付继芸
- 作品数：3 被引量：1H指数：1
- 供职机构：中国科学院计算机网络信息中心更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术电子电信更多>>
- GPU异构平台上的第一性原理计算
- 平面波赝势密度泛函方法是材料科学计算中最常用的方法,但是其CPU代码计算时间长并且扩展性差,限制了其在超级计算机上的绝对速度。本文综述了使用图形处理器加速第一性原理计算软件的发展,讨论了VASP (VIENNA AB-I...
- 贾伟乐曹宗雁付继芸王龙
- 关键词：第一性原理计算GPU量子力学电子结构密度泛函理论
- 文献传递网络资源链接
- GPU集群下第一原理非局部映射势能计算
- 2013年
- 平面波赝势密度泛函(PWP-DFT)计算是材料计算中应用最广泛的方法,其中映射计算是PWP-DFT方法求解自洽迭代中重要的一部分。针对映射势能计算成为软件加速的瓶颈,提出了针对该部分的图形处理器(GPU)加速算法,其中考虑GPU的特点:1)使用了新的并行机制求解非局部映射势能;2)重新设计了数据分布结构;3)减少内存的使用;4)提出了一种解决算法中数据相关问题的方法。最终获得了18～57倍加速,使每步分子动力学模拟最终降为12 s。详细分析了该模块在GPU平台上的测试时间,同时对该算法在GPU集群上的计算瓶颈进行了讨论。
- 付继芸贾伟乐曹宗雁王龙叶煌迟学斌
- 关键词：第一性原理密度泛函理论GPU加速
- GPU异构平台上的第一性原理计算被引量：1
- 2012年
- 平面波赝势密度泛函方法是材料科学计算中最常用的方法,但是其CPU代码计算时间长并且扩展性差,限制了其在超级计算机上的绝对速度。本文综述了使用图形处理器加速第一性原理计算软件的发展,讨论了VASP(Vienna Ab-initio Simulation Package),Quantum Espresso,PEtot使用的不同的加速策略,提出了众核平台上平面波赝势方法并行机制的改进,最后展望了使用图形处理器求解第一性原理计算的挑战和前景。
- 贾伟乐曹宗雁付继芸王龙
- 关键词：第一性原理计算GPU量子力学电子结构密度泛函理论
