王侃
- 作品数：3 被引量：19H指数：2
- 供职机构：云南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 大肠杆菌mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性的关系被引量：15
- 2006年
- 从GenBank获得大肠杆菌K-12MG1655株的全基因组序列,计算了与基因密码子偏好性相关的多个参数(Nc、CAI、GC、GC3s),对其mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性之间的关系进行了统计学分析,发现虽然翻译效率(包括翻译速度和翻译精度)是制约大肠杆菌高表达基因的密码子偏好性的主要因素,同时,mRNA编码区长度及其形成二级结构的倾向也是形成这种偏好性的不可忽略的原因,而且对偏好性有一定程度的削弱。另外对mRNA编码区形成二级结构倾向的生物学意义进行了讨论分析。
- 王侃刘次全曹槐陈雪峰
- 关键词：大肠杆菌密码子偏好性MRNA二级结构
- 大肠杆菌mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性的关系
- 大肠杆菌一直是密码子偏好性研究的模式生物，但是，以往研究的大多数往往关注的是密码子偏好性和翻译效率(包括翻译速度和翻译精度)之间的关系，有研究者认为，大肠杆菌基因的密码子偏好性，尤其是高表达基因的密码子偏好性主要是为了使...
- 王侃
- 关键词：大肠杆菌密码子偏好性基因组序列
- 文献传递
- H5N1亚型禽流感病毒血凝素裂解位点碱性氨基酸对应mRNA核苷酸的二级结构分析被引量：4
- 2008年
- 以H5N1亚型禽流感病毒(avianin fluenza viruses,AIV)毒株血凝素(hemagglutinin,HA)蛋白裂解位点碱性氨基酸为研究对象,研究其密码子的偏好性及对应mRNA序列折叠二级结构的特点.将mRNA样本按照序列等步长递增的方法,用RNAstructure 4.1程序预测这些样本的动态延伸折叠二级结构.结果表明,裂解位点的碱性氨基酸对富含腺嘌呤(A)的密码子有强烈偏好;与碱性氨基酸对应的mRNA片段上的核苷酸主要位于折叠二级结构的单链环区,极少数位于配对螺旋区.此外,本研究还从理论上提出了防治H5N1亚型AIV感染的对策,考虑以位于环区的mRNA核苷酸,运用RNAi的方法阻止H5N1亚型AIV的HA的表达。
- 张素霞王昕陈雪峰王侃曹槐张闻刘次全
- 关键词：禽流感血凝素裂解位点MRNA二级结构
