陈佳园
- 作品数：7 被引量：11H指数：2
- 供职机构：广东药科大学基础学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- SGTA基因及其蛋白的生物信息学分析被引量：1
- 2015年
- [目的]对SGTA基因及其蛋白的结构和特征进行生物信息学分析,为研究SGTA与肿瘤形成和发展的相关性提供理论基础。[方法]运用生物信息学数据库和软件对SGTA基因的结构、单核苷酸多态性位点(SNP)、SGTA基因与其他基因的相互作用网络、SGTA蛋白的理化性质、二级结构、蛋白结构域、蛋白翻译后修饰、蛋白质之间相互作用网络进行分析。[结果]人SGTA基因有5种可变剪接产物,编码区存在78个SNP位点,其中错义突变31个,无义突变1个。人SGTA蛋白由313个氨基酸组成,是稳定性不高的亲水蛋白,α-螺旋是其主要二级结构元件,属于TRP超家族,预测有3个磷酸化激酶修饰位点和数个潜在泛素化修饰位点。与SGTA存在相互作用的基因和蛋白多数与维持体内蛋白质稳定的分子伴侣功能相关。[结论]SGTA基因及其蛋白的生物信息学分析为进一步实验研究其在肿瘤形成和发展中的地位及调控机制奠定了基础。
- 顾取良陈佳园郐一贺胡曦文杨永霞王丽京
- 关键词：生物信息学
- 雷公藤甲素对乳腺癌细胞增殖的抑制作用被引量：6
- 2016年
- 目的探究雷公藤甲素对乳腺癌细胞MDA-MB-231和MCF-7增殖的抑制作用。方法取培养的乳腺癌细胞MDA-MB-231和MCF-7,用雷公藤甲素按不同浓度处理24 h后提取细胞蛋白和RNA,用Western blot和RT-PCR来检测磷脂酶D1(PLD1)和c-Myc的表达。结果雷公藤甲素能够抑制乳腺癌细胞MDA-MB-231和MCF-7的增殖,并且在MDA-MB-231细胞中下调PLD1和c-Myc的表达。结论雷公藤甲素能够抑制乳腺癌细胞MDA-MB-231及MCF-7的增殖。
- 陈佳园顾取良郐一贺欧意桃王丽京李卫东
- 关键词：雷公藤甲素乳腺癌
- 命运分子cNumb在原肠期胚胎的表达及其生物信息学分析被引量：1
- 2015年
- 目的探讨命运分子c Numb在原肠期胚胎中的表达情况及其基因和编码蛋白的基本生物学特征。方法利用原位杂交技术检测c Numb基因在原肠期鸡胚中的表达情况,同时应用生物学软件和在线平台对c Numb基因及其编码蛋白进行生物信息学分析。结果 c Numb mRNA在鸡胚4期开始表达于原条顶端,随发育过程逐渐扩展至亨氏节、头突和神经管,但表达区域仍相对集中。Numb基因在不同物种中具有较高保守性,c Numb编码的蛋白属于胞内蛋白,包含磷酸酪氨酸相互作用结构域和多个潜在磷酸化位点,可参与调节多种细胞生物学过程。结论通过生物信息学分析获得了c Numb基因及其蛋白的生物学特征,为进一步研究Numb在胚胎神经发育中的调控机制奠定了基础。
- 顾取良陈佳园王广徐涛郐一贺杨雪松王丽京
- 关键词：NUMB胚胎发育生物信息学分析
- SGT基因杂合缺失小鼠血液生理生化指标分析
- 2017年
- 目的分析SGT基因杂合缺失对不同年龄小鼠血液指标和代谢的影响。方法分别采集10周龄、26周龄SGT基因杂合缺失(SGT^(+/-))小鼠和野生型小鼠眼眶血液,用全自动血细胞分析仪和生化分析仪检测常用血液生理指标和生化指标,进行不同年龄和基因型间统计比较。结果与同基因型低龄小鼠对比,高龄小鼠多项血液生理生化指标均发生增龄性改变。与同龄野生型对照相比,10周龄SGT^(+/-)小鼠大血小板比率降低,未结合型胆红素浓度降低(P<0.05),其余指标均未见统计学差异;26周龄SGT^(+/-)小鼠血小板计数、血小板比容和中性粒细胞计数降低,碱性磷酸酶、未结合型胆红素、胆固醇及甘油三酯等指标改变有统计学意义(P<0.05)。结论SGT基因杂合缺失能够诱发高龄小鼠部分血液、血清生化指标的改变。
- 顾取良黄韧郐一贺陈佳园郑凌云王丽京
- 关键词：SGT基因缺失血液学血液生化
- 共分子伴侣SGTα的二级结构及其B细胞抗原表位预测
- 2015年
- 目的预测共分子伴侣SGTα蛋白的二级结构及其潜在的B细胞抗原表位特性。方法以NCBI的蛋白质数据库中得到的人SGTα蛋白氨基酸序列为基础,利用PSIPRED、Prot Scale、IEDB及Bepipred等生物信息学在线资源分析其二级结构特征及亲水性、表面可及性、柔韧性和抗原指数等,并与其同源物SGTβ进行比对,预测人SGTα蛋白可能的B细胞线性抗原表位。结果 SGTα蛋白的二级结构组成元件主要为α-螺旋和无规卷曲。潜在的B细胞线性抗原表位存在于69~87、207~211、263~269区段;经与SGTβ蛋白序列比对,SGTα蛋白的N端69~87区段,即KEMPQDLRSPARTPPSEED肽段可能为人SGTα的B细胞抗原优势表位。结论通过对人SGTα蛋白进行生物信息学分析获得了SGTα蛋白的二级结构和潜在的B细胞抗原表位,为进一步利用合成肽制备抗SGTα的抗体提供了依据。
- 陈佳园顾取良郐一贺欧意桃郑凌云王丽京李卫东
- 关键词：抗原表位生物信息学分析
- p110δ突变失活的Apc^(Min/+)结直肠癌癌前病变小鼠模型的建立被引量：1
- 2014年
- 目的:建立p110δ突变失活的ApcMin/+结直肠癌癌前病变小鼠模型,为研究p110δ在小鼠结直肠癌癌前病变中的作用提供实验模型。方法:将C57BL/6J背景的ApcMin/+结直肠癌癌前病变小鼠与p110δ突变失活小鼠(p110δD910A/D910A)进行杂交建系,通过PCR技术鉴定子代小鼠基因型,获得p110δ突变失活的ApcMin/+小鼠。对适龄小鼠进行肠道取材,亚甲蓝染色后,观察肠道结构,对腺瘤和微腺瘤进行统计。肠道组织进行石蜡包埋、切片,做HE染色进行进一步观察。结果:获得p110δ突变失活的ApcMin/+杂交鼠(ApcMin/+;p110δD910A/D910A)并得以稳定传代。ApcMin/+;p110δD910A/D910A杂交小鼠的肠道组织中,腺瘤数目和体积比ApcMin/+结直肠癌癌前病变小鼠均有减少。结论:成功建立p110δ突变失活的ApcMin/+结直肠癌癌前病变小鼠模型,并得到小鼠肠道肿瘤的初步表型,为进一步研究p110δ在肠道肿瘤发生发展中的作用提供重要的工具动物。
- 胡曦文章倩倩雷岩刘红英周大磊陈佳园王丽京
- 关键词：转基因小鼠
- 靶向抑制巨噬细胞Act1表达对溃疡性结肠炎的作用被引量：2
- 2016年
- 目的探讨巨噬细胞NF-κB活化因子1(nuclear factor kappa B activator 1,Act1)在炎症性肠病中的作用。方法以巨噬细胞Act1表达被靶向抑制的小鼠(anti-Act1)为研究对象,利用葡聚糖硫酸钠(dextran sodium sulfate,DSS)诱导溃疡性结肠炎模型,通过检测小鼠体重变化、便血情况、粪便黏稠度等进行疾病活动指数评分,对结直肠组织进行HE染色评价炎症严重程度,免疫组化方法分析白细胞和巨噬细胞等的浸润情况并用RT-q PCR法检测相关细胞因子的表达变化。结果在DSS诱导7 d后与C57小鼠相比,anti-Act1小鼠结直肠炎症指标评分较低,巨噬细胞等浸润数量较少,TNF-α、IL-1β和IL-6 mRNA表达较低。结论靶向抑制巨噬细胞Act1表达能够减轻DSS诱导的溃疡性结肠炎。
- 郐一贺王丽京邓慧君陈佳园顾取良
- 关键词：溃疡性结肠炎巨噬细胞
