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荧光实时定量PCR检测肺癌组织表皮生长因子受体基因突变的临床应用价值——附71例分析被引量：11: 2006年; 目的建立1种检测表皮生长因子受体(epidermalgrowthfactorreceptor,EGFR)基因突变的荧光实时定量PCR的新方法,并探讨应用这种方法检测肺癌组织EGFR基因突变的临床应用价值。方法通过自行设计探针及引物,应用荧光实时定量PCR方法,检测71例女性非小细胞肺癌患者的肺癌组织中EGFR基因的第19号和第21号外显子上的突变情况,并与直接测序法比较。结果中国女性非小细胞肺癌的病人中EGFR基因的突变率为30%(21/71);荧光实时定量PCR与直接测序法的特异度符合率是95%(20/21),敏感度符合率是100%,检测时间为直接测序法的1/12,而且结果判读直观。结论应用荧光实时定量PCR检测肺癌组织中的EGFR基因特定位点的突变是一种快速、可靠的方法,具有较高的临床应用价值。; 张海芳邓玲黄马燕邵建永; 关键词：聚合酶链反应表皮生长因子受体基因突变

用原代细胞培养和人全基因表达谱芯片筛选鼻咽癌差异表达基因被引量：4: 2007年; 目的利用细胞的原代培养技术及人全基因表达谱芯片技术初步筛选出鼻咽癌差异表达基因,以发现与鼻咽癌发生、发展相关的新的候选基因。方法分别用1例鼻咽癌细胞株C666及5例鼻咽癌培养出的原代细胞和3例鼻咽正常上皮的原代细胞,进行基因表达谱分析,并以荧光定量PCR及免疫组织化学验证芯片结果。结果原代培养的鼻咽癌细胞和鼻咽正常上皮细胞通过细胞角蛋白的免疫细胞化学染色、EBER1原位杂交和EBV-DNA荧光定量PCR证实;鼻咽癌原代细胞和鼻咽正常上皮原代细胞的基因表达谱有显著差异;4例以上共同表达的差异基因有493个,包括上调基因264个,下调基因229个。荧光定量PCR及免疫组织化学结果和芯片结果一致。结论用原代培养细胞及人类全基因组基因芯片构建基因表达谱能够准确、高效地筛选出鼻咽癌相关的差异表达基因,该基因表达谱的建立为研究鼻咽癌分子生物学机制、鼻咽癌的分子分型和分子诊断提供了重要的分子依据。; 李瑞平邵建永邓玲曾木圣宋立兵李满枝吴秋良; 关键词：寡核苷酸芯片基因表达谱原代细胞培养

鼻咽癌组织线粒体DNA突变的研究被引量：4: 2005年; [目的]通过检测鼻咽癌组织中线粒体DNA(m itochodrialDNA,m tDNA)部分区域的突变,探讨m tDNA突变在人鼻咽癌发生中的作用。[方法]提取23例鼻咽癌组织及其同一患者外周血白细胞的总DNA,经PCR扩增m tDNA,产物直接测序测定m tDNA序列。[结果]23例鼻咽癌组织中8例(34.8%)发现33个突变,包括点突变27个,插入突变3个,缺失突变3个;这些突变分布于m tDNA序列中,27个m tDNA突变位于D鄄loop区,其中21个是属于基因库中的多态变化,6个为新发现的突变;另外6个m tDNA突变位于线粒体编码区。[结论]鼻咽癌组织线粒体DNA的D鄄loop区是一个高度多态性和突变性的区域,m tDNA的突变可能与鼻咽癌的发生有一定的联系,有望成为肿瘤诊断的分子标记。; 庞玲娟邵建永梁小曼邓玲黄马燕; 关键词：鼻咽肿瘤线粒体DNA 突变

乳腺癌差异表达的MicroRNA的筛选研究被引量：27: 2009年; 【目的】应用miRNA芯片技术筛选乳腺癌及癌旁组织差异表达的miRNA,发现与乳腺癌相关的miRNA,为进一步阐明其在乳腺癌发病机制中的作用打下基础。【方法】收集8例新鲜的乳腺癌及其癌旁组织,抽提总RNA并分离出小RNA进行Cy3荧光标记,将标记的小RNA在miRNA芯片上进行杂交反应,应用实时定量RT-PCR方法验证miRNAs芯片结果的可靠性。【结果】对芯片数据进行SAM分析,结果筛选获得16个乳腺癌相关miRNAs,相对于癌旁组织,在乳腺癌组织中9个miRNAs表达上调,7个miRNAs表达下调。其中显著上调的有miR-21,miR-365,显著下调的有miR-497,miR-31。【结论】筛选得到乳腺癌miRNA差异表达谱,其可能与乳腺癌的发生发展有关。; 黄秀芳邵建永颜黎栩李晓霞杜紫明邓玲梁小曼; 关键词：MIRNA 乳腺癌 MIRNA芯片实时定量RT-PCR

MMP9基因单核苷酸多态性与鼻咽癌遗传易感性的关系: 2013年; 目的研究MMP9基因单核苷酸多态性与广东人鼻咽癌患病风险及临床病理分期的关系。方法以聚合酶链反应(PCR)和限制性片段长度多态性(RFLP)分析方法检测433例鼻咽癌患者和437例健康对照MMP9基因C-1562T和第6外显子R279Q基因型。结果吸烟显著增加鼻咽癌的患病风险(OR=4.01,95%CI=2.86-5.63)。MMP9基因C-1562T和R279Q基因型频率病例组与对照组相似,均未能增加鼻咽癌的发病风险,-1562CT/TT基因型相对于CC基因型Ad OR=0.99,95%CI=0.70-1.39;279RQ/QQ基因型相对于RR基因型OR=0.96,95%CI=0.70-1.32;而且与吸烟增加鼻咽癌发病风险无交互作用。鼻咽癌病例组中,-1562CT/TT和RQ/QQ基因型并未表现出更高的T分期(经年龄、性别和吸烟校正后的OR值分别为1.23和0.84,P>0.05)和淋巴结转移潜能(经年龄、性别和吸烟校正后的OR值分别为0.88和0.68,P>0.05)。结论 MMP9基因C-1562T和第6外显子R279Q多态性与广东地区鼻咽癌患病风险无关,可能不是广东人鼻咽癌发病遗传易感因素。; 黄马燕邓玲王芳邵建永; 关键词：基质金属蛋白酶多态性鼻咽肿瘤

PTEN基因缺失与EGFR突变型非小细胞肺癌患者EGFR-酪氨酸激酶抑制剂疗效的关系被引量：4: 2015年; 目的探讨PTEN基因缺失与EGFR突变型非小细胞肺癌患者EGFR酪氨酸激酶抑制剂的疗效关系。方法收集169例使用EGFR-TKI的EGFR基因突变型非小细胞肺癌,采用LSI PTEN/CEP10探针对组织标本进行PTEN基因拷贝数的检测,并分析PTEN基因缺失与患者临床病理学及EGFR-TKI的疗效关系。结果在169例NSCLC病例中5例（3.0%）PTEN基因杂合性缺失,杂合性缺失组与非缺失组ORR（0.0%对42.5%）及DCR（60.0%对92.5%）无显著差异（P分别0.078及0.058）。PTEN基因缺失组PFS及OS分别为4.9月及13.2月,显著低于非缺失组PFS 12.1月（HR=3.64,95%CI=1.57~9.00,P=0.002）及28.1月（HR=2.86,95%CI=1.04~7.89,P=0.034）。结论 PTEN基因缺失可能作为EGFR突变型非小细胞肺癌患者EGFR-TKI原发性耐药的有效指标。; 张旭王芳邓玲汤涛吴小延张晓袁群芳; 关键词：肺癌 EGFR PTEN 酪氨酸激酶抑制剂

上皮样胶质母细胞瘤伴Braf V600E突变型的影像学特征: 2023年; 目的:探讨上皮样胶质母细胞瘤伴Braf V600E突变型的影像学特征,以提高对本病的认识及诊断水平。方法:回顾性分析2017年3月-2023年1月于中山大学肿瘤防治中心经手术病理证实的8例上皮样胶质母细胞瘤伴Braf V600E突变型患者的临床资料以及影像学表现。结果:8例上皮样胶质母细胞瘤患者大脑半球均可见不同程度受累,1例病变位于额叶,1例病变位于颞叶,1例病变位于颞顶叶,2例病变位于额叶及顶叶,1例病变位于额叶及胼胝体,1例病变位于顶叶及左侧脑室三角区。4例伴不同程度囊变、坏死,8例均有明显瘤周水肿,两例出血,未见钙化。弥散加权成像(diffusion-weighted imaging,DWI)序列显示4例呈高信号。8例患者完成MRI增强扫描,2例无强化,3例轻度强化,3例见环形、不均匀及明显强化。8例均存在不同程度占位效应。3例术后出现肿瘤复发。结论:上皮样胶质母细胞瘤伴Braf V600E突变型的影像学具有一些特定的表现,提高对本病的认识十分重要,明确诊断仍需依赖病理学以及免疫组织化学结果。; 邓玲古家美王芳杜紫明吴小延; 关键词：上皮样胶质母细胞瘤影像学特征

肝癌患者术前外周血甲胎蛋白mRNA检测与术后复发的关系被引量：1: 2007年; [目的]探讨肝细胞癌患者的外周血中甲胎蛋白(AFP)mRNA的检测在肝癌术后预后中的应用价值。[方法]应用巢式PCR和TaqMan MGB探针法定量PCR技术,检测105例肝细胞癌患者和30例健康志愿者外周血AFP mRNA的表达情况。[结果]肝细胞癌患者术前外周血AFP mRNA的阳性率43.8%(46/105)高于健康对照10.0%(3/30),有显著性差异(P< 0.001)。术前血中AFP mRNA的表达与各项肿瘤侵袭性指标显著相关,包括肿瘤数目、大小、有无肉眼及镜下血管侵犯。AFP mRNA阴性患者1、2、3年生存率以及1、2、3年无瘤生存率均显著比AFP mRNA阳性患者术后高(两者均P=0.004)。多因素分析也指出术前外周血中是否表达AFP mRNA是预测术后复发的独立因素。[结论]肝癌患者术前外周血中是否表达AFP mRNA与肿瘤侵袭性相关,对于预测术后复发具有重要价值。; 张颖石明张昌卿胡业珠叶永照孙韻邓玲李锦清; 关键词：甲胎蛋白 MRNA 实时定量PCR

基于分子标签二代测序技术的非小细胞肺癌驱动基因变异分析被引量：16: 2019年; 目的通过对非小细胞肺癌(NSCLC)患者的血浆 ctDNA标本采用基于分子标签(UMI) 的二代测序(NGS)技术进行相关驱动基因突变分析,评估血浆 ctDNA二代测序技术指导靶向用药的价值及注意事项。方法纳入了163例2017年7月至2019年7月期间在中山大学附属肿瘤医院就诊的 NSCLC患者血液标本,采用基于分子标签的二代测序方法,检测患者血浆ctDNA中与NSCLC相关的 11个驱动基因的突变情况。结果 98例初诊初治的NSCLC患者中,37.8%(37例)患者未检出肺癌驱动基因突变。其余患者中 TP53、EGFR、ERBB2、RET、KRAS、ALK、PIK3CA、BRAF、MET、ROS1、NRAS的突变频率分别为33%、24%、10%、8%、7%、6%、4%、3%、3%、3%和1%。57例EGFR TKI靶向治疗后进展的 NSCLC患者中,21例(36.8%)检出T790M突变,3例(27.3%)接受三代EGFR TKI治疗后进展的患者出现T790M与T797S顺式耐药突变。其他耐药突变包括KRAS基因突变(2例)、MET基因扩增(1例)以及PIK3CA基因突变(8例)。29例组织样本ARMS PCR检测结果阳性的患者,组织EGFR突变阳性患者与ctDNA检测EGFR阳性患者之间的一致性为13.8%。结论该方法不仅能够检出初诊初治NSCLC 患者中靶向治疗的敏感突变,还可以对靶向治疗进展后的耐药突变情况进行监测。因此,可选择基于分子标签的二代测序检测技术来指导 NSCLC患者的个性化用药。; 刘小云吴小延邵琼龙亚康王海云邓玲; 关键词：非小细胞肺癌耐药突变

IgH基因单克隆重排检测及其在B细胞性非霍奇金淋巴瘤诊断中的应用被引量：8: 2012年; 目的:建立准确可靠、操作性强、适用于临床实际工作的免疫球蛋白重链(immunoglobulin heavychain,IgH)基因单克隆重排检测方法,用于B细胞性非霍奇金淋巴瘤(B-cell non-Hodgkin lymphoma,B-NHL)的辅助诊断。方法:采用骨架区(framework region,FR)引物FR2、FR3和重链连接区(joining region of heavy chain,JH)引物LJH、VLJH组合、A管+B管模式、半巢式聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法对121例B-NHL、58例T细胞性非霍奇金淋巴瘤(T-cell non-Hodgkin lymphoma,T-NHL)和19例淋巴结反应性增生的石蜡组织进行IgH基因单克隆重排检测,分析IgH基因单克隆重排检出率在B-NHL组、T-NHL组和淋巴结反应性增生组中的差异,以及B-NHL中联合应用FR2和FR3与单独应用FR2、FR3之间IgH基因单克隆重排检出率的差异。结果:118例成功检测的B-NHL中,IgH基因单克隆重排检出率为81%(96/118);54例成功检测的T-NHL中,IgH基因单克隆重排检出率为4%(2/54);19例成功检测的淋巴结反应性增生中未检出IgH基因单克隆重排。B-NHL组与T-NHL组、淋巴结反应性增生组相比,IgH基因单克隆重排检出率差异具有显著性(P<0.05)。B-NHL中,FR2基因单克隆重排检出率为58%(68/118),FR3基因单克隆重排检出率为55%(65/118),联合应用FR2和FR3,IgH基因单克隆重排检出率为81%(96/118),联合应用FR2和FR3与单独应用FR2、FR3的检出率有显著差异(P<0.05)。结论:采用FR2、FR3、LJH及VLJH引物组合、A管+B管模式和半巢式PCR法进行石蜡组织IgH基因单克隆重排检测,简单易行,结果准确可靠,阳性率较高,可用于临床B-NHL的辅助诊断。; 李银珍王芳邵琼张旭邓玲汤涛张晓吴秋良; 关键词：淋巴瘤免疫球蛋白基因重排

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