李春鑫
- 作品数：47 被引量：103H指数：6
- 供职机构：河南省农业科学院更多>>
- 发文基金：河南省科技攻关计划国家科技支撑计划河南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生轻工技术与工程生物学更多>>
- 小麦种质资源研究、创新与利用
- 许为钢胡琳张磊董海滨齐学礼李正玲李春鑫张建周昝香存李艳王根松朱统泉成东梅李金榜王保林
- 1、项目的目的意义优异种质资源的挖掘、创新与利用是小麦遗传改良研究的物质基础。开展小麦种质资源研究，明确重要农艺性状关键基因在小麦遗传改良中的利用状况，探索重要农艺性状优异基因的利用方式，挖掘创新的优异种质资源可为小麦遗...
- 关键词：
- 关键词：小麦农业生产发展
- 基于全基因组重测序的油莎豆InDel位点鉴定及分子标记开发
- 2024年
- 选取4种不同类型油莎豆种质资源进行全基因组重测序,以此全基因组水平鉴定油莎豆的InDel位点,并根据多态性InDel位点序列信息开发有效的分子标记。基于重测序数据与油莎豆参考基因组的序列比对,利用GATK和SAMtools软件共鉴定到321271个InDel位点,在油莎豆各个scaffold上呈现高密度分布,其中93%以上位点呈现出杂合类型。通过4种油莎豆种质间InDel位点的多态性分析,发现98%的InDel位点不具有多态性,最终鉴定出6036个多态性InDel位点。基于多态性InDel位点的插入/缺失序列长度分析,筛选出829个插入/缺失序列长度大于20 bp的多态性InDel位点,适用于开发可通过琼脂糖凝胶电泳检测的InDel分子标记。选择8个多态性位点进行InDel分子标记开发和琼脂糖凝胶电泳检验,结果表明,鉴定的多态性InDel位点真实可靠以及开发的InDel分子标记合适可用。本研究利用不同类型油莎豆种质鉴定出大量的多态性InDel位点,能够开发出适合、准确、有效的InDel分子标记,极大地丰富了油莎豆的分子标记资源,为油莎豆种质资源更加精确的评价、鉴定和利用提供可靠的技术支撑。
- 张向歌程珊陈晨朱雅婧李春鑫许欣然王树峰武林海王会伟
- 关键词：油莎豆种质资源分子标记
- 小麦白粉病抗病基因的精细定位及表达差异分析
- 李春鑫
- 关键词：小麦白粉病抗病基因信号通路
- 一种扩增引物、油莎豆中长粒粒型鉴定用试剂盒
- 本发明涉及分子生物学及遗传育种技术领域，具体涉及一种扩增引物、油莎豆中长粒粒型鉴定用试剂盒。本发明通过对油莎豆种质资源中的代表性粒型的基因组测序，选取黑色、中圆粒、中长粒、中长粒为筛选样本，发掘筛选出两个能够特异性区分油...
- 李春鑫王会伟宋万献张戈于美琴李居政
- 串联重复序列在高粱基因组中的特征及分布被引量：3
- 2018年
- 以高粱全基因组及基因中不同结构区域为研究对象,从Phytozome数据库中下载高粱基因组数据及基因注解数据,利用重复序列分析工具(Phobos v3.3.12),检测串联重复序列在不同区域的密度变化、模体类型及其在基因内与基因间的位置分布情况。结果表明,在高粱基因组中5'UTR、UI200、UI500中重复序列密度较高,分别为25 655 bp/Mb、16 761 bp/Mb、10 718 bp/Mb,其余区域密度差别不大,约为6 000 bp/Mb。在基因内及基因间区域中,重复序列模体主要为二碱基和三碱基重复,占到总密度的30%以上;特别在基因编码区(CDS),重复序列模体主要为3的倍数(如三碱基、六碱基等)。并且串联重复序列在基因组中并非随机分布,在基因间隔区,串联重复序列的分布明显靠近基因,这样的分布特征可能与其基因转录调控有关;在内含子(Intron)区域,更多的重复序列分布偏向于内含子两端,这可能与内含子剪切有关。
- 赵志新李春鑫李雨娇
- 关键词：高粱基因组串联重复序列
- 油莎豆基因组大小、倍性和系统发育分析被引量：3
- 2023年
- 为明确黄淮地区油莎豆主栽品种和特色种质资源的基因组特性及与其近缘类群的系统发育关系,利用流式细胞仪和基因组Survey分析对6个油莎豆材料基因组大小、倍性进行评估,并基于核糖体DNA的外转录间隔区(External transcribed spacer,ETS)和内转录间隔区(Internal transcribed spacer,ITS)序列分析其与近缘类群间的系统发育关系。流式细胞仪分析结果表明,6个油莎豆材料基因组在0.8086~0.8585 Gb,均值为0.8264 Gb;基因组Survey分析结果表明,3种粒型油莎豆材料豫油莎2号、豫油莎3号、YYS-4的基因组大小、重复序列占比、GC含量、杂合率分别为0.6979 Gb、81.02%、34.7%、0.28%,0.7787 Gb、84.45%、36.4%、0.08%,0.7906 Gb、83.75%、34.9%、0.19%;基因组Survey分析和花粉粒染色结果显示,3种粒型油莎豆材料均为三倍体。系统发育分析结果显示,6个油莎豆材料聚为油莎豆分支,该分支与香附子和头状穗莎草构成的分支形成亲缘关系较近的姐妹群,并与其余的C4植物(碎米莎草、长尖莎草等)构成C4植物分支。
- 王会伟朱世新张新友王艳杨铁钢张向歌王树峰李春鑫
- 关键词：油莎豆基因组大小系统发育
- 玉米C_4光合酶基因导入对拟南芥光合特性及抗旱性的影响被引量：8
- 2017年
- 为了解玉米C_4型光合酶基因对C3植物拟南芥光合特性的影响及其对干旱胁迫的响应,分别以过表达ZmPEPC(磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶)、ZmPPDK(丙酮酸磷酸二激酶)和ZmNADP-ME(依赖于NADP的苹果酸酶)单个酶基因的拟南芥株系(分别简写为PC、PK、ME),以及过表达PEPC+PPDK和PPDK+NADP-ME两个酶基因的拟南芥株系(分别简写为PCK、PKM)为供试材料,在开花期停止浇水,并分别于干旱胁迫处理前1天、第5天、第10天和结束干旱胁迫复水处理5d时测定转基因拟南芥中目标基因的表达量、光合速率、水分利用效率和酶活性。结果表明,在正常生长条件下,PCK类型株系的PEPC酶活性、PPDK酶活性、净光合速率(Pn)以及水分利用效率(WUE)较野生型拟南芥分别高52%、20%、24%和55%,除PPDK酶活性外,PCK类型株系各指标测定值的增幅均高于其他转基因类型株系,综合表现最优。不同类型株系的上述测定指标总体表现为PCK>PC>PK、PKM>ME。干旱胁迫处理5d时,各类型株系中目标基因的表达量、光合酶活性、Pn和WUE均有所上升。干旱胁迫处理10d时,拟南芥受到严重损伤,上述指标的测定值均下降。复水5d时上述指标得到不同程度的恢复,不同类型转基因株系的各项测定指标在不同干旱胁迫处理中总体仍表现为PCK最优,PC次之。各转基因株系均优于受体非转基因拟南芥。
- 雷明月许为钢李小博张庆琛王会伟张磊方宇辉李艳李春鑫
- 关键词：拟南芥玉米
- 小麦抗叶锈病基因Lr42的SNP分子标记、检测方法及应用
- 本发明公开了一种小麦抗叶锈病基因Lr42的SNP分子标记TC113325、利用该分子标记检测小麦抗叶锈病基因Lr42的方法及其应用，该分子标记通过以下引物扩增得到，其中上游引物序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID ...
- 李春鑫王会伟赵明忠张建周郭瑞韩留朋杜习军
- 河南省同名小麦地方品种SSR遗传多样性分析被引量：14
- 2016年
- 为了给河南省小麦地方品种的开发利用提供依据，利用SSR标记对白和尚头、白麦、白芒糙、出山豹等15组名称相同的小麦地方品种共计155份材料进行了组间和组内遗传多样性分析。结果发现，同名品种组内，15组材料的等位变异变化范围为47~79个，平均遗传相似系数变化范围为0.66～0.93，多态性信息含量分布范围为0.856～0.936；同名品种组间，155份材料共产生143个等位变异，遗传相似系数分布范围为0.75~1.00，平均遗传相似系数为0.90，多态性信息含量为0.981。分别对同名品种组内和组间进行聚类分析，结果发现，同名品种组内3组共7份材料遗传相似系数为1.00，而同名品种组间未出现遗传相似系数为1.00的材料。由此可见，河南省小麦地方品种具有丰富的遗传多样性，同名小麦地方品种间存在同名同质和同名异质的现象。
- 李正玲胡琳王会伟董海滨李艳李春鑫许为钢
- 关键词：小麦地方品种SSR亲缘关系
- 基于云架构的小麦分子育种数据共享平台
- 本发明涉及基于云架构的小麦分子育种数据共享平台，包括云服务器、与云服务器信号连接的管理系统、门户系统、显示系统；管理系统与云服务器之间传输的信息包括数据库的建立、用户注册、密码修改、机构设置，保证平台安全的同时提高系统功...
- 张煜彭超军李春鑫王会伟
- 文献传递
