牛辰 作品数:13 被引量:41 H指数:3 供职机构: 复旦大学上海医学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 上海市卫生局青年科研基金 教育部留学回国人员科研启动基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 文化科学 更多>>
真核类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶在表皮葡萄球菌生物膜形成中的作用机制研究 刘倩 高谦 范佳佳 牛辰 王德成 王建平 王星 Amer E.Villaruz 李敏 Michael Otto关键词:表皮葡萄球菌 生物膜 STK 毒力 活细胞成像技术实时追踪荧光蛋白标记的分枝杆菌的胞内增殖 被引量:1 2014年 目的 利用绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)标记和活细胞显微成像的方法,实时追踪分枝杆菌在巨噬细胞内的增殖过程。方法 用经GFP标记的野生型海分枝杆菌(Mycobacterium marinum,Mm)分别侵染未激活和γ-干扰素激活的巨噬细胞,使用活细胞显微成像系统连续记录胞内分枝杆菌的增殖动态,同时优化不同细胞接种浓度和感染复数(multiplicity of infection,MOI)对胞内菌增殖动态的追踪效果。结果 使用GFP标记和活细胞成像的方法可以实时追踪胞内分枝杆菌的增殖过程和形态学变化。γ干扰素对Mm在巨噬细胞中的增殖有抑制作用。当接种巨噬细胞浓度为1×105/孔,MOI为1时,可直观清晰地分析实时追踪图像中胞内菌的增殖过程。结论 通过活细胞成像技术分析荧光蛋白标记的分枝杆菌,可实时追踪巨噬细胞内分枝杆菌增殖过程和形态学变化,是一种体外分析胞内分枝杆菌增殖的理想方法,可应用于其他相关病原菌和宿主相互作用及影响因素的研究。 乔可 王晴岚 李紫煜 牛辰关键词:巨噬细胞 活细胞成像 mkl基因在海分枝杆菌抵抗宿主免疫中的作用 被引量:1 2015年 本研究利用MycoMarT7噬菌体建立了海分枝杆菌随机突变库,鉴定获得1株转座子插在基因MMAR_0994(mkl)上的突变株。用野生株和突变株分别感染斑马鱼成鱼,通过观察斑马鱼的存活情况,研究mkl基因对海分枝杆菌毒力的影响;利用尾静脉注射感染孵出48h后的斑马鱼幼鱼,于荧光显微镜下观察突变株及野生株在幼鱼体内的播散情况,以检测mkl基因在细菌与宿主天然免疫相互作用中的功能;将野生株和突变株分别感染小鼠来源巨噬细胞,检测其在巨噬细胞内的增殖。此外,还检测了突变株对酸性环境的耐受情况。结果显示,mkl基因突变株感染斑马鱼成鱼后25d内没有鱼死亡;在斑马鱼幼鱼感染模型和细胞感染模型中,突变株的增殖明显减弱;突变株对酸性环境压力更敏感。以上结果提示,mkl基因在海分枝杆菌抵抗宿主免疫及致病中发挥重要作用。 华亦斐 王晴岚 牛辰 高谦关键词:巨噬细胞 从肠道菌群角度认识阿尔茨海默病的潜在发病机制 被引量:10 2019年 过去10年中,人们逐渐认识到肠道微生物群的多样性及菌群平衡在维护宿主健康中发挥的作用。肠道微生物及其代谢产物通过一系列的生化、免疫和生理功能环节与宿主进行交流,从而影响宿主的稳态和健康。阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)是一种复杂的神经退行性疾病,其易感性和发展过程受年龄、遗传和表观遗传等因素的影响。研究发现,肠道微生物群的紊乱(组成改变和易位)与神经系统疾病(AD)有关,胃肠道通过肠脑轴与中枢神经系统进行沟通,包括对神经的直接作用、内分泌途径和免疫调控方式。动物模型、粪便菌群移植及益生菌干预为肠道菌群与AD的相关性提供了证据。外漏的细菌代谢产物可能直接损害神经元功能,也可能诱发神经炎症,促进AD的发病。本文主要综述了肠道微生物群与AD的关联和作用机制,以期为通过改善肠道菌群结构预防AD的可能干预措施提供依据。 王虹 牛辰 汪慧菁 赵超关键词:肠道菌群 阿尔茨海默病 神经递质 神经炎症 肿瘤坏死因子α突变型斑马鱼在海分枝杆菌感染中的应用研究 被引量:1 2017年 肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factorα,TNF-α)作为重要的炎性细胞因子,在类风湿关节炎、感染性休克等疾病的发病中起重要作用。为探究TNF-α在宿主抵抗海分枝杆菌感染中的作用,本研究采用成簇的规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9[clustered regularly interspaced short palindromic repeat(CRISPR)/CRISPR-associated protein 9(Cas9),CRISPR/Cas9]技术,使野生型斑马鱼TNF-α基因发生突变,成功构建并筛选出含有移码突变的TNF-α突变型(TNF-α-/-)斑马鱼。利用原位杂交技术,发现TNF-α-/-斑马鱼中TNF-αmRNA表达水平显著降低。与野生型斑马鱼相比,海分枝杆菌在TNF-α-/-斑马鱼体内扩散和增殖更显著。结果提示,本研究成功构建TNF-α-/-斑马鱼,有助于深入探究TNF-α在斑马鱼抵抗海分枝杆菌感染中的作用及其免疫调节机制。 谢玲玲 王风华 王德成 赵超 彭刚 牛辰关键词:肿瘤坏死因子Α 原位杂交 细菌感染 应用iTRAQ定量蛋白质组学研究海分枝杆菌mkl的基因功能 被引量:2 2016年 【目的】通过分离海分枝杆菌野生株和mkl突变株的全菌蛋白,并进行差异蛋白质组分析,以期为探索分枝杆菌重要毒力基因mkl的功能提供新思路。【方法】以海分枝杆菌野生株和mkl突变株为研究材料,提取全菌蛋白,i TRAQ试剂标记后进行质谱鉴定和定量分析,并利用Uni Prot数据库对差异蛋白进行生物信息学分析。【结果】共鉴定出在野生株和mkl突变株中差异表达蛋白566个,其中在突变株中上调表达蛋白232个(比值≥1.4),下调表达蛋白334个(比值≤0.7)。生物信息学预测这些蛋白主要参与细菌脂质代谢、细胞壁和细胞进程、中间代谢、呼吸作用等生物学功能。其中Des A3下调最显著,其功能为脂肪酸去饱和酶,与油酸合成相关,进一步验证发现mkl突变株在不含油酸的固体培养基中生长受限,提示mkl可能在油酸的生物合成通路中发挥功能。【结论】通过i TRAQ分析了海分枝杆菌mkl突变株和野生株的差异表达蛋白谱,发现可能影响分枝杆菌油酸、脂质等合成代谢通路,为进一步研究mkl基因在分枝杆菌致病中发挥作用的相关机制奠定了基础。 施旭骏 赵超 牛辰 高谦关键词:分枝杆菌 定量蛋白质组学 ITRAQ 鲍曼不动杆菌生物膜形成与耐药的相关性初探 被引量:3 2012年 目的探索鲍曼不动杆菌生物膜的形成与耐药的相关性。方法采用96孔板培养法模拟体内生物膜形成,结晶紫染色法鉴定各菌株生物膜生长情况。将鲍曼不动杆菌于黑色聚碳酸酯膜上形成生物膜,其上覆盖药敏纸片,然后将此结构置于涂有大肠埃希菌ATCC25922菌株的M-H平板上,通过测量抑菌圈直径观察生物膜对氯霉素和氧氟沙星的渗透限制作用。结果结晶紫染色测定各菌株均能于体外形成生物膜。除85号菌株外,各菌株与对照组相比,对氯霉素均有明显渗透限制作用,而对氧氟沙星无明显作用。结论生物膜对某些药物的渗透限制作用是细菌耐药的重要机制之一。 游洋 顾伟杰 王铮 李晓霞 牛辰关键词:鲍曼不动杆菌 生物膜 耐药 渗透性 激光扫描共聚焦显微镜检测分枝杆菌与溶酶体融合的实验教学设计 被引量:1 2015年 介绍了使用经绿色荧光蛋白标记的海分枝杆菌侵染巨噬细胞,再利用激光扫描共聚焦显微技术检测分枝杆菌与巨噬细胞溶酶体融合的实验教学设计。该实验对研究分枝杆菌与巨噬细胞的相互作用以及分枝杆菌的致病机制具有重要意义,同时在教学实验中使学生更深入地理解激光扫描共聚焦显微镜检测技术,并培养学生的实践能力和科研创新意识。 乔可 王晴岚 牛辰关键词:激光扫描共聚焦显微镜 分枝杆菌 细胞因子风暴易发因素的检测和动态监测对重型和危重型新型冠状病毒肺炎的防控作用 被引量:13 2020年 新型冠状病毒肺炎(COVID-19)与2003年发生的严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome,SARS)有相似之处,但前者发生机制尚未阐明。现有证据提示,细胞因子风暴暴发过程与病毒感染的重症肺炎患者临床进程有潜在关联。现尝试借鉴SARS研究经验,结合细胞因子风暴暴发过程,探索COVID-19重型患者的临床进程。探讨动态监测细胞因子风暴对评估COVID-19患者病情的作用;并检测细胞因子风暴易发因素,用于及早预测病情由轻型转化为重型的潜在风险,从而为早期诊断和提早干预重型COVID-19提供线索。 严雨晨 赵超 牛辰 牛辰 荣星喻 邬永琳关键词:冠状病毒感染 病情评估 分枝杆菌glpX基因的功能 被引量:2 2014年 【目的】构建耻垢分枝杆菌(Mycobacterium smegmatis)glpX基因敲除株,研究其在生理代谢中的功能。【方法】利用分枝杆菌噬菌体Che9c重组系统构建耻垢分枝杆菌glpX基因敲除株;比较野生株及突变株在不同碳源培养条件下的生长差异;通过荧光实时定量PCR,比较野生株在以葡萄糖或油酸为唯一碳源培养下,glpX基因的表达水平。【结果】glpX突变株在以甘油或油酸为唯一碳源的培养基中无法生长;野生株在以油酸为唯一碳源培养下,glpX基因表达上调。【结论】glpX基因编码了分枝杆菌糖异生途径必需的和非冗余的果糖1,6-二磷酸酶(fructose 1,6-bisphosphatase,FBPase)。 王歆玮 任道元 高谦 牛辰关键词:分枝杆菌 糖异生