李洪涛
- 作品数：17 被引量：38H指数：3
- 供职机构：中国科学院昆明植物研究所更多>>
- 发文基金：国家科技基础条件平台建设计划中国科学院仪器设备功能开发技术创新项目国家科技基础性工作专项更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术天文地球更多>>
- 中国植物DNA条形码研究
- 李德铢杨俊波李洪涛高连明葛学军王红郁文彬
- 引领中国植物DNA条形码研究。组织植物DNA条形码研究团队，通过集体攻关与合作，完成中国种子植物75科141属1757种6286个样本(国际上获得数据量最大)的DNA条形码比较研究，自主提出将ITS/ITS2作为种子植物...
- 关键词：
- 关键词：植物DNA条形码种子植物植物分类学
- 真双子叶基部类群十种植物的CHS基因家族成员分析被引量：2
- 2006年
- 用PCR方法从目前极少被报道的真双子叶基部类群10种植物的总DNA中扩增出CHS基因外显子2的部分序列进行分析，经克隆后测序，共得到26个不同的片段。分析表明，所有序列具有较高的同源性（〉70％），每种植物有2—4个不同的拷贝，在金鱼藻中发现有一个拷贝（CedeCHS3）含有一段长29个碱基的缺失，可能已失去了该基因的功能，而来自银桦的GrroCHS8拷贝具有较多活性位点的变异，可能具有了新的功能。在对碱基含量的分析中表明，只有来自雀舌黄杨的序列有一定的GC偏好，特别是第三位的GC含量达70％以上。用贝叶斯法、最大简约法和邻接法构建的CHS基因的分子系统树均由3个主要分支构成，其中一个分支由来自金鱼藻的4个序列聚在一起构成了subfamilyⅡ，来自昆栏树的2个序列聚在一起网接于subfamilyⅢ中；来自独叶草的3个序列分散于同一亚家族（subfamilyⅠ）的不同分支中；而多数种的序列分散在相距较远的两个分支中，构成了两个主要的亚家族subfamilyⅠ、subfamilyⅢ。从所建分子系统树看真双子叶基部类群植物的CHS基因家族成员来源于该类群形成前的两个祖先拷贝，在不同植物这两个祖先拷贝经历了不同的进化过程，这些进化上的差异可能与不同植物的生活习性及生存环境的多样性相关。
- 杨俊波杨汉奇李德铢李洪涛
- 关键词：进化
- 遗传信息及其获取技术与iFlora被引量：6
- 2012年
- 随着世界主要国家和地区传统植物志的完成和即将完成,植物学进入后植物志时代。由于学科的积累和科技的发展,新一代植物志(iFlora)成为植物志发展的必然。本文概述了iFlora的特点、主要构件和应用范围;介绍了近三十年来遗传信息及其获取技术的发展概况,以及它们在iFlora中的重要作用;讨论了目前技术条件下各类遗传信息获取技术的优劣和整合提高的方法;提出了iFlora实施过程中的阶段性目标;以及随着数据信息的快速积累,相关技术特别是快速、简便测序技术和设备的发展与iFlora可能的最终发展目标。
- 李洪涛曾春霞高连明伊廷双杨俊波
- 关键词：遗传信息
- 中国西南野生生物种质资源数据库被引量：2
- 2018年
- 中国西南野生生物种质资源库是国家重大科学工程,在野生种质资源的收集保藏工作中扮演着重要角色,目的是保障国家重要战略生物资源。本数据库的构建开发,结合了野生生物种质资源收集和保藏的工作规范,主要包括采集、登记、检测、鉴定、库存和再生等方面信息,并按照相关管理办法对外开展实物和数据的共享,为国内外研究机构、高等学校、政府职能部门和公众提供服务。本数据库已收录植物种子、植物DNA样品和植物离体材料等数据信息11.6万余条,用户可以根据自己的需要对数据进行检索。本数据库的建设将有利于我国种质资源的收集、保藏和生物多样性保护,对生态保护有积极的示范意义。
- 李拓径李洪涛李德铢
- 关键词：野生生物野生种质资源数据库
- 基于ITS、rpl16和trnS-trnR DNA序列讨论锥形果属的系统位置被引量：3
- 2008年
- 基于核基因ITS和叶绿体基因rpl16、trnS-trnR的DNA序列讨论了锥形果属的系统位置,3个基因片段独立以及联合的分析为锥形果属Gomphogyne的系统进化研究提供了足够的信息。结果表明:(1)锥形果属是一个自然属;(2)雪胆属Hemsleya的短柄雪胆H.delavayi和圆锥果雪胆H.macrocarpa曾经被作为锥形果属的种,分子证据表明它们确实隶属于雪胆属;(3)锥形果属单独构成雪胆属的姊妹群,而并非是与绞股蓝属Gynostemma共同构成。
- 李洪涛李德铢
- 关键词：ITS分子系统学
- 一种基于二叉树的植物数据存储、鉴定方法及系统
- 本发明涉及一种基于二叉树的植物数据存储、鉴定方法及系统。该植物数据存储方法包括：将基本植物分类信息存储至二叉树的根节点；根据基本植物分类信息和植物检索表构建二叉树的多层子节点；第1层子节点为根节点的子节点，第i层子节点为...
- 李拓径李洪涛李德铢
- 文献传递
- 一种野生植物种子分库的计算工艺及系统
- 本发明涉及一种野生植物种子分库的计算工艺及系统，其中方法包括：首先确定种子萌发实验次数以及分发次数，种子萌发实验次数表示野生植物种子所需进行萌发实验的次数，分发次数表示野生植物种子所需进行科学研究的次数，再根据种子萌发实...
- 李拓径蔡杰秦少发何华杰张潇尹方云花杜燕杨湘云李洪涛李德铢
- 被子植物及其关键类群的分子系统发育和演化
- 伊廷双李德铢李洪涛张荣金建军曲小健张书东
- 准确的系统发育关系是所有演化生物学研究的先决条件。基于少量分子片段的分子系统学研究解析了大量系统发育关系，但被子植物及经历了快速辐射分化和复杂演化历史类群的很多重要节点的系统关系尚未解决，成为学科发展的瓶颈。系统发育基因...
- 关键词：
- 关键词：被子植物分子系统发育
- 高度降解样本中植物性DNA的检测引物
- 本发明公开了高度降解样本中植物性DNA的检测引物，该检测引物共有3个引物对且在检测过程中同时使用，分别为100碱基引物对，其序列如SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示；70碱基引物对，其序列如SEQ ID ...
- 杨静李洪涛杨俊波袁文斌杨继雄曾春霞
- 文献传递
- 一种基于二代测序的植物叶绿体全基因组组装成环方法
- 本发明是基于二代测序数据(如：Illumina平台)对植物叶绿体全基因组数据进行组装并构建成环的一种方法。本发明所提供的方法首先运用了数据过滤软件Trimmomatic、组装软件SPAdes和MASHMAP软件，然后利用...
- 赵磊李洪涛李德铢
- 文献传递
