谢彩霞 作品数:7 被引量:15 H指数:2 供职机构: 上海海洋大学 更多>> 发文基金: 上海市教育委员会重点学科基金 国家自然科学基金 教育部科学技术研究重点项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
16S rDNA文库法分析草鱼肝胰脏和胆汁细菌群落组成 被引量:8 2010年 利用16S rDNA文库随机测序法分析了草鱼肝胰脏和胆汁细菌菌落组成,结果表明,在肝胰脏中共鉴定出19种共生细菌,分别隶属于气单胞菌属、假单胞菌属、摩根菌属、不动杆菌属、弧菌属和变形杆菌属。气单胞菌属和假单胞菌属为优势属,气单胞菌属的丰度为36.17%,假单胞菌属为31.91%。其中,气单胞菌属的GZ16和假单胞菌属的GZ9菌株丰度最高,均为12.77%。在胆汁中共鉴定出10种共生细菌,分别隶属于气单胞菌属、假单胞菌属、摩根菌属和变形杆菌属。气单胞菌属和假单胞菌属为优势属,气单胞菌属的丰度为35%,假单胞菌属为27.5%。其中,变形杆菌属的DN1菌株丰度最高,为25%。肝胰脏中只有10.5%的细菌群落与胆汁的细菌群落相似,胆汁中只有20%的细菌群落与肝胰脏相似,表明草鱼肝胰脏和胆汁有各自特有的共生细菌群落。本研究结果,为进一步探讨肝胰脏和胆汁共生细菌的生理功能,以及细菌与宿主草鱼之间的协同进化提供了基础。 蒋燕 鲍宝龙 谢彩霞 杨桂梅关键词:草鱼 肝胰脏 胆汁 一种抑制比目鱼眼睛移动的方法 本发明公开了一种抑制比目鱼眼睛移动的方法,包括抑制药物秋水仙素的选择,显微注射的方法及技巧,注射牙鲆、欧鳎和半滑舌鳎的位置和时间。本发明能够将药物的作用限制在局部组织,达到较佳的作用效果。通过注射秋水仙素抑制了比目鱼眼睛... 鲍宝龙 柯中和 邢巨斌 龚小玲 谢彩霞 徐冰 盖军伟文献传递 变态期牙鲆(Paralichthys olivaceus)基因及微小RNA的转录谱分析 比目鱼类(鲽形目)的变态发育导致身体左右不对称的产生,是自然界中十分奇特的现象。虽然甲状腺激素已公认是调控比目鱼类的变态发育,但甲状腺激素如何调控比目鱼变态导致的左右不对称产生,目前还不清楚。为了从基因组学的角度,筛选与... 谢彩霞文献传递 变态前牙鲆cDNA文库中Ⅰ型微卫星的多态性分析 被引量:1 2011年 牙鲆(Paralichthys olivaceus)不仅是研究鱼类变态的模式生物,也是我国的重要水产养殖对象。从变态前牙鲆cDNA文库中的42个单一序列表达标签(ESTs)中筛选到46个微卫星分子标记,从中选择21个微卫星并在一个养殖牙鲆群体共30个样本中测试,结果表明其中有20个微卫星标记具有多态性,其等位基因数为2到6个,观察杂合度从0.06到1.00,期望杂合度从0.059 7到0.825 2变化不等,平均多态信息含量是0.457 5,可用于牙鲆连锁图的构建和分子标记辅助选育。其中,有3个微卫星位点的三核苷酸重复序列在基因编码区内,可能和基因功能有关。 邢巨斌 谢彩霞 张逸飞 鲍宝龙关键词:牙鲆 表达序列标签 CDNA文库 牙鲆epigen基因的克隆以及在变态过程中的表达 被引量:6 2010年 为了调查表皮细胞分裂原epigen基因是否与牙鲆变态发育有关,分析了从变态期牙鲆仔鱼cDNA文库中测序得到的epigen基因。发现epigen基因编码162个氨基酸,具有信号肽序列,一个跨膜结构域和EGF-like结构域。EGF-like结构域包含有可形成3个二硫键的6个半胱氨酸残基,是表皮生长因子家族的结构特征。此外,利用荧光实时定量RT-PCR,调查了epigen基因在牙鲆眼睛移动过程中的变化。相比眼睛移动之前(17DAH,day after hatching),epigen基因在眼睛移动初期(19DAH)表达明显增强,为17DAH时的2.363倍;而在眼睛移动过程的高峰期(23DAH),表达量明显回落,相对19DAH的表达量降低了80%;变态结束后(27DAH)epigen基因的表达没有重新增强或进一步的回落,提示epigen基因可能与眼睛移动初期的变态发育事件有关,而与变态高峰期和变态后期的发育事件关系不明显。 谢彩霞 邢巨斌 鲍宝龙关键词:牙鲆 实时定量PCR 表皮生长因子 草鱼CC趋化因子基因CCL24及其可变剪接 被引量:1 2010年 CC趋化因子是一类能够促进动物体内炎症部位的各种白细胞的补充、激活和黏附的趋化性细胞因子家族,是鱼类天然免疫系统的重要组成部分。分析了从草鱼肠道cDNA文库中筛选到的CC趋化因子基因CCL24,并克隆了阅读框区域内的基因组序列。序列分析表明,CCL24基因由4个外显子和3个内含子组成;外显子拼接的序列与CCL24cDNA序列完全一致,编码95个氨基酸,有2个相邻的半胱氨酸(CC),为典型的CC趋化因子亚家族成员。此外,还发现草鱼CCL24基因存在可变剪接现象,第1内含子没有被剪切掉的非正常转录本翻译后可能产生没有CC趋化因子活性的24个氨基酸的短肽,而且这种转录本在精巢、头肾、皮肤、肝胰脏、肠道、肌肉、肾脏等组织均检测到;而正常剪接的CCL24转录本,仅在肾脏和肠道中检测到,且其表达量要明显低于非正常剪接的转录本。 杨琳琳 谢彩霞 龚小玲 鲍宝龙关键词:草鱼 一种抑制比目鱼眼睛移动的方法 本发明公开了一种抑制比目鱼眼睛移动的方法,包括抑制药物秋水仙素的选择,显微注射的方法及技巧,注射牙鲆、欧鳎和半滑舌鳎的位置和时间。本发明能够将药物的作用限制在局部组织,达到较佳的作用效果。通过注射秋水仙素抑制了比目鱼眼睛... 鲍宝龙 柯中和 邢巨斌 龚小玲 谢彩霞 徐冰 盖军伟