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严文颖
作品数:
9
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供职机构:
苏州大学
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相关领域:
自动化与计算机技术
生物学
文化科学
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合作作者
杨洋
苏州大学
朱斐
苏州大学
吕强
苏州大学
沈百荣
苏州大学
郁春江
苏州大学
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苏州大学
作者
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严文颖
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杨洋
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朱斐
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沈百荣
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吕强
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郁春江
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基于多任务学习的生物医学实体抽取方法
本发明公开了一种基于多任务学习的生物医学实体抽取方法,本发明基于多任务学习的生物医学实体抽取方法通过多任务实体抽取模型进行实体抽取,将第一预训练语言模型作为共享的编码层,来学习各个子任务的共同语义特征,并将学习的语义特征...
卢禹炜
杨洋
严文颖
基于结构网络模型的蛋白质功能位点预测方法
本发明涉及一种基于结构网络模型的蛋白质功能位点预测方法,包括:预测蛋白质结合位点;输入关于演化、物理化学性质、结构以及动态性这四个方面衡量蛋白质中每个残基的性质;基于蛋白质的三维结构对每个蛋白质构建其点加权的蛋白质结构网...
严文颖
沈百荣
杨洋
一种基于序列预测蛋白质变性温度的系统及其方法
本发明公开了一种基于序列预测蛋白质变性温度的系统及其方法,该系统由蛋白质信息输入模块、蛋白质序列特征计算模块、蛋白质稳定性预测模块、预测结果输出模块和数据库组成。该预测方法主要为首先获取单一或批量蛋白质序列,并计算蛋白质...
杨洋
朱冠臣
丁雪松
吕强
严文颖
朱斐
预测氨基酸变异对蛋白质结构稳定性影响的系统及其方法
本发明公开了一种预测氨基酸变异对蛋白质结构稳定性影响的系统及其方法,该系统由氨基酸变异信息输入模块、氨基酸变异位点属性计算模块、蛋白质序列属性计算模块、预测稳定性变化模块、预测结果输出模块组成;该方法的步骤为录入并获取变...
杨洋
朱斐
严文颖
钱福良
郁春江
文献传递
氨基酸相互作用网络的构建、分析及应用
蛋白质是一类常见的生物大分子,在生命活动中起了重要的作用。从全局的角度去研究蛋白质结构、演化或蛋白质中的关键残基等问题是十分必要的。将蛋白质分子转化成以氨基酸为结点,它们之间的相互作用为边的氨基酸相互作用网络,利用复杂网...
严文颖
关键词:
氨基酸
聚类系数
网络参数
系统生物学
基于结构网络模型的蛋白质功能位点预测方法
本发明涉及一种基于结构网络模型的蛋白质功能位点预测方法,包括:预测蛋白质结合位点;输入关于演化、物理化学性质、结构以及动态性这四个方面衡量蛋白质中每个残基的性质;基于蛋白质的三维结构对每个蛋白质构建其点加权的蛋白质结构网...
严文颖
沈百荣
杨洋
文献传递
一种嗜热蛋白预测方法及装置
本发明涉及蛋白质工程技术领域,尤其是指一种嗜热蛋白预测方法及装置;本发明所述的嗜热蛋白预测方法,结合蛋白质序列本身和序列衍生的生物特征来预测嗜热蛋白。该方法利用卷积神经网络提取蛋白质序列的局部关键信息;然后使用双向长短期...
赵建君
杨洋
严文颖
一种基于序列预测蛋白质变性温度的系统及其方法
本发明公开了一种基于序列预测蛋白质变性温度的系统及其方法,该系统由蛋白质信息输入模块、蛋白质序列特征计算模块、蛋白质稳定性预测模块、预测结果输出模块和数据库组成。该预测方法主要为首先获取单一或批量蛋白质序列,并计算蛋白质...
杨洋
朱冠臣
丁雪松
吕强
严文颖
朱斐
文献传递
基于多任务学习的生物医学实体抽取方法
本发明公开了一种基于多任务学习的生物医学实体抽取方法,本发明基于多任务学习的生物医学实体抽取方法通过多任务实体抽取模型进行实体抽取,将第一预训练语言模型作为共享的编码层,来学习各个子任务的共同语义特征,并将学习的语义特征...
卢禹炜
杨洋
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