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IMP型金属β-内酰胺酶活性中心的计算机模拟分析: 本文应用信息论方法和计算机模拟的方法,对IMP型β-内酰胺酶序列及活性中心进行分析,结果表明在配体结合部位的大部分残基是高度保守的,但也有部分残基易发生变异,如32位1Pro、31位Val和163位Try,这些变异是引起...; 许岩郑珩劳兴珍吕品一; 关键词：酶抑制剂药物设计金属Β-内酰胺酶计算机模拟; 文献传递

IMP型金属β-内酰胺酶活性中心的计算机模拟分析被引量：1: 2009年; 应用信息论方法和计算机模拟的方法,对IMP型β-内酰胺酶序列及活性中心进行分析,结果表明在配体结合部位的大部分残基是高度保守的,但也有部分残基易发生变异,如32位Pro、31位Val和163位Try,这些变异是引起该酶不同变异型对β-内酰胺类抗生素水解能力不同的重要原因,在设计抑制剂时需考虑在酶高变区附近分子的柔性,以防出现新突变型而对所设计抑制剂产生抗性。将酶和底物亚胺培南及青霉素G对接结果表明,底物与酶的结合自由能与酶的催化活性间有很好的相关性,可作为评估底物或酶抑制剂结合能力的重要评价指标。对接模型更细致地显示了酶中与底物相互作用的氨基酸残基,为酶抑制剂的合理设计奠定了基础。; 许岩余江河郑珩劳兴珍吕品一; 关键词：IMP 金属Β-内酰胺酶同源模建分子对接

IMP-1型金属β-内酰胺酶抑制剂活性预测模型的研究: 为建立计算机辅助IMP-1酶抑制剂设计方法，使用文献报道的已知抑制剂活性建立了基于对接亲和能的QSAR模型。首先使用晶体重构实验，确定使用MOE软件对接时，放置方式参数设为Triangle matcher，打分方式设为A...; 郑珩陈灵犀许岩沈秉正陈姣; 关键词：计算机辅助设计 QSAR模型; 文献传递

3D-QSAR和分子对接研究吲哚咔唑类细胞周期蛋白激酶抑制剂的选择性被引量：3: 2009年; 细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标.由于大多数激酶ATP结合位点的保守性,CDK选择性激酶抑制剂的开发成为当前的研发难点和热点.针对吲哚咔唑类CDK抑制剂,我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA)建立了CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship)和CDK4-QSSR(quantitative structure-selectivity relationship)模型.所建模型的交叉验证系数q2分别为0.722和0.703;非交叉验证系数r2分别为0.977和0.946,表明其具有较好的预测能力.同时,用分子对接的方法分析了这类化合物与CDK4同源模建结构的作用模式,根据这两个模型发现,吲哚咔唑类化合物的R5和R6位长链取代对CDK4的选择性具有一定的影响,而且结合其作用模式比较合理地解释了这类抑制剂的选择性原因,这对CDKs的选择性研究具有一定的指导意义.; 孙倪悦陆涛陈亚东郝兰虎许岩李瑞君; 关键词：3D-QSAR 分子对接

计算机辅助药物设计在病毒酶抑制剂开发中的应用: 2009年; 计算机辅助药物设计是创新药物研究的新方法和新技术,近年来引起了研究机构和制药公司的高度重视。本文概述了CADD的设计方法,并例举了CADD在HIV-1整合酶抑制剂和感冒病毒神经氨酸酶抑制剂研发中的应用,阐述了CADD在酶抑制剂研究中应用前景。; 许岩顾觉奋郑珩; 关键词：计算机辅助药物设计 HIV-1整合酶抑制剂神经氨酸酶抑制剂

IMP型金属β-内酰胺酶及其抑制剂研究进展被引量：4: 2010年; IMP型金属β-内酰胺酶是一类广谱酶,能够水解除了单环β-内酰胺以外的几乎所有β-内酰胺类抗生素,给临床的抗菌治疗带来了严峻的挑战。本文从IMP型金属β-内酰胺酶的发现与分类、分子生物学特征、产生耐药的机制及其抑制剂的研究现状等方面进行论述,以促进对抗耐药菌的药物研发。; 陈姣郑珩沈秉正许岩; 关键词：Β-内酰胺类抗生素抑制剂

IMP-1型金属β-内酰胺酶抑制剂活性预测模型的研究: 为建立计算机辅助IMP-1酶抑制剂设计方法,使用文献报道的已知抑制剂活性建立了基于对接亲和能的QSAR模型。首先使用晶体重构实验,确定使用MOE软件对接时,放置方式参数设为Trianglematcher,打分方式设为Af...; 郑珩陈灵犀许岩沈秉正陈姣; 文献传递

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许岩