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曾海攀
作品数:
3
被引量:33
H指数:3
供职机构:
北京华大基因研究中心
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发文基金:
江苏省自然科学基金
国家自然科学基金
国家重点基础研究发展计划
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相关领域:
农业科学
医药卫生
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合作作者
唐家琪
中国人民解放军南京军区军事医学...
潘秀珍
中国人民解放军南京军区军事医学...
鞠爱萍
中国人民解放军南京军区军事医学...
王长军
中国人民解放军南京军区军事医学...
朱进
中国人民解放军南京军区军事医学...
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北京华大基因...
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军事医学科学...
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中国人民解放...
作者
2篇
曾海攀
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董亚青
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杨银辉
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胡玉洋
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朱晓光
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朱进
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人类致病病毒属水平基因筛查芯片的制备及其在黄病毒属检测中的初步应用
被引量:7
2006年
目的:制备人类致病病毒属水平高通量筛查用基因芯片,并通过检测黄病毒属病毒初步验证其筛查效果。方法:利用Clustal W和BLAST软件设计针对人类致病病毒的属特异性寡核苷酸探针,对探针浓度、杂交温度、杂交时间、不同杂交液及杂交后芯片的洗涤方法进行优化。分别用特异或随机PCR方法从病毒感染的细胞培养上清中扩增病毒核酸,在扩增过程中掺入aa-dUTP并进一步偶联cy5或cy3荧光素进行标记,随后与基因芯片进行杂交,并通过荧光扫描仪对杂交结果进行分析,然后分析检测的特异性和敏感性验证基因芯片的筛查效果。结果:共设计了针对人类医学病毒的1090条寡核苷酸探针及其他阳性、阴性对照探针,其中黄病毒属共46条探针,Tm值为77,67~83.53℃,通过随机或特异PCR扩增8株黄病毒属病毒核酸,在42℃、过夜杂交的条件下,通过基因芯片方法均获得了黄病毒属特异性杂交信号,与其他属病毒之间没有非特异性交叉反应。结论:所制备的基因芯片可用于黄病毒属病毒的快速筛查,本研究为进一步建立大规模病毒性病原体的高通量筛查与鉴定技术平台提供了实验依据。
杨银辉
韩伟国
胡玉洋
康晓平
曾海攀
陈晨
刘洪
朱晓光
刘国振
祝庆余
关键词:
基因芯片
黄病毒
寡核苷酸探针
猪链球菌基因芯片检测方法的研究
被引量:16
2008年
目的建立猪链球菌基因芯片检测方法,实现对猪链球菌种、致病血清型及毒力相关基因的同步检测和鉴定。方法根据GenBank中猪链球菌的相关序列,设计并合成探针,采用点样法制备芯片;检测样本基因组DNA标记后与基因芯片杂交,激光扫描检测信号。结果检测结果显示,针对猪链球菌种、主要致病血清型及主要毒力相关基因设计的寡核苷酸探针可特异地识别对应靶基因,重复性好;而针对不同菌株设计的株特异性探针未获得预期检测效果。结论初步建立猪链球菌基因芯片检测体系,敏感性与特异性高,对于高通量鉴定猪链球菌菌种及其毒力有重要价值。
郑峰
王长军
曾海攀
董亚青
鞠爱萍
潘秀珍
朱进
唐家琪
关键词:
猪链球菌
基因芯片
血清型
毒力
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