杨锦芬
- 作品数：50 被引量：189H指数：8
- 供职机构：广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 健康与养生
- 2006年
- 范海蛟杨锦芬
- 关键词：养生健康
- 阳春砂转录因子AvMYC4b的克隆及原核表达
- 2018年
- 目的阳春砂是中药砂仁的主要来源植物,其转录组中已筛选出预测与萜类合成相关的候选转录因子unigene,对其进行克隆、序列分析和原核表达,以进一步认识阳春砂药效物质萜类合成的调控元件。方法根据阳春砂转录组数据中预测为AvMYC4b的Unigene0074125序列设计特异引物,提取阳春砂叶片RNA并反转录成c DNA,以此为模板经PCR扩增得到AvMYC4b的核心片段,再通过RACE技术获得全长c DNA,然后进行编码区全长的GATEWAY TOPO克隆。通过LR反应构建原核表达载体,转化大肠杆菌Rosetta(DE3)细胞,以异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)和阿拉伯糖在16℃下培养诱导融合蛋白表达,收集菌体,经过裂解、超声、纯化,用SDS-PAGE检测蛋白表达结果。结果克隆获得的AvMYC4b全长有2 579 bp,包含195 bp的5’UTR,1 995 bp的ORF和389 bp的3’UTR,编码664个氨基酸,预测蛋白相对分子质量为72 211。经过生物信息学分析,AvMYC4b氨基酸序列与其他植物的MYC相似,含有转录因子MYC家族的保守结构域,预测可定位于细胞核中。成功构建重组表达载体p DEST17-AvMYC4b并转化Rosetta(DE3)细胞,经诱导表达得到AvMYC4b融合蛋白,SDS-PAGE结果显示蛋白相对分子质量约80 000,与预测相符。结论从阳春砂中克隆得到b HLH家族转录因子AvMYC4b,并建立了AvMYC4b原核表达系统,为该转录因子的生物功能研究奠定了基础。
- 王虹马东明蒋研风羊罗子俊杨锦芬
- 关键词：阳春砂转录因子原核表达
- 基于26S rDNA D1-D3区和mat K基因序列分析的阳春砂分子鉴别被引量：7
- 2010年
- 【目的】建立阳春砂不同栽培品种的DNA分子鉴别方法,为阳春砂的优良品种选育提供依据。【方法】以阳春砂栽培种长果、圆果、"春选"及海南砂为材料,用相应引物对26S rDNA D1-D3区和matK基因进行聚合酶链反应(PCR)扩增和测序,对测序结果进行分析,寻找差异位点,并根据序列构建系统发生树。【结果】测序得到的26S rDNA D1-D3序列为739 bp,阳春砂与海南砂在该区域存在4个碱基位点的差异。长果阳春砂与圆果阳春砂序列相同,但它们与"春选"阳春砂存在1个碱基位点的差异,根据26S rDNAD1-D3序列建立的系统发生树揭示了"春选"阳春砂与另外2个栽培品种间的区别。测序得到的matK序列为824 bp,阳春砂3个栽培品种的matK序列相同,与海南砂存在1个碱基位点差异。【结论】从分子水平上可鉴别阳春砂的3个栽培品种,"春选"品种比长果(或圆果)品种与海南砂有着更近的亲缘关系。
- 黄琼林杨锦芬段中岗何瑞詹若挺徐鸿华徐晖陈蔚文
- 关键词：阳春砂基因序列分析
- 辐射诱变对阳春砂果实挥发性萜类成分合成的影响
- 2021年
- 目的:分析辐射诱变对阳春砂果实中挥发性萜类成分的影响,为阳春砂辐射诱变育种提供实验依据。方法:提取辐射诱变株系和对照株系果实鲜品中果皮和种子团的挥发性萜类成分,采用GC-MS法分析挥发性萜类成分的种类和含量。结果:辐射诱变可提高阳春砂种子团中α-蒎烯、β-蒎烯、异松油烯、γ-萜品烯、β-石竹烯、檀香烯的含量,挥发性萜类总量及主要药效萜类含量无显著性变化。阳春砂辐射诱变株系果皮中α-蒎烯、β-蒎烯、侧柏烯、桧烯、芳樟醇、β-石竹烯、牛儿烯的含量都有显著性提高,并检测到5种新的萜类化合物,单萜和倍半萜总量均有极显著性的提高。结论:辐射诱变影响阳春砂果实挥发性萜类的合成,提高了抗逆相关的挥发性萜类的含量。
- 魏洁书赵圆圆杨锦芬付裕赵海莹
- 关键词：阳春砂辐射诱变果实
- 阳春砂1-去氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶基因的克隆及序列分析
- 为了保护阳春砂的基因资源,探明阳春砂药效物质萜类成分生物合成的调控机制,本研究对阳春砂萜类生物合成途径的上游关键酶——1-去氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(1-deoxy-D-xylulose-5-plaosphat...
- 杨锦芬陈蔚文何国振阿迪卡利徐晖何瑞詹若挺
- 关键词：阳春砂萜类化合物
- 文献传递
- 阳春砂3个萜类合酶基因启动子的克隆及其参与萜类调控的分析被引量：3
- 2021年
- 目的获得药用植物阳春砂Amomum villosum萜类合酶基因Av BPPS(bornyl diphosphate synthase)、AvLIS(linalool synthase)和AvHUS(humulene synthase)的启动子,探究其顺式作用调控元件参与萜类合成的调控。方法从阳春砂叶片基因组DNA(genomic DNA,gDNA)中分别克隆获得AvBPPS、AvLIS和AvHUS的gDNA序列,据此设计特异引物,再通过FPNI-PCR(fusion primer and nested integrated PCR,FPNI-PCR)方法分别克隆其启动子并进行生物信息学分析,结合转录组及对应萜类含量数据,分析其较为关键的顺式作用调控元件与萜类调控的关系。结果获得Av BPPS、AvLIS和AvHUS的gDNA长度分别为2374、2295、2362 bp,均包含相应基因的完整编码区和7个外显子。进一步克隆获得470、934、762 bp的启动子。AvBPPS启动子含有参与胚乳表达的顺式作用调控元件GCN4-motif,结合基因表达量的分析,该顺式作用调控元件调控了AvBPPS在阳春砂药用部位种子中的特异表达,进而影响了主要药效萜类成分龙脑、乙酸龙脑酯等在种子中的积累。AvLIS和AvHUS启动子均含有参与茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)反应的顺式作用调控元件,转录组和萜类含量的分析显示AvLIS响应高浓度MeJA的诱导,而AvHUS没有表现出对MeJA的响应。结论首次从药用植物阳春砂的启动子中发现了参与胚乳表达和MeJA反应的调控元件,为深入探究萜类合成关键酶的种子表达特异性和对MeJA响应的机制提供了基础,为萜类代谢的调控提供了操作元件。
- 赵海莹李萌林晓静赵圆圆梁慧琳叶泽萍杨锦芬
- 关键词：启动子阳春砂萜类化合物茉莉酸甲酯
- 柱花草9－顺式环氧类胡萝卜素双加氧酶及其编码基因与应用
- 本发明涉及基因工程领域，具体涉及柱花草9－顺式环氧类胡萝卜素双加氧酶及其编码基因与应用。本发明从柱花草(Stylosanthes guianensis)中克隆了9－顺式环氧类胡萝卜素双加氧酶的编码基因，命名为SgNCED...
- 郭振飞杨锦芬
- 文献传递
- 柱花草SgNCED1基因的克隆及功能分析
- 脱落酸(ABA)作为一种调控生长发育的激素，对植物多种生理过程起着调控作用。近年，ABA在植物适应逆境胁迫中的作用倍受关注。研究ABA合成途径中的关键酶，通过基因工程调控内源ABA的生物合成，成为提高植物抗逆性的一个重要...
- 杨锦芬
- 关键词：柱花草逆境胁迫转基因烟草脱落酸基因工程
- 文献传递
- 阳春砂实时荧光定量PCR内参基因的筛选被引量：2
- 2014年
- 【目的】筛选稳定表达的内参基因,用于阳春砂不同发育时期的果皮和种子团中基因表达量实时荧光定量PCR(qRTPCR)检测的校正。【方法】以阳春砂3个不同发育时期的果实(分为果皮和种子团)为材料,根据高通量测序得到的转录组和表达谱数据,选择5个表达稳定的常用内参基因β-actin、EF-1α、GAPDH、PGK和TUA作为候选基因,并利用qPCR技术检测它们在不同样品中表达水平的变化,使用GeNorm和NormFinder软件对基因的稳定性进行分析。【结果】5个内参基因在不同发育时期的果皮和种子团中的表达稳定性有明显的差异,其中GeNorm分析得到的内参基因的稳定顺序为:EF-1α=TUA>PGK>GAPDH>β-actin,NormFinder的分析结果中稳定性最好的是EF-1α,其次为TUA,其他3个内参基因稳定性的排列顺序与GeNorm软件的结果一致。【结论】可选用EF-1α和TUA作为阳春砂果实发育过程中基因表达量差异分析的双内参基因。
- 于安民王焕何雪莹邓可詹若挺杨锦芬
- 关键词：阳春砂荧光定量PCR内参基因基因表达果实
- 基于RNA-seq的阳春砂果实可溶性糖及萜类代谢的基因表达谱分析
- 药用植物产量取决于初生代谢产物的积累,而质量取决于次生代谢产物的积累.高等植物通过光合作用合成并积累葡萄糖、蔗糖等,蔗糖降解后生成葡萄糖和果糖再经一系列转化,进一步合成萜类等次生物质.蔗糖代谢水平的高低直接关系果实的发育...
- 于安民杨锦芬
- 关键词：阳春砂果实发育RNA-SEQ表达谱萜类化合物
