罗晶
- 作品数：4 被引量：21H指数：4
- 供职机构：中国科学院微生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程国家科技基础性工作专项更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- COI基因作为丛赤壳科真菌DNA条形码的测试被引量：6
- 2012年
- 以丛赤壳科33种76个菌株为材料,探讨COI基因作为该科DNA条形码的可能性。结果表明,该DNA片段存在较多内含子,为了获取某些种的短片段,需设计许多引物,PCR扩增与测序成功率低,难以达到便捷、快速的物种鉴定的目的。因此,COI不宜作为丛赤壳科的DNA条形码。对已获得的少数片段进行分析表明,该基因对丛赤壳科部分种具有较强的物种鉴别力。
- 赵鹏罗晶庄文颖
- 从真菌全基因组中筛选丛赤壳科的DNA条形码被引量：6
- 2012年
- 将粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)的注释基因分别与30种丝状子囊菌基因组比较,根据E值大小预测同源序列,从中选择Hsp90,AAC,CDC48和EF3作为候选基因,以丛赤壳科(Nectriaceae)13个属34个概念清晰的种为材料,对215个序列片段采用不同方法进行分析,筛选适合于该科的DNA条形码.将种内与种间序列差异以及序列获得的难易程度作为评价指标.结果表明,Hsp90和AAC基因虽然具有较高的PCR扩增与测序成功率,但种内、种间距离频率分布存在重叠,可能导致部分种的鉴定错误;CDC48基因可以恰当地区分种内与种间差异,但扩增与测序成功率相对较低;EF3基因不存在种内、种间遗传距离重叠,序列容易获得,适合作为该科真菌的DNA条形码.
- 曾昭清赵鹏罗晶庄文颖余知和
- 新丛赤壳属真菌DNA条形码研究被引量：5
- 2011年
- 以新丛赤壳属19个种为材料,选择ITSrDNA,β-tubulin,EF-1α和RPB2作为候选基因,对获得的205个序列片段采用不同方法进行分析,筛选该属的DNA条形码.将种内与种间序列差异以及序列获得的难易程度作为评价指标.结果表明,任何一个单独的基因都不宜作为其DNA条形码,EF-1α与RPB2基因组合可以准确识别种内与种间差异,建议作为该类真菌的DNA条形码.研究过程中,将形态学与序列分析相结合,发现顶环新丛赤壳和小孢新从赤壳两个隐存种.
- 赵鹏罗晶庄文颖刘杏忠吴冰
- 关键词：形态学
- 中国科学院微生物研究所菌物标本馆馆藏菌寄生属Hypomyces标本的分类研究(英文)被引量：5
- 2012年
- 对中国科学院微生物研究所菌物标本馆保存的菌寄生属标本进行了分类学方面的清理和订正,鉴定出9个种,其中大孢菌寄生H. marcrosporus、丝层菌寄生H. subiculosus和侧毛斑菌寄生H. tegillum为中国新记录种。
- 罗晶庄文颖
- 关键词：形态学
