第虫人畜共患基因型的HRM引物及其应用 本发明公开了一种用于检测蓝氏贾第虫人畜共患基因型的HRM引物及其应用。HRM引物的核苷酸序列为:TPI1:5'-CTTCATCGGYGGTAACTT-3',TPI3:5'-GGCACGCTTMGCCTTCTT-3';TP... 李国清 张萍 李结 刘远佳 李雅文 朱海波 米多文献传递