肖薪龙
- 作品数：7 被引量：21H指数：3
- 供职机构：中国科学院新疆生态与地理研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金新疆维吾尔自治区自然科学基金中国科学院“百人计划”更多>>
- 相关领域：生物学农业科学环境科学与工程建筑科学更多>>
- 不同葡萄品种的抗逆基因对锰毒响应的表达被引量：1
- 2016年
- 近年来的研究发现，葡萄对高锰胁迫具有极强的抗性，但是其耐锰生理仍不清楚。以2种对锰富集相反的葡萄品种（根系富集的金手指和地上部富集的康拜尔品种）为研究材料，采用沙培实验法，用不同浓度的NnSO。溶液进行锰毒胁迫处理，通过荧光定量PCR，分析锰胁迫相关基因在2种葡萄的叶片及根部表达的差异，挖掘耐锰相关基因，探讨基因表达的品种差异性及组织差异性。结果表明：在高锰（10g·L^-1）胁迫下，金手指葡萄根系中葡萄油菜素内酯-6-氧化酶基因表达量上调2倍，其余几个基因没有明显变化，在其叶片中葡萄铜伴超氧化物歧化酶基因、葡萄油菜素内酯-6-氧化酶基因都上调2倍，病程相关基因表达量上调5倍，而葡萄4-香豆酸：辅酶A连接酶基因下降为CK组的一半。康拜尔根系中油菜素内酯-6-氧化酶基因、3-脱氧-D-阿拉伯庚酮糖-7-磷酸合成酶基因和葡萄紫色酸性磷酸酶3类似酶基因都上调了2倍，叶片中的病程相关基因上调了2—3倍。实验表明，高锰胁迫下，2种葡萄都会通过抗逆基因的差异表达来应对锰毒，同时，磷酸水解酶类也协同作用。由于2种葡萄不同的锰富集方式，这些抗逆基因在根系和叶片也呈现出不同的调控方式。在这些差异表达中，病程相关蛋白1基因和油菜素内酯-6-氧化酶基因表现的最为明显，在抵抗锰胁迫中可能发挥了较大的作用。
- 郭琬莹肖薪龙尹文彦姚银安
- 关键词：葡萄锰抗逆基因荧光定量PCR
- 新疆杨不同成熟度叶片在碱胁迫下的生理响应被引量：5
- 2015年
- 【目的】了解碱胁迫下不同成熟度杨树叶片的生理响应差异,为揭示干旱地区木本植物耐碱机制提供理论依据。【方法】以新疆地区分布面积较大的树种银白杨变种新疆杨为材料,进行碱处理(土壤pH8.5~9.0,100 mmol·L^(-1)Na+),分析碱胁迫下新疆杨不同成熟度叶片的离子含量(Na+,K+,Na+/K+,Mg^(2+),Ca^(2+))变化及分配规律、光和色素[叶绿素和类胡萝卜素(Car)]响应和抗氧化生理指标[过氧化氢酶(CAT),超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、丙二醛(MDA)]的变化【结果】与未成熟幼叶相比,对照条件下新疆杨老叶含有较高的Na十含量和较低的K十含量,有较高的Na+/K+;碱胁迫下新疆杨的Na+含量和Na+/K+在成熟老叶中进一步大幅度升高,而在幼叶中无明显变化,K+含量在老叶和幼叶中受碱胁迫均无明显变化;相反,二价离子(Ca^(2+)和Mg^(2+))含量在对照条件下主要在老叶中积累,碱胁迫下Ca^(2+)和Mg^(2+)在成熟老叶中下降而在幼叶中升高。新疆杨老叶的光合色素含量(叶绿素a,叶绿素b和类胡萝卜素)在对照条件下显著高于幼叶,但是碱胁迫下老叶的光合色素含量大幅度下降并低于幼叶含量;而幼叶的叶绿素(a,b及总叶绿素)维持不变,类胡萝卜素甚至显著升高。同时老叶膜脂过氧化水平(丙二醛含量)显著升高,在幼叶中仍然维持了较低水平。老叶内抗氧化酶活性如CAT、SOD,POD碱胁迫下均大幅度升高,幼叶中上述抗氧化酶除SOD酶稍微下降外均没有显著变化,保持较低水平。【结论】碱胁迫下新疆杨叶片多余的Na十几乎完全进入了老叶这种离子分配策略使老叶受到严重氧化胁迫;面对盐碱敏感的幼叶可避免离子危害且受到良好的保护。这种有利于幼叶的离子分配方式是新疆杨抵抗碱胁迫的重要生存策略对其在荒漠地区的生存具有重要意义。
- 张选肖薪龙李鹏勃孙玉芳郭琬莹姚银安
- 关键词：新疆杨碱胁迫幼叶老叶生理响应
- 盐角草高亲和钾离子转运蛋白SeHKT1基因的克隆及表达分析被引量：6
- 2015年
- 利用RACR技术从盐生植物盐角草中克隆Se HKT1基因,Gen Bank登录号为KP739261,用生物信息学方法对获得的基因序列进行分析,利用q RT-PCR方法研究Se HKT1基因在不同组织和不同盐胁迫下的表达特性。结果表明,该基因c DNA序列含有1个1 761 bp的完整ORF,编码550个氨基酸,Blast分析表明该蛋白与毕氏海篷子Sb HKT1蛋白亲缘关系较近。q RT-PCR分析表明Se HKT1基因在Na Cl处理下地上部和地下部均诱导上调表达,主要在盐角草根部表达,在地上部表达相对较低,200mmol/L Na Cl处理6 h后在根部表达量达到最高,随后逐渐降低;在钾饥饿条件下,该基因在根部和地上部的相对表达量均高于对照。说明Se HKT1不仅能响应N a Cl胁迫,还能在缺钾条件下提高表达,发挥高亲和钾离子载体功能。
- 马金彪张大勇张梅茹肖薪龙张选李丽
- 关键词：盐角草RACE耐盐性
- 盐角草(Salicornia europaea)对NaCl处理的生理响应被引量：9
- 2014年
- 用含有NaCl的Hoagland培养液处理盐角草(Salicornia europaea)11d。检测其鲜重,干重,离子含量,电导率,溶解性总固体(TDS)含量,超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)活性及丙二醛(MDA)浓度。结果表明:随着NaCl浓度的增加,盐角草干重和鲜重呈现先上升后下降的趋势,相对电导率、TDS、SOD、POD、CAT及MDA均呈现先下降后上升的趋势,在NaCl溶液浓度为200mmol·L-1左右时,干重和鲜重的值达到最大,电导率、TDS、SOD、POD、CAT、MDA含量达到最小值;500mmol·L-1和800mmol·L-1时,SOD和CAT活性下降,电导率、TDS、POD、MDA含量则急剧上升。由此说明,一定浓度的NaCl溶液促进了盐角草的生长,200mmol·L-1左右是其生长的最适浓度,500mmol·L-1和800mmol·L-1高盐浓度会对盐角草的膜结构、酶系统等造成不同程度的损伤。盐角草主要将Na+、K+积累在地上部,且随着NaCl处理浓度的增大,Na+含量逐渐增加、K+含量逐渐降低,这可能是盐角草调节细胞内离子平衡对抗盐胁迫的一种适应策略。
- 张梅茹马金彪姚银安张选肖薪龙
- 关键词：NACL离子平衡
- 利用分析Unigene在转录组中表达模式的方法拼接盐角草铵转运基因
- 2014年
- RNA-seq技术能够全面快速地获得物种在某一状态下的转录本序列信息,但测序并组装后的大量Unigene往往不包含完整ORF(Open reading frame)。转录组库具有一定的冗余性,存在着属于同一个转录本的Unigene,这些Unigene因为无重叠区不能拼接而存在转录组库中。基于这种情况,为了拼接铵转运蛋白家族Unigene,首先挑选注释为AMT(Ammonium transporter)且ORF不完整的所有Unigene(5条),通过分析Unigene在4个转录组的表达模式,其中2条Unigene(Uni4和Uni5)具有相同的表达模式,推测可能来自同一转录本。然后通过NCBI blastx将这2条Unigene与参考物种的AMT蛋白质比对,确定其在转录本的位置及序列相互间没有交叠(如果两条编码序列相互交叠则不能组成同一个转录本)。结果发现Uni4和Uni5分别位于参考转录本5′端和3′端位置,因此假定它们属于同一个转录本,中间空缺约120 bp未知序列。通过试验验证,分别在Uni4和Uni5上设计单正向引物和单反向引物,PCR扩增得到约800 bp片段,将其测序并与两条Unigene比对,证实Uni4和Uni5属于同一转录本且获得了缺失的未知序列。最终拼接得到1 667 bp序列,包含1 482 bp完整ORF,编码494个氨基酸,通过系统进化分析将其归类为amt1亚家族,命名为Seamt1。生物信息学手段预测Se AMT1蛋白与已知的其他物种AMT性质相似。本研究采用转录组Unigene表达模式聚类的方法挖掘潜在的同一转录本Unigene,并且通过另外两组Unigene检验了该方法的可行性。这一便捷方法有助于转录组中Unigene的延伸和拼接,有助于完整ORF的获得及后期基因功能研究。
- 肖薪龙张选吴晓朦马金彪姚银安
- 关键词：转录组测序克隆方法氮吸收
- 一种用于提取植物RNA批量粉碎样品的方法
- 本发明涉及一种用于提取植物RNA批量粉碎样品的方法，该方法涉及装置是由泡沫盒、离心管架、离心管、泡沫块和固定片组成，将泡沫盒内放置一个2mL离心管架，其周围用泡沫块固定，然后再将泡沫盒预先用液氮冷却，将装有样品和钢珠的离...
- 肖薪龙姚银安
- 文献传递
- 系统评价植物在盐和干旱胁迫条件下荧光定量内参基因
- 合适的内参基因是准确归一化荧光定量数据的前提条件.然后,在已发表的研究中,内参基因筛选结果却各不相同.目的：本研究通过收集基因的geNorm 排名,数据转换和统计分析,系统评植物在干旱和盐胁迫下各个内参基因.结果：尽管没...
- 肖薪龙吴晓朦马金彪李鹏勃李涛涛姚银安
- 关键词：多基因家族非生物胁迫
