夏晓峰
- 作品数：3 被引量：0H指数：0
- 供职机构：福州市疾病预防控制中心更多>>
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- 中国2009年甲型H1N1流感病毒进化分析
- 2010年
- 目的研究2009年中国甲型H1N1流感病毒的进化特性和变异情况,为甲型H1N1流感的监控和防治提供科学依据。方法利用ClustaX进行序列比对,以Bioedit软件进行序列同源性分析,使用Mega 4.0软件采用邻位相连算法构建进化树,对2009年登录在Genbank数据库中的中国甲型H1N1流感病毒的HA、NA、M蛋白的氨基酸序列进行系统进化分析。结果中国2009年甲型H1N1流感病毒分离株与美国分离株[A/California/04/2009(H1N1)]具有很近的亲缘关系,不同省份分离株之间的HA、NA、M蛋白相互交叉渗透,但同时各个省份间暴发的H1N1流感病毒的HA蛋白又具有一定的聚集性。香港分离株[A/Hong Kong/2369/2009(H1N1)]和上海分离株[A/Shanghai/LWS1/2009(H1N1)]产生了对达菲的耐药性,其他毒株仍然敏感;上海分离株[A/Shanghai/LWS1/2009(H1N1)]对金刚烷胺类药物敏感,其余毒株均对其耐药。结论本研究表明,中国2009年甲型H1N1流感病毒不仅具有很强的保守性,同时又具有一定的区域特异性,毒株相对稳定,没有出现大的变异。
- 夏晓峰姚栩杨建娜张彩云陈智伟郑能雄
- 关键词：猪流感H1N1血凝素神经氨酸酶基质蛋白
- 福州市甲型H1N1流感病毒血凝素基因遗传特性研究
- 2011年
- 目的探究福州市甲型H1N1流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因的遗传变异特点及种系进化分布,为研究甲型H1N1流感病毒进化、致病性和流行规律提供科学依据。方法采用MDCK细胞培养法和real-time PCR法进行流感病毒分离、鉴定。采用逆转录-聚合酶链反应扩增流感病毒血凝素基因,扩增产物经纯化后,进行血凝素基因HA区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后用DNASTAR MegAlign序列分析软件进行基因种系进化特性分析。结果福州市甲型H1N1流感病毒与参考株A/California/04/2009相比具有高度同源性,HA蛋白有4个位点氨基酸发生了替换,与猪流感代表株A/swine/Iowa/15/1930(H1N1)存在6个HA抗原决定簇位点变异。福州市甲型H1N1流感病毒株都有8个糖基化位点,其中6个位于HA1区,分离株HA蛋白不具有多碱基裂解位点,具有低致病性流感病毒特点。与美国流感病毒A/California/04/2009(H1N1)株共聚类为一个独立的小分支,进化关系最近,甲型H1N1流感病毒的HA源于古典型猪H1N1流感病毒,与A/swine/Iowa/1/1976(H1N1)的种系关系密切。结论福州市首例甲型H1N1流感病毒株与北美流行株高度同源,相对于以往古典型猪流感代表株出现HA蛋白抗原性漂移,应进一步加强流感病原学变异监测。
- 姚栩陈智伟张彩云夏晓峰杨建娜郑能雄
- 关键词：甲型H1N1流感病毒血凝素基因
- 福州市2010年甲型H1N1流感病毒分离株血凝素基因分子进化分析
- 2011年
- 目的了解福州市2010年甲型Hl N1流感病毒HA基因的突变和分子进化。方法采用RT-PCR技术扩增流感病毒A/Fuzhou/2/2010(H1N1)血凝素HA基因,测定核苷酸序列,用Clus-talX 1.83软件进行序列比对,用Bi-oedit软件的Clusta W程序进行序列同源性分析,用Mega 5.0软件以邻位相连算法(NJ)构建系统进化树。结果福州市2010年甲型Hl N1流感分离株A/Fuzhou/2/2010(H1N1)与福州市2009年首例甲型Hl N1流感病毒株HA基因同源性为98.9%,与疫苗参考株A/California/07/2009 HA基因同源性为98.5%;HA1区段有11个位点发生改变。结论福州市2010年甲型Hl N1流感病毒血凝素虽然个别氨基酸位点发生了突变,但在抗原决定簇位点的氨基酸并没有发生变化,未出现具有显著意义的抗原漂移。
- 纪惠玲季钧淘夏晓峰陈艳陈智伟张彩云姚栩
- 关键词：甲型H1N1流感病毒血凝素基因同源性
