韦建文
- 作品数：25 被引量：7H指数：1
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术电子电信生物学更多>>
- 异构集群上的宏基因组聚类优化
- 2017年
- 宏基因组基因聚类是筛选致病基因的新型方法,其依赖于海量的测序数据、有效的聚类算法以及高效的计算机来实现。相关系数矩阵的计算是进行聚类前必须完成的操作,占总计算量的比重较大。以某基因库为例,包含1300个样本、每样本百万基因的数据,单线程运行需要27年。充分发挥多核CPU的潜力,利用GPU加速卡强大的计算能力,将程序扩展到多节点集群上运行,是重要而迫切的工作。在仔细分析算法的基础上,首先针对单CPU节点和单GPU卡做了高效实现,获得了接近理想的加速比;然后利用缓存优化进一步提升性能;最后使用负载均衡方法在MPI线程间分发计算任务,实现了良好的扩展。相比未优化的单线程程序,16节点CPU获得了238.8倍的加速,6块GPU卡获得了263.8倍的加速。
- 韦建文许志耿王丙强Simon SEE林新华
- 关键词：基因聚类异构计算缓存优化
- 基于有限体积法求解声子玻尔兹曼方程的GPU并行加速方法
- 一种基于有限体积法求解声子玻尔兹曼方程的GPU并行加速方法，通过划分非结构网格，确定边界条件和计算参数并初始化能量密度分布后，从CPU内存向GPU显存传输每个网格单元之间的影响系数；然后计算声子散射项，并使用稳定双共轭梯...
- 文敏华刘永志林新华鲍华沈泳星胡跃王一超韦建文
- 文献传递
- 上海交通大学:面向数据中心的软件定义网络被引量：3
- 2013年
- SDN真正广大的市场是传统的企业数据中心。
软件定义网络
软件定义网络是一种新型的网络架构，它解耦了网络的控制层与数据转发层，在逻辑集中的控制平面为用户和开发者提供了一个可编程的接口，同时能够对底层的网络作切片和虚拟化，使整个网络变得更加可控。
- 罗萱黄保青韦建文金耀辉
- 关键词：网络架构数据中心SDN控制层开发者
- 被动网络性能测量系统及其页面识别方法
- 一种计算机网络技术领域的被动网络性能测量系统及其页面识别方法，该系统包括：网络踪迹采集模块、网页元素解析模块、网页识别模块和信息统计模块，本发明采用被动网络测量的方式、在网络接入链路上设置踪迹采集点来获取原始的测量数据，...
- 陈夏明金耀辉杨鑫韦建文叶伟
- 基于GPU加速的宏基因组基因聚类方法
- 宏基因组主要研究特定环境中微生物的组成及与环境因素的交互关系,其任务之一是将不同基因按照样本特征进行聚类,进而研究各类之间的相互关系.由于样本量m-般在上千左右,每个样本中包含的基因数量n也在百万左右,且符合数据特性的聚...
- 郭贵鑫陆旭佳邱爽林哲王丙强方林韦建文林新华Simon See
- 关键词：宏基因组基因聚类图形处理器
- 文献传递
- 用于处理射电望远镜数据的脉冲星搜索并行优化方法
- 一种用于处理射电望远镜数据的脉冲星搜索并行优化方法，以多线程方式对搜索射频干扰中每个区间的频率通道进行去除射频干扰，并将射频干扰数据记录到观测数据中；根据消色散方案并采用进程线程配置算法，对每个进程需执行的命令以及命令的...
- 韦建文张晨飞张仲莉安涛林新华
- 文献传递
- 光纤瑞利散射信号探测器
- 本发明是一种光通信技术领域的光纤瑞利散射信号探测器，包括一个石英的椭圆柱体，所述椭圆柱体由两个沿长轴方向切开的半椭圆柱体组成，在椭圆柱体的两个焦点处设有两个大小相等的圆形通道，在其中一个通道中设置与通道形状、长度相同的光...
- 肖石林史杰韦建文陈荷
- 文献传递
- N体模拟在异构架构的并行加速实现方法
- 一种N体模拟在异构架构的并行加速实现方法，通过初始化后更新缓冲区，通过CPU内存与GPU显存之间的信息传输后，依次通过GPU以分桶算法计算粒子之间的短程力并返回结果至CPU端；通过CPU计算粒子之间的长程力及加速度后更新...
- 文敏华胡航王一超韦建文林新华
- N体模拟在异构架构的并行加速实现方法
- 一种N体模拟在异构架构的并行加速实现方法，通过初始化后更新缓冲区，通过CPU内存与GPU显存之间的信息传输后，依次通过GPU以分桶算法计算粒子之间的短程力并返回结果至CPU端；通过CPU计算粒子之间的长程力及加速度后更新...
- 文敏华胡航王一超韦建文林新华
- 文献传递
- 基于波长转换技术的一种低成本WDM-EPON方案被引量：1
- 2010年
- 提出了一种新的波分复用以太网无源光网络(WDM-EPON)方案。该方案基于注入锁模和波长转换技术,可以重用现有EPON网络中的光网络单元(ONU),实现了由EPON向WDM-EPON的平滑升级。系统中,使用工作在注入锁定模式的FP激光器输出作为波长转换节点的输入探测光,显著降低了成本。仿真实验验证了这种低成本WDM-PON方案及其在升级应用中的可行性。
- 向祎肖石林朱敏毕美华杨铖韦建文
- 关键词：注入锁模FP激光器
