朱晓平
- 作品数:19 被引量:65H指数:6
- 供职机构:南京师范大学更多>>
- 发文基金:国家级星火计划海南省自然科学基金高层次人才科研启动基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学文学更多>>
- 波纹裸胸鳝线粒体DNA D-loop多态性分析被引量:1
- 2011年
- 对分布于我国海南东部海域的波纹裸胸鳝群体(n=21)的mtDNA D-loop区987 bp全序列进行了分析。结果表明:21条波纹裸胸鳝D-loop区序列中,A+T平均含量为62.5%;经比对,共检测到177个核苷酸多态位点,约占核苷酸总数的18.7%;D-loop全序列突变类型有5种,即转换158、颠换18、插入2、缺失1及转换与颠换共存1,它们分别占核苷酸多态位点的89.3%、10.1%、0.3%、0.15%及0.15%。由此构建了中国海南沿海21条波纹裸胸鳝的NJ分子系统树,聚类分析表明:所测波纹裸胸鳝的mtDNA D-loop序列表现为2个单倍型组,从而可以看出这21条波纹裸胸鳝可能有2个母系起源,从系统树上来看,它们之间并没有明显的地域差异。
- 刘志亮齐兴柱骆剑朱晓平彭艳辉尹绍武
- 关键词:线粒体DNAD-LOOP多态性
- 波纹唇鱼微卫星分子标记的筛选及适用性分析被引量:7
- 2012年
- 采用磁珠富集法及利用生物素标记的(CA)15寡核苷酸探针从波纹唇鱼(Cheilinusundulatus)基因组DNABspl43I酶切位点的400~1000bp片段中筛选CA/GT微卫星位点。洗脱的杂交片段克隆到PMD18.T载体上构建富集微卫星基因组丈库后,通过PCR筛选出阳性克隆进行测序。在120条序列中有88条序列包含有重复次数不少于5次的微卫星位点,阳性序列比例达到73.33%。其中完美型(perfect)类型微卫星最多的重复次数为26次。在88条非冗长序列中,共有28条r31.82%)微卫星重复序列两端有侧翼序列能够进行引物设计。用波纹唇鱼3个个体的混合基因进行引物筛选,其中的24对具有清晰的扩增条带。将筛选的24对引物对波纹唇鱼1个群体的39个个体进行遗传多样性分析,其中4对引物扩增产物为单态,20对扩增产物呈多态性;20对扩增多态的引物在39个个体中扩增出等位基因数为2~12,平均有效等位基因数为3.5。该波纹唇鱼群体的P/C、Ho,He的平均值分别为0.0782、0.8513、0.5667。这20个微卫星位点适于波纹唇鱼群体遗传结构的研究分析。
- 彭艳辉骆剑尹绍武朱晓平胡静刘志亮祝斐齐兴柱胡亚丽
- 关键词:微卫星分子标记磁珠富集法
- 一种泰国笋壳鱼和本地笋壳鱼鱼苗的鉴别引物和方法
- 本发明属于水产养殖学领域DNA标记领域,具体涉及应用微卫星标记对泰国笋壳鱼(云斑尖塘鳢Oxyeleotrismarmoratus)和本地笋壳鱼(河川沙塘鳢Odontobutispotamophila)鱼苗进行鉴别。本发明...
- 尹绍武朱晓平祝斐胡亚丽
- 文献传递
- 线纹尖塘鳢(♀)、云斑尖塘鳢(♂)及其杂交、回交子代遗传变异的微卫星分析被引量:12
- 2012年
- 为选育出生长快、外形美、耐粗饲、易起捕的尖塘鳢属鱼类新品种。本研究用20对微卫星引物对线纹尖塘鳢(♀)、云斑尖塘鳢(♂)及其杂交、回交子代的遗传变异进行分析。结果表明:20对引物在4个群体中共检测出87个等位基因,平均等位基因数以线纹尖塘鳢最低(1.6087),杂交子代F1最高(2.9130);平均有效等位基因数依次为云斑尖塘鳢(2.2570)>杂交子代F1(2.1516)>回交子代F2(2.1061)>线纹尖塘鳢(1.5164);在4个群体中平均观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和香农指数(I*)4个参数的变化范围分别为:0.4891~0.7767、0.2714~0.5193、0.3473~0.4458、0.3662~0.7993。其中,各参数均为线纹尖塘鳢群体最低,平均观测杂合度和香农指数杂交子代F1最高,平均期望杂合度回交子代F2最高,多态信息含量云斑尖塘鳢群体最高,且各群体的平均观测杂合度均高于平均期望杂合度;哈代—温伯格平衡的x2检验结果表明:绝大多数位点发生了偏离(P<0.05);根据Nei’s遗传距离建立的UPGMA聚类图表明:杂交子代F1和回交子代F2聚为一支后再与线纹尖塘鳢聚为一支,而云斑尖塘鳢为另一支,并且无论是杂交还是回交均表现了一定的母本效应。
- 朱晓平骆剑尹绍武胡亚丽胡静祝斐
- 关键词:线纹尖塘鳢云斑尖塘鳢杂交子代回交子代微卫星标记
- 珍稀濒危动物波纹唇鱼的遗传多样性研究
- 尹绍武齐兴柱陈曼真彭艳辉朱晓平
- 1)利用PCR快速筛选法从波纹唇鱼基因组文库中筛选适合遗传多样性分析的微卫星位点,开发出具有自主知识产权的波纹唇鱼微卫星引物24对,利用筛选的引物对波纹唇鱼进行了遗传多样性研究。2)通过23对引物进行PCR扩增并测序,首...
- 关键词:
- 关键词:波纹唇鱼
- 云斑尖塘鳢的分子遗传多样性研究
- 骆剑尹绍武齐兴柱彭艳辉朱晓平
- 该项目以东南亚名贵养殖鱼类云斑尖塘鳢(Oxyeleotrismarmoratus)为研究对象,运用磁珠富集快速分离技术获得云斑尖塘鳢微卫星位点81个,开发适用性微卫星引物29对;建立云斑尖塘鳢AFLP检测技术,优化限制性...
- 关键词:
- 关键词:云斑尖塘鳢分子遗传多样性品种选育
- 基于COⅠ序列的DNA条形码在中国南海裸胸鳝属鱼类中的应用被引量:11
- 2010年
- 为探讨中国南海裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼类系统发育关系,采用DNA条形码技术测定了6种中国南海裸胸鳝的线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因部分序列(504bp)。结合来自GenBank中的分布于日本和3种同样分布于中国南海的裸胸鳝属鱼类的相应同源序列进行比较分析,用邻接法和最大简约法构建分子系统树。结果表明:(1)504个位点中共有187个核苷酸位点存在变异(37.1%);(2)序列变异的转换/颠换比值平均为1.5;(3)细斑裸胸鳝(Gymnothorax fimbriatus)与黑斑裸胸鳝(G.favagineus)之间的同源序列碱基差异只有0.20%,支持二者是同种异名的观点;(4)在NJ树和MP树中,蠕纹裸胸鳝和网纹裸胸鳝聚为一支,位于系统树的基部位置。其余8种聚为另外一支,然后又细分为2个较小的分支。
- 齐兴柱骆剑刘志亮胡静朱晓平彭艳辉尹绍武
- 关键词:DNA条形码系统树
- 云斑尖塘鳢精子的超微结构被引量:3
- 2012年
- 采用扫描电镜和透射电镜观察了云斑尖塘鳢(Oxyeleotris marmoratus)的精子结构。结果显示:扫描电镜下云斑尖塘鳢精子由头部和尾部(鞭毛)组成。头部近似圆形,直径1.98~2.12μm,尾部鞭毛长23.22~32.92μm。透射电镜下云斑尖塘鳢精子由头部、中段和尾部三部分组成。头部细胞核呈扁卵圆形,前端不具顶体,染色质致密,细胞核内偶见小空隙;核膜与质膜间有间隙,其间分布有细胞质、囊泡、溶酶体,在细胞核后端,还分布有5~7个呈环形单层排列的线粒体;植入窝较浅,中段不明显,包括中心粒复合体和袖套;精子尾部的鞭毛细长,轴丝为典型的"9+2"型结构;轴丝外侧具有较发达的侧鳍。
- 胡亚丽刘洋朱晓平尹绍武祝斐
- 关键词:精子超微结构
- 云斑尖塘鳢微卫星标记在两种虾虎鱼亚目鱼类群体间的适用性研究被引量:4
- 2012年
- 利用微卫星DNA-聚合酶链式反应(STR-PCR)技术对已开发的14对云斑尖塘鳢(Oxyeleotrismarmorata)微卫星标记在线纹尖塘鳢(Oxyeleotris lineolatus)和河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)群体间进行通用性分析。结果显示,14对云斑尖塘鳢微卫星标记在线纹尖塘鳢群体均能扩增出特异性条带,在河川沙塘鳢群体中也有10对引物可稳定扩增,其中9对在线纹尖塘鳢群体中具有高度多态性,6对在河川沙塘鳢群体中具有高度多态性。通过这10对通用微卫星标记检测3个种群的平均观测杂合度(Ho)为0.344 9,平均期望杂合度(He)为0.704 3,平均多态信息(PIC)含量为0.536 9。同时获得3个有着较高的通用性微卫星位点(H27、H142和H97),平均PIC值均大于0.5,具有高度多态性,在3种虾虎鱼亚目鱼类中具有较高的通用性,这3个位点在3种虾虎鱼亚目鱼类之间共检测得到6~22个不等的等位基因,并获得1个可以用于鉴别沙塘鳢科与塘鳢科特异基因型的等位基因位点(H97)。因此,通过已开发的云斑尖塘鳢微卫星标记来获得适用相近物种的微卫星标记是可行的。
- 祝斐朱晓平尹绍武张丽娟胡静侯新远胡亚丽
- 关键词:云斑尖塘鳢微卫星标记
- 河川沙塘鳢的含肉率及肌肉营养价值分析被引量:8
- 2012年
- 河川沙塘鳢的含肉率和肌肉营养成分测定结果表明:河川沙塘鳢的含肉率为64.45%;肌肉(鲜重)中粗蛋白、粗脂肪、粗灰分、水分的含量分别为16.70%、0.70%、1.65%、80.01%;肌肉中氨基酸总量为80.94%(干重),含有18种氨基酸。其中8种为人体必需氨基酸,含量为32.67%,占氨基酸总量的40.36%;4种为鲜味氨基酸,含量为31.16%。必需氨基酸指数(EAAI)为72.65%,其氨基酸构成比例符合FAO/WHO的标准。
- 胡亚丽朱晓平尹绍武祝斐
- 关键词:河川沙塘鳢肌肉营养成分氨基酸