聂振平 作品数:16 被引量:40 H指数:4 供职机构: 广西海洋研究所 更多>> 发文基金: 广西壮族自治区科学研究与技术开发计划 广西壮族自治区自然科学基金 广西海洋生物技术重点实验室主任基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 天文地球 更多>>
拟穴青蟹形态性状与性腺重量的相关分析 被引量:1 2013年 选取16月龄池塘养殖雌性拟穴青蟹(Scylla paramamosain)67只,测量其头胸甲长(X1)、头胸甲宽(X2)、腹部宽(X3)、体重(X4)和性腺重(Y),利用相关分析和通径分析方法计算形态性状对性腺重的相关系数、通径系数和决定系数,明确影响拟穴青蟹性腺重的主要形态性状,为拟穴青蟹选育提供理论依据和技术支持。结果表明,形态性状与性腺重相关性极显著(P<0.01),其中体重对性腺重的直接影响和决定程度最大(0.736,54.2%),腹部宽次之,头胸甲长最小。通过头胸甲长、腹部宽和体重估计性腺重的多元回归方程为:Y=14.467-1.556 X1+1.626 X3+0.245 X4(R2=0.499)。 赵鹏 宋忠魁 聂振平 童万平 李梦芸 孙奉玉关键词:拟穴青蟹 形态性状 青蟹呼肠孤病毒对拟穴青蟹的致病性研究 被引量:4 2013年 2008—2012年广西海洋研究所海水增养殖基地暂养的拟穴青蟹膏蟹出现"嗜睡"等典型的青蟹呼肠孤病毒病症状。采用套式PCR检测濒死膏蟹感染青蟹呼肠孤病毒阳性率为100%,经Blastn比对扩增序列与青蟹呼肠孤病毒基因(HQ414137.1)相似度达98%,属于青蟹呼肠孤病毒(JX213634)。病毒粗提液人工回感后发现,攻毒1h,青蟹血淋巴中即可检测到青蟹呼肠孤病毒;攻毒后第4~6d,出现死亡高峰,第10d,累积死亡率达到100%。血清酶指标中碱性磷酸酶、谷丙转氨酶和谷草转氨酶活力明显高于对照组,而与免疫相关的过氧化物酶、超氧化物歧化酶活力低于对照组;肝胰腺、鳃和肌肉组织切片均呈现显著病理坏死损伤。青蟹呼肠孤病毒是此次拟穴青蟹膏蟹死亡的主要原因。 蔡小辉 彭银辉 刘旭佳 游出超 苏琼 聂振平 董兰芳 杨志会 王志成关键词:拟穴青蟹 组织病理 拟穴青蟹(CA)_n微卫星DNA多态性引物筛选 被引量:2 2013年 利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats)技术建立拟穴青蟹Scylla paramamosain基因组文库,并与生物素标记的(CA)15寡核苷酸探针杂交,联合磁珠富集法构建拟穴青蟹微卫星富集文库。测序194个阳性菌落,分析其中的150条序列,结果表明:两碱基重复类型占90%以上,其中重复拷贝数在30以上的占27.45%;含微卫星座位189个,其中完美型146个、非完美型28个和复合型15个。设计125对引物扩增一个拟穴青蟹野生群体(含20个个体),其中的19对引物能稳定扩增且片段大小基本符合理论长度。遗传变异分析表明,17个位点表现出高度多态性,16个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),4组两两位点间存在连锁不平衡现象(P<0.0026,经Bonferroni法校正),7个微卫星位点可能存在无效等位基因。若排除混合微卫星位点的引物对以及扩增位点PIC(polymorphism information content)值在0.5以下的引物对,则13对引物能用于拟穴青蟹群体遗传学等研究。 宋忠魁 聂振平 王芳宇关键词:AFLP 磁珠富集法 广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹群体遗传多样性的RAPD分析 被引量:5 2012年 采用随机扩增多态DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)技术检测广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹(Scylla paramamosain)6个地理群体的遗传变异和遗传结构,8条10 bp寡核苷酸随机引物扩增99个个体,分析其中的44个位点,31个位点表现出多态性,在种水平的多态位点百分率为70.45%。POPGENE分析结果显示,6个群体的多态位点百分率为29.55%~54.55%,平均为36.97%;群体的遗传多样性自高至低排列为钦州湾群体>党江群体>珍珠湾群体>闸口群体>清化群体>流沙湾群体;群体内的遗传变异大于群体间的遗传变异,群体间的遗传分化程度较大。AMOVA分析显示,群体内遗传变异占87.03%,群体间遗传变异占12.97%,群体间发生中等程度遗传分化。Mantel检测结果表明,拟穴青蟹6个群体间的遗传距离与地理距离之间的相关性不显著。聚类分析表明,群体间聚类无明显的地域性分布格局。 孙奉玉 宋忠魁 赵鹏 聂振平 苏琼 王芳宇关键词:拟穴青蟹 RAPD 遗传分化 拟穴青蟹不同大小个体遗传多样性分析 被引量:1 2012年 在拟穴青蟹(Scylla paramamosain)育种实践中,建立了一种选择个体大小的策略,应用ISSR和RAPD标记技术并以拟穴青蟹雄性个体组建供试群体检验所建立的选择策略的有效性.ISSR与RAPD标记方法的分析数据都表明,大、中、小个体组的几个对应遗传参数值高低依次按中个体组、大个体组、小个体组排列.其基因多样性的Nei’s分析表明,ISSR分析所得到的总遗传多样性(Ht=0.322 3)、平均遗传多样性(Hs=0.270 1)、遗传分化系数(Gst=0.162 2),均高于RAPD分析得出的对应遗传参数值(Ht=0.274 6,Hs=0.233 6,Gst=0.149 3).基于ISSR数据的遗传分化系数表明大、中、小个体组组间遗传分化程度达到较高水平,而基于RAPD数据的遗传分化系数表明大、中、小个体组组间遗传分化程度达到中等水平.上述结果表明应用ISSR标记技术比应用RAPD标记技术能揭示出更加丰富的遗传变异信息.基于ISSR和RAPD分析数据的组间遗传分化系数表明,大个体组与小个体组间的遗传分化系数最高(Gst值分别为0.165 8、0.139 9),与中个体组间的次之(Gst值分别为0.156 6、0.127 2),中个体组与小个体组间的遗传分化系数最低(Gst值分别为0.050 5、0.082 4).基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类分析结果表明,ISSR和RAPD分析数据均支持大个体组优先分离.基于Dice’s系数的个体聚类分析结果也揭示了大个体组个体优先分离并呈现出单独聚类趋势.这表明ISSR与RAPD分析数据均支持了拟穴青蟹个体大小选择策略的有效性.此外,研究结果也表明:拟穴青蟹供试群体遗传多样性高低分布趋势与群体内的不同个体类型的数量分布趋势基本一致,呈正态分布趋势;大个体组的遗传多样性高于小个体组,或小个体组的遗传多样性高于大个体组并不影响大个体组作为育种材料的潜力. 宋忠魁 孙奉玉 赵鹏 蔡小辉 王芳宇 聂振平关键词:海洋生物学 拟穴青蟹 育种 ISSR RAPD 拟穴青蟹(Scylla paramamosain)微卫星位点开发-基于(AG)12探针杂交 被引量:1 2013年 采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP sequences containing repeats)技术和磁珠富集方法开发拟穴青蟹微卫星位点。结果表明,400bp以下长度的序列含微卫星的概率超过400bp以上长度的序列;从二碱基重复类型到五碱基重复类型,完美型微卫星的概率在增加。利用设计的28对引物扩增一个供试群体,其中12对引物能稳定扩增且片段大小基本符合理论长度,10个微卫星位点表现出高度多态性,9个微卫星位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),两组两两位点间存在连锁不平衡现象(P<0.0042,经Bonferroni法校正)。Micro-checker分析揭示其中的5个微卫星位点可能存在无效等位基因。排除混合微卫星位点的引物对以及扩增位点PIc值在0.5以下的引物对,8对引物能用于拟穴青蟹群体遗传学等研究。 宋忠魁 聂振平 谢达 王芳宇关键词:磁珠富集法 拟穴青蟹 微卫星 拟穴青蟹腹部性状特征与体质量对卵质量的影响分析 测算抱卵蟹腹部宽、腹甲宽、体质量和卵质量,采用相关分析、通径分析、多元回归分析等方法,分析腹部性状特征与体质量对卵质量的相关性.结果表明:腹部宽、腹甲宽和体质量对卵质量的相关系数分别为0.310、0.450、0.495,... 聂振平 赵鹏 彭银辉 蔡小辉 苏琼 宋忠魁关键词:拟穴青蟹 形态性状 通径分析 二种体色拟穴青蟹群体ISSR分析 被引量:4 2011年 应用ISSR分子标记技术分析二种体色拟穴青蟹群体的遗传多样性.10条ISSR引物共扩增出81条带,其中73条表现出多态性,占总条带数的90.12%.暗红色和深绿色拟穴青蟹群体的多态性位点比率分别为81.48%和77.78%,暗红色群体的Nei’s基因多样性指数(He=0.318 9)和Shannon’s信息指数(I=0.469 0)略高于深绿色群体(He=0.305 4,I=0.449 1).群体间的Nei’s遗传相似性(0.948 4)和遗传距离(0.052 9)表明,群体间遗传分化属于种内遗传分化.POPGENE和AMOVA分析表明,总的遗传变异主要来源于群体内个体间,群体间发生中等程度遗传分化,群体间存在强大的基因流.UPGMA聚类图可视化群体间和群体内的遗传变异,显示60个个体并没有按体色聚类. 蔡小辉 宋忠魁 彭银辉 聂振平 赵鹏 苏琼关键词:海洋生物学 拟穴青蟹 体色 ISSR 北部湾拟穴青蟹(Scylla paramamosain)群体遗传结构及其扩张分析 被引量:5 2012年 利用线粒体16SrRNA基因片段分析北部湾拟穴青蟹群体遗传结构及其扩张历史。结果表明,16SrRNA基因片段长度在521—523bp之间,6个拟穴青蟹群体具21种单倍型。群体总体水平的单倍型多样性(h)和核甘酸多样性(π)分别为0.6259和0.001851。群体间遗传距离与地理距离之间无相关性。群体间遗传分化系数(Gst)在0.02008—0.04362之间,基因流(Nm)值在5.48—12.20之间。AMOVA分析表明,群体间遗传变异占0.1%,群体内遗传变异占99.9%。群体间固定指数(Fst)的绝对值在0.00026—0.02977之间,暗示群体间没有产生遗传分化。单倍型邻接树和单倍型中介网络图显示,单倍型没有按采样地形成谱系分支。中性检验和错配分析揭示,北部湾拟穴青蟹群体在历史上经历过群体扩张。群体扩张时间大致在更新世晚期的0.04698—0.01879MY前或0.04520—0.01808MY前。 宋忠魁 李梦芸 聂振平 孙奉玉 赵鹏 苏琼关键词:拟穴青蟹 RRNA基因 马氏珠母贝规模化术前处理、术后休养技术研究 被引量:4 2010年 马氏珠母贝(Pinctada martensii Dunker,又称合浦珠母贝Pinctada fucata)是我国养殖海水珍珠的主要品种。但长期以来,在珍珠生产中普遍存在着插核手术后休养贝死亡率高、留核率低等问题,造成了母贝资源和人力资源的浪费,也影响了珍珠养殖的经济效益。 贾友宏 文雪 聂振平关键词:马氏珠母贝 术前处理 休养 规模化 珍珠养殖 合浦珠母贝