吴正超
- 作品数：14 被引量：12H指数：1
- 供职机构：中国科学院南海海洋研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程重要方向项目中国科学院“百人计划”更多>>
- 相关领域：医药卫生天文地球环境科学与工程文化科学更多>>
- 一种非典型角环素类化合物nenestatin A的生物合成基因簇及其应用
- 本发明公开了一种非典型角环素类化合物nenestatin A的生物合成基因簇及其应用。所述的非典型角环素类化合物nenestatin A的生物合成基因簇的核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第3153‑68576位的碱基...
- 张长生蒋晓东张庆波朱义广吴正超聂方玲杨春芳
- 文献传递
- 珠江口沉积物来源链霉菌SCSIO 40020中bafilomycins的鉴定及其生物合成基因簇的异源表达
- 2021年
- 【目的】从珠江口沉积物来源的菌株SCSIO 40020中分离bafilomycins,并对其生物合成基因簇进行克隆和异源表达研究。【方法】通过分析菌株SCSIO 40020的16S rRNA基因序列并构建系统发育树以鉴定菌种,以柱层析法和制备色谱法对次级代谢产物进行分离纯化,借助波谱学手段完成单体化合物的结构鉴定,采用生物信息学分析定位bafilomycins的生物合成基因簇,通过筛选菌株SCSIO 40020基因组的细菌人工染色体文库和接合转移将bafilomycins生物合成基因簇导入3种链霉菌进行异源表达,利用高效液相色谱检测异源表达菌株的发酵产物。【结果】菌株SCSIO 40020被鉴定为链霉菌属菌株,从其发酵产物中分离鉴定了2个单体化合物bafilomycins A1和D。克隆了链霉菌SCSIO 40020中bafilomycins的生物合成基因簇并推导了其生物合成途径,在3种链霉菌中表达产生了bafilomycins。【结论】从珠江口环境中获得了一株产生bafilomycins的链霉菌SCSIO 40020,成功建立了该菌株次级代谢产物生物合成基因簇的异源表达体系,并首次在链霉菌Streptomyces lividans SBT18、Streptomyces coelicolor M1154和Streptomyces albus J1074中进行了表达,获得了bafilomycins,为后续bafilomycins结构类似物的生产和链霉菌SCSIO 40020中新结构活性化合物的挖掘奠定了基础。
- 翟诗岚刘威吴正超朱义广张文军张长生马亮
- 关键词：链霉菌生物合成基因簇异源表达
- 南海北部最小含氧带水下滑翔机观测结果初步分析被引量：1
- 2022年
- 最小含氧带(Oxygen Minimum Zone,OMZ)是指海洋中层水体处存在的稳定的溶解氧(Dissolved Oxygen,DO)极小值层,OMZ的分布与变化对南海生态系统和生地化循环具有重要意义。本文利用2019年7-9月“海翼”号水下滑翔机(Sea-wing Glider)在南海北部陆坡区的组网观测数据,对南海北部陆坡区OMZ的空间分布特征进行了分析。结果显示,在垂向上,研究区域内DO极小值层出现在深度约700~900m处,其浓度约为80~100μmol·L^(-1),且700~900m深度范围内DO浓度变化不大,形成了厚度约为200m的OMZ。在水平方向上,OMZ自陆坡西南部起向东北方向延伸,厚度由西南至东北逐渐变薄,整体呈楔形分布,并在靠近吕宋海峡处逐渐消失。此外,本研究还选取了两台水下滑翔机7-8月连续两周内的观测数据,经计算显示,OMZ区域内的DO浓度在跨陆坡方向上的平均变化速率为0.023μmol·L^(-1)·d^(-1)(增加),在沿陆坡方向上为-0.034μmol·L^(-1)·d^(-1)(减少)。沿吕宋海峡入侵南海的高氧水能够解释OMZ东北部DO浓度局部升高的现象,OMZ的分布特征和形成原因与海水的平流运动、水团分布和水体层化等物理过程,以及生物呼吸、有机物分解和还原性物质的氧化等多种影响因素有关。
- 马梦真李芊吴正超吴正超俞建成
- 关键词：南海北部
- 新化合物及其制备方法和在制备抗菌抗肿瘤药物中的应用
- 本发明公开了链霉菌、新化合物及其制备方法和在制备抗菌抗肿瘤药物中的应用。该链霉菌Streptomyces？sp.SCSIO？10428能够产生三种napyradiomycins类新抗生素化合物4-dehyd？ro-4a-...
- 张长生吴正超李苏梅李洁库马·萨乌拉夫张庆波张海波张文军张偲
- 一种新的酯酶及其编码基因和应用
- 本发明公开了一种新的酯酶及其编码基因和应用。酯酶EST04211，其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。酯酶EST04211的基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明从来源于印度洋深海的芽孢杆菌SCSI...
- 胡云峰梁甲元孙爱君张云吴正超邓盾李洁田新朋
- 文献传递
- 链霉菌、新化合物及其制备方法和在制备抗菌抗肿瘤药物中的应用
- 本发明公开了链霉菌、新化合物及其制备方法和在制备抗菌抗肿瘤药物中的应用。该链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428能够产生三种napyradiomycins类新抗生素化合物4-dehyd ro-4a-...
- 张长生吴正超李苏梅李洁库马萨乌拉夫张庆波张海波张文军张偲
- 文献传递
- 永兴岛白穗软珊瑚共附生放线菌筛选及部分活性次级代谢产物的鉴定被引量：11
- 2013年
- 【目的】从白穗软珊瑚中分离和鉴定共附生放线菌,运用PCR技术对所分离的放线菌进行I型聚酮合酶(PKS)筛选,研究其次级代谢产物。【方法】使用11种培养基对白穗软珊瑚共附生放线菌进行分离、鉴定,构建16S rRNA基因系统发育进化树,以基于I型PKS的KS基因设计的简并引物对所分离放线菌进行基因筛选,对阳性菌株用3种培养基发酵检测,对目标菌株进行放大规模发酵分离鉴定次级代谢产物。【结果】从白穗软珊瑚中分离到20株共附生放线菌,包括链霉菌属10株、迪茨氏菌属2株和盐水孢菌属8株,筛选获得18株I型PKS阳性菌株,并从菌株Salinospora arenicola SH04中分离到化合物rifamycin S和rifamycin W。【结论】首次从珊瑚共附生环境中分离得到海洋专属性稀有放线菌盐水孢菌属,并以I型PKS基因筛选为指导,分离鉴定了聚酮类化合物rifamycins,为研究软珊瑚共附生可培养放线菌的多样性和基于基因筛选指导分离次级代谢产物提供了可靠依据。
- 马亮张文军朱义广吴正超Kumar Saurav黄晖张长生
- 关键词：放线菌利福霉素
- 去吸附法测定珠江口颗粒附着细菌的丰度特征及其环境因子耦合研究
- 2020年
- 海洋颗粒有机碳(POC)的输出通量决定了生物泵的运作效率,海洋颗粒上附着细菌的丰度和活性影响POC向海洋内部的传输,对全球碳封存起关键作用。为了更准确地评估珠江口近岸浊度较大水域中颗粒附着细菌的丰度特征,本文在国内首次报道运用去吸附法对颗粒附着细菌进行直接测定,避免了间接测定中因总细菌计数不准确而可能产生的偏差,同时将该丰度特征与相关环境因子进行耦合研究。结果显示,珠江口3个站位均是2~20μm粒级颗粒上面的附着细菌丰度占优势,其中珠海香洲港码头水域的丰度最大(4.21×10^9 cells/L),接下来是中大码头(1.13×10^9 cells/L)和万山岛水域(0.27×10^9 cells/L)。颗粒附着细菌丰度最大的香洲港码头对应的Chl a含量相对较低,可能是由于河口再悬浮颗粒有机质支撑了细菌的生长。此外,珠江口水体营养盐的浓度和比例也影响着颗粒附着细菌的生长。
- 葛在名吴正超刘子嘉周卫文董园董园
- 关键词：丰度珠江口环境因子
- 海洋(深海)来源放线菌次级代谢产物研究
- 张文军张庆波李苏梅吴正超张海波袁呈山黄春帅郑六眷张长生
- 一种新的酯酶及其编码基因和应用
- 本发明公开了一种新的酯酶及其编码基因和应用。酯酶EST04211，其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。酯酶EST04211的基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明从来源于印度洋深海的芽孢杆菌SCSI...
- 胡云峰梁甲元孙爱君张云吴正超邓盾李洁田新朋
