方志俊
- 作品数：15 被引量：67H指数：5
- 供职机构：香港城市大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家杰出青年科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学环境科学与工程一般工业技术更多>>
- 一种葡聚糖芯片的再生方法、表征及其应用被引量：2
- 2007年
- 表面等离子体共振(surface plasmon resonance,SPR)生物传感器,作为一种适时快捷,无需标记的生物分子相互作用研究工具,已广泛应用于生物化学分析与研究。羧甲基化葡聚糖修饰的CM5传感芯片是Biacore系列仪器应用最为普遍的核心部件,目前CM5芯片主要从法玛西亚公司购买,价格昂贵,且一旦共价交联的受体分子失活,就不能重复利用。阐述了一种简便、低成本、用于SPR生物传感器的葡聚糖修饰金膜芯片的再生方法及其表征和应用。用此方法再生的芯片能被循环伏安法和原子力显微镜很好地表征,并成功地用于抗前列腺特异性抗原(prostate-specific antigen,PSA)固定和PSA检测,同时测定了PSA与其抗体之间的动力学和亲和常数。
- 李雪玲方志俊黄明辉曹慧敏赵建龙杨梦苏
- 关键词：SPR生物传感器前列腺特异性抗原检测
- 建立功能基因组与生物芯片创新技术平台开发新药产品
- 杨梦甦曹晖肖培根方宏勋黄明辉曾志雄方志俊张金超陈瑶
- 该项目为国家高技术研究发展计划（863计划）项目的功能基因组与生物芯片重大专项，属于生物技术领域的重大项目。该项目结合功能基因组与生物芯片技术，建立了中药研究与新药开发的创新技术平台。该技术平台的核心包括基因表达谱芯片技...
- 关键词：
- 关键词：中药生物芯片功能基因组
- 基因芯片分析显示昆明山海棠有机萃取液经NF- κB及线粒体信号传导途径诱导HL- 60细胞凋亡(英文)被引量：9
- 2003年
- 目的 研究中草药昆明山海棠 Tripterygium hypoglaucum( THH)有机萃取液诱导人早幼粒白血病 HL-6 0细胞凋亡过程的信号传导通道及分子机制。方法 应用流式细胞仪研究了 THH有机萃取液诱导 HL - 6 0细胞的凋亡过程 ,并应用包含 3 0 0 0人类基因与 EST的基因芯片进行基因表达差异分析。结果 基因芯片杂交结果显示有 16个基因表达发生大于 2倍的显著变化 ,这些基因同细胞生长 ,细胞周期调控 ,细胞分化 ,以及压力反应有关。部分基因在细胞凋亡过程中起关键作用 ,如 Caspase3和 Caspase8。结论 THH有机萃取液诱导 HL- 6 0细胞凋亡 ,该过程与 NF- κB和线粒体信号传导途径有关。
- 方志俊曹佳敖琳庄为笕方宏勋肖培根杨梦苏
- 关键词：基因芯片昆明山海棠线粒体信号传导途径HL-60细胞凋亡
- 小鼠毒理基因芯片的可靠性验证被引量：4
- 2006年
- 背景与目的建立小鼠毒理基因芯片杂交检测方法,同时验证芯片数据的可靠性。材料与方法采用数据的标准化处理、芯片内的参照点分析、自身比较实验以及差异分析实验方法,检验芯片数据的可靠性。结果局部均值化标准化方法使数据的线性趋势更加明显;参照点分析显示芯片无非特异性杂交,芯片内部基因表达的重复性较高;自身比较实验中各个批次芯片的假阳性率在1%以下,并且无明显差异;差异分析实验中荧光交换标记方法可以减少染色误差的影响。结论以上结果初步表明,所建立的基因芯片制作和检测技术能保证获得可靠性较好的数据。
- 敖琳高利宏胡冉曾志雄方志俊曹佳杨梦苏
- 关键词：基因芯片毒理学可靠性分析
- 丙烯酰胺诱导人白血病HL-60和NB_4细胞hprt基因的分子突变谱被引量：24
- 2001年
- 为了研究丙烯酰胺的遗传毒理作用 ,采用单细胞克隆培养 ,双向筛选计数 ,多重PCR扩增与电泳分析 ,研究了诱导HL 6 0和NB4 两种细胞hprt基因突变率及分子突变谱 .发现只有丙烯酰胺高剂量组 (70 0mg·L- 1)才对两种细胞有明确的致hprt基因突变作用 ;丙烯酰胺诱发突变主要由点突变和缺失两部分组成 (40 .0 %～ 6 6 .7% ,33.3%～ 6 0 .0 % ) ,而自发突变几乎全是点突变 (90 .0 %以上 ) ,两种细胞均无全基因缺失型 ;缺失突变可以发生于hprt基因上的每个外显子 (除外显子 7/ 8以外 ) ,较集中于基因的 3′末端 ,且诱发突变中绝大多数是点突变与单个外显子缺失 (93.3% ,86 .1% ) ,两种细胞情况类似 .结果提示 ,丙烯酰胺具有较弱的诱导hprt基因突变的作用 ,且诱发突变与自发突变的分子图谱不一样 。
- 刘胜学曹佳杨梦甦方志俊安辉
- 关键词：HPRT基因NB4细胞白血病
- 基于伪F统计量的模糊聚类方法在基因表达数据分析中的应用被引量：12
- 2002年
- 目的 通过对基因芯片数据的分析 ,提出一种基因表达的分类方法。方法 首先 ,应用FCM模糊聚类法(FuzzyClusteringMethod)进行聚类 ,然后我们应用PFS(PseudoF statistics)统计量作为一个判别函数来确定最佳类数目。结果 将本方法应用于模拟数据、人类纤维原细胞血清基因表达数据上 ,其结果明显好于K 均值法。结论 本方法基于没有聚类数据的任何先验知识和组成成分信息的前提下 ,考虑如何确定数据的分类结构。根据实际结果发现 。
- 易东张彦琦王文昌张蔚杨梦苏黄明辉方志俊
- 关键词：基因模糊聚类法数据分析
- 海洋青鳉鱼专用型基因芯片的设计及其在生态毒理学上的应用研究被引量：7
- 2010年
- 以生物芯片技术为核心,结合生态毒理学与功能基因组学的方法,制备了海洋青鳉鱼专用型生物芯片,包含180个与细胞分裂、解毒反应、缺氧反应、氧化应激反应、凋亡、生长和发育、性别决定和性腺分化以及生殖激素分泌等功能相关的基因.我们提取了雌性海洋青鳉鱼成体在正常培养和缺氧处理12周后的肝脏和卵巢组织总RNA,利用自制的基因芯片进行了基因表达谱分析,结果显示海洋青鳉鱼在缺氧压力环境下,肝脏和卵巢组织的差异性表达基因分别检测出9个和6个,表明应用此类自制良好的芯片可有效获得海洋青鳉鱼的组织特异性基因表达图谱,也将加强对海洋缺氧状态、氧化应激等反应的分子生物学机制的理解.本研究对于识别异常环境状态下的基因表达模式和组织特异性标志物,进一步开展监测海洋生态毒理因素的研究奠定良好的基础.
- 陈瑶方志俊郑金树张琦曾志雄胡绍燊杨梦甦
- 关键词：海洋生物学生态毒理学生物芯片缺氧
- 一种海洋青鳉鱼特异性组织的均一化cDNA文库及制备方法
- 本发明公开了一种海洋青鳉鱼特异性组织的均一化cDNA文库及制备方法，涉及cDNA文库领域，具体涉及一种海洋青鳉鱼特异性组织的均一化cDNA文库及制备方法。该文库是从海洋青鳉鱼的一种或几种特异性组织制备的。所述的均一化cD...
- 杨梦甦陈瑶方志俊张琦曾志雄胡绍燊
- 文献传递
- 佛波酯等3种促癌物诱导BALB/c3T3细胞骨桥素基因表达升高
- 2005年
- 敖琳曹佳刘晋祎刘胜学杨梦苏曾志雄方志俊
- 关键词：细胞转化佛波酯岗田酸氯化镉
- 佛波酯等3种促癌物诱导BALB/c3T3细胞骨桥素基因表达升高
- 2006年
- 目的探讨促癌物佛波酯(12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate,TPA),岗田酸(okadaic ac id,OA)和氯化镉(cadm ium chloride,CdC l2)在促进BALB/c 3T3细胞转化过程中对骨桥素基因(OPN)转录表达的影响。方法以N-甲基-N′-硝基-N-亚硝基胍(MNNG)为启动剂,TPA,OA和CdC l2分别为促癌剂,建立BALB/c 3T3细胞转化模型。采用小鼠毒理基因芯片分别检测促癌物处理过程中和转化细胞集落中的基因表达变化,同时采用实时RT-PCR验证部分细胞样本的OPN基因表达。结果基因芯片检测结果显示,3种促癌物在作用过程中均能诱导OPN基因表达升高,其中TPA处理后4 h,7 d和17 d,OA处理后3,7 d和24 d,CdC l2处理后3 d和7 d,OPN基因的表达较对照组增强;同时在促癌物诱导形成的9个转化细胞集落中,有8个转化集落检测到OPN基因表达升高。此外,实时RT-PCR检测也验证了OPN基因的表达升高。结论OPN基因与TPA,OA和CdC l2的促癌作用存在密切联系。
- 敖琳刘晋祎高利宏刘胜学杨梦苏曾志雄方志俊曹佳
- 关键词：促癌物佛波酯岗田酸氯化镉
