郭丽媛
- 作品数:4 被引量:1H指数:1
- 供职机构:广州医学院第三附属医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金广东省医学科学技术研究基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- X染色体倾斜失活人胚胎干细胞的拷贝数变异
- 2013年
- 背景:倾斜性与随机X染色体失活的人胚胎干细胞拷贝数变异是否存在差异不清楚。目的:在全基因组水平分析倾斜性X染色体失活的人胚胎干细胞的拷贝数变异情况,分析其涵盖基因及其对细胞功能产生的影响。方法:3株倾斜性X染色体失活细胞为研究组,两株随机X染色体失活细胞为对照组。运用美国Affymetrix公司Cytogenetics Whole-Genome2.7M芯片对其进行全基因组拷贝数变异分析,数据经ChAS软件、OMIM等工具分析,在3株倾斜性X染色体失活细胞中寻找相同拷贝数变异区域及其涵盖基因。结果与结论:①研究组中大于50kb的拷贝数变异数均超过130个,高于对照组的平均36个,两组中拷贝数变异改变均以重复为主(>70%)。②研究组中共发现9个共同拷贝数变异区域,分布于1q22、1p34.1、6q16.3、7q31.32、11q13.1、16q12.2、19p13.12、Xp22.33及Xq26.2,均为3个拷贝的重复,总共涵盖19个基因。对照组中这些区域及基因均为正常2个拷贝。③拷贝数变异涵盖基因多与DNA及核苷酸结合等功能相关,Xq26.2区域的GPC3基因突变与倾斜性X染色体失活可能有关联。结果表明倾斜性X染色体失活细胞相对随机失活细胞具有更多的微小基因组改变,拷贝数变异涵盖的重要基因可能对人胚胎干细胞功能产生不利影响。
- 刘维强何文智曹定娅李洁亮郭丽媛黎青孙筱放
- 关键词:干细胞拷贝数变异国家自然科学基金
- 不同氧体积分数对人胚胎干细胞基因表达谱的影响被引量:1
- 2012年
- 背景:低氧培养人胚胎干细胞的相关研究主要集中在干细胞多能性的维持及分化方面,而低氧对人胚胎干细胞基因表达水平的影响研究甚少。目的:观察不同氧体积分数对人胚胎干细胞基因表达谱的影响。方法:分别在低氧(体积分数5%O2)和常氧(体积分数21%O2)的条件下持续培养FY-hES-7细胞,收集晚期(第52代)细胞,运用全基因组表达谱芯片技术检测不同氧体积分数组FY-hES-7细胞的基因表达谱,并进行差异基因的功能富集分析及通路分析。结果与结论:与常氧组相比,低氧组表达上调(>2倍)的基因1840个,表达下调(>2倍)的基因1676个。利用基因本体分析发现低氧组表达上调基因与细胞表面受体信号转导、免疫反应、离子转运、生物代谢及细胞活动等功能相关,而表达下调基因则与转录调控,依赖DNA的转录调控、神经分化、细胞形态、胚胎形态、胚胎器官及各系统发育等功能相关。通路分析发现低氧组表达上调的基因与细胞因子受体的相互作用、免疫反应以及造血系统等通路的改变相关,而表达下调的基因则多与胚胎发育及肿瘤通路改变相关。不同氧体积分数下长期培养的人胚胎干细胞基因表达谱存在明显的差异,低氧组出现差异表达基因的功能分析表明低氧有助于人胚胎干细胞的自我更新,防止分化及降低成瘤性。
- 郭丽媛刘维强何文智黎青孙筱放
- 关键词:人胚胎干细胞表达谱干细胞
- 低氧对人胚胎干细胞多能性维持及印迹基因表达稳定性的影响
- 2012年
- 目的研究低氧对人胚胎干细胞(hESC)生物学特性维持及印迹基因表达状态的影响。方法在低氧(5%O2)条件下持续培养FY-hES-7细胞并采用细胞免疫荧光染色、RT-PCR等方法对其胚胎干细胞特性进行鉴定。运用全基因组基因表达谱芯片技术及实时荧光定量PCR方法检测FY-hES-7早期(第32代)和晚期(第52代)细胞的55个印迹基因表达状态。所有检测同时以常氧(21%O2)培养作为对照。结果低氧条件下长期培养的FY-hES-7细胞具有和常氧条件下培养相似的生物学特性,阳性表达干细胞表面标志SSEA-3、SSEA-4、TRA-1-60、TRA-1-81及碱性磷酸酶(AKP),但细胞克隆形态较常氧培养下典型,且未分化状态保持时间较常氧条件下更长。低氧长期培养后FY-hES-7细胞的55个印迹基因中,有15个印迹基因(27.27%)表达发生了变化(上调8个,下调7个),而常氧培养后则有39个印迹基因表达水平有变化(70.91%)(上调21个,下调18个),氧浓度对印迹的影响差异具有统计学意义(P〈0.05)。结论低氧更有利于hESC生物学特性的维持。长期培养能对hESC的印迹表达产生影响,但低氧培养条件下hESC的印迹稳定性要明显好于常氧培养。
- 郭丽媛刘维强何文智孔舒孙筱放
- 关键词:细胞低氧胚胎干细胞印迹基因多能干细胞稳定性
- 吸烟与抗氧化基因NRF2协同影响精液质量
- 目的 研究吸烟与抗氧化基因对生精发育的协同影响.方法 分别检测314名重度吸烟和314非吸烟男性的抗氧化基因NRF2的单核苷酸多态(SNP),过氧化氢酶(CAT)、超氧化物歧化酶-2(SOD-2)和谷胱甘肽转硫酶-M1(...
- 余波澜刘丹周华郭丽媛孙筱放
- 关键词:NRF2吸烟
- 文献传递