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严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒核蛋白的鉴定与分析被引量：11: 2003年; 利用蛋白质组学技术,对纯化的严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒颗粒所含核蛋白进行初步分离与鉴定。质谱分析结果最终表明,SARS冠状病毒核蛋白的分子量位于47kD与52kD之间,所获得的SARS冠状病毒核蛋白的质谱分析数据覆盖了所预测病毒核蛋白氨基酸序列的87%,且符合率为100%。从而首次从蛋白质水平对SARS冠状病毒核蛋白的氨基酸序列进行了证实。; 周世力卫灿东熊朝晖段淑敏李德新王建伟冷文川梁米芳金奇侯云德; 关键词：严重急性呼吸综合征 SARS 冠状病毒核蛋白蛋白质组学

中国柯萨奇病毒A组16型部分VP1区序列测定及系统进化分析被引量：19: 2005年; 利用1999～2004年连续6年从中国深圳及北京地区分离的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)毒株的部分VP1区基因序列进行分析和研究,试图找出中国Cox.A16的种系进化规律和分型依据.6株Cox.A16病毒部分VP1区核苷酸和氨基酸同源性均较高,相互间核苷酸同源性为94.5%～98.0%,氨基酸同源性为97.8%～100%.6株中国分离株与Cox.A16国际参考株相比,部分VP1区核苷酸同源性高于78.2%,氨基酸同源性高于为93.3%.基因系统进化分析表明,中国大陆分离的6株Cox.A16与中国台湾流行株Tainan-5079-98(AF177911),与4株日本分离株、瑞典株及美国株GA95-2095(AF081613)、PA94-5753(AF081628)的关系均较近,核苷酸同源性大于93.3%.了解我国Cox.A16流行株的遗传学背景和种系进化关系,对有效地预防和控制Cox.A16流行有重要意义.; 卫灿东李琳琳何雅晴徐星晔薛颖金奇; 关键词：柯萨奇病毒A组16型手足口病系统进化分析 VP1区中国分离株儿童

应用全基因组PCR扫描方法进行猪链球菌基因组结构的比较分析: 2007年; 2005年,在中国四川局部地区爆发人感染猪链球菌疫情,因其感染人数多,病死率高引起关注,为了确定该致病菌是否发生变异,通过应用全基因组PCR扫描方法(WGPScaning)、多位点序列分型技术(MLST)以及毒力相关基因的序列测定,比较分别来自本次疫情中的病人和病猪、以前流行期间感染的病人分离的菌株以及网上公布的来自欧洲的猪链球菌基因组序列,结果显示各菌株的基因组结构相似,毒力相关基因没有差异,所有菌株都属于ST1序列群,说明本次引起四川疫情的菌株未发生明显的基因组结构的改变.; 熊朝晖卫灿东杨剑彭俊平徐星烨王宇金奇; 关键词：猪链球菌多位点序列分型

肠道病毒71型感染前后宿主细胞蛋白质组的二维液相色谱分离和比较被引量：6: 2005年; 以肠道病毒71型及其宿主细胞为研究主体,建立了一种二维液相色谱分离和分析比较病毒感染前后细胞蛋白表达谱的方法.该方法以高效液相色谱(HPLC)为技术平台,对细胞裂解物先后进行一维色谱聚焦分离和二维反相色谱分离.利用ProteoVue软件将二维色谱数据转换成模拟胶图,再利用DeltaVue软件对感染前后的宿主蛋白表达谱进行比较和分析,找出差异蛋白.二维液相色谱分离法能够根据蛋白的等电点和疏水性建立精确的细胞蛋白表达图谱,每0.2个pH为一个收集区段,在pH8.5～3.9的范围内可见蛋白条带约1 200条.该方法良好的重现性、自动化以及结果分析的简易化,使之在细胞表达谱差异显示中的应用潜力巨大,并且为研究病毒与宿主相互作用提供了新的方法和思路.; 朱俊萍孙立连卫灿东李琳琳金奇; 关键词：蛋白质组肠道病毒71型宿主细胞

红色毛癣菌分泌性蛋白酶的分析被引量：2: 2005年; 分泌性蛋白酶是红色毛癣菌致病的潜在毒力因子。在构建红色毛癣菌6个不同时间段cDNA文库的基础上,共获得了9683条uniqueESTs,通过生物信息学分析从中得到了18个可能的分泌性蛋白酶的EST序列,包括4个分泌性肽酶、1个分泌性金属蛋白酶、2个细胞外丝氨酸蛋白酶、1个分泌性天冬氨酸蛋白酶、9个分泌性枯草杆菌蛋白酶样丝氨酸蛋白酶、1个空泡丝氨酸蛋白酶。这些分泌性蛋白酶在红色毛癣菌感染过程中可能分别与其获得营养、扩大侵袭范围及激起宿主免疫应答有关,这些结果为进一步研究红色毛癣菌感染和发病机制提供了重要的分子基础和线索。; 冷文川王玲玲卫灿东杨剑金奇

严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒S蛋白的鉴定与分析被引量：2: 2003年; 利用293细胞对SARS病人样品进行病毒扩增,培养上清中病毒颗粒经过纯化后,利用蛋白质组学技术,对纯化得到的SARS冠状病毒颗粒蛋白进行初步分离与鉴定。其中质谱分析结果最终表明,分子量约150kD的蛋白质的氨基酸序列与SARS-CoV基因组所预测S蛋白质序列高度吻合,从而首次从蛋白质水平对SARS冠状病毒S蛋白的氨基酸序列进行了证实。; 周世力熊朝晖冷文川段淑敏李德新王健伟梁米芳卫灿东喻子牛金奇侯云德; 关键词：严重急性呼吸综合征冠状病毒 S蛋白蛋白质组学 SARS

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卫灿东