陈峰
- 作品数:3 被引量:26H指数:2
- 供职机构:清华大学医学院生物医学工程系更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 鉴定水稻中一个新的专一结合GCC元件的AP2/EREBP族转录因子被引量:5
- 2006年
- TSH1,是通过搜寻GenBank的EST库而获得的一个来源于水稻的含AP2/EREBP保守结构域的蛋白质.为了详细分析TSH1蛋白与其DNA顺式元件的结合特性,首先采用传统的凝胶阻滞实验和酵母单杂交技术,证实TSH1在体内和体外均专一性地结合于GCC元件,然后利用原子力显微镜技术精确测量了TSH1蛋白与GCC元件在单分子水平的相互作用力.结果表明,GST-TSH1与DRE元件没有特异性的结合,而GST-TSH1与GCC元件结合力的大小为(83.9±2.2)pN,这种特异性的结合可以被加入的游离TSH1蛋白明显降低.GST蛋白和突变GCC元件作为负对照显示出与GCC元件无特异性作用力.以上结果充分证明,TSH1是专一性地与GCC元件相作用的转录因子,而且原子力显微镜对于检测转录因子与DNA相互作用时单碱基的突变十分灵敏.通过比较几种评估转录因子与DNA顺式元件结合特异性的方法,阐述了原子力显微镜技术的特点及优越性.
- 陈峰余军平方晓红张贵友
- 关键词:AP2/EREBP转录因子原子力显微镜
- 酵母单杂交的原理与应用实例被引量:19
- 2001年
- 许多诱导型基因的表达 ,都受特定的转录因子和顺式元件调控。要阐明各种信号传递途径与基因表达调控的机理 ,克隆和鉴定转录因子是关键。近年来酵母单杂交方法被广泛应用于克隆和鉴定各种动植物的转录因子 ,本文以拟南芥DREB转录因子的克隆为例 。
- 陈峰李洁张贵友刘强
- 关键词:酵母单杂交基因表达顺式作用元件转录因子
- 原子力显微镜(AFM)研究转录因子与DNA顺式作用元件间的特异性相互作用力被引量:2
- 2004年
- 用原子力显微镜研究了转录因子ZmDREB1A与顺式作用元件DRE(脱水应答元件)的特异性相互作用.ZmDREB1A与核心序列为ACCGAC的DRE元件和核心序列为AGCCGCC的ERE元件(乙烯应答元件)间相互作用力的比较结果表明,ZmDREB1A能特异地结合DRE元件,而与ERE元件间无特异性的相互作用.另外,通过泊松统计的方法计算出ZmDREB1A转录因子与DRE元件间的单分子相互作用力为999pN.研究结果表明,原子力显微镜可作为一种灵敏、可靠的方法来研究转录因子与DNA顺式作用元件间特异性的相互作用力.与传统的凝胶阻滞实验相比,原子力显微镜在转录因子的功能分析上具有耗样量低、灵敏度高、无需放射性标记等优势.
- 秦峰江雅新马新勇陈峰方晓红白春礼李一勤
- 关键词:原子力显微镜转录因子AFM