留珊红
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 供职机构：福建师范大学化学与化工学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 甘氨酸二肽分子酰胺-Ⅰ带光谱与结构相关性被引量：1
- 2016年
- 系统探索了蛋白质二肽模型分子——甘氨酸二肽(GLYD)在气相与水溶液中的结构与光谱特性。从分子动力学轨迹中提取具有代表性结构的GLYD-D_2O聚集体的瞬态结构开展简正模式分析,获取了对蛋白质二级结构敏感的酰胺-Ⅰ带的振动光谱参数,建立起振动光谱与特征基团结构间的相关性。将溶剂作用以静电势场的形式投影至二肽分子骨架中,与酰胺-Ⅰ带在气/液相中的频率差相关联,并引入酰胺-Ⅰ带简正模式随二级结构变化的规律,将各个构象态可能存在的振动耦合包含在内,构建具有二级结构敏感性的静电频率转换图,实现溶液相中多肽骨架酰胺-Ⅰ带的快速准确预测。
- 蔡开聪郑轩刘亚男留珊红杜芬芬
- 关键词：振动光谱
- 丙氨酸二肽分子二级结构与振动光谱特性被引量：2
- 2012年
- 利用从头算方法探索蛋白质模型分子——丙氨酸二肽的二级结构布居特性以及体系势能变化.引入对分子结构敏感的振动探针(酰胺振动吸收带),借助其光谱表象,寻求振动光谱参数与分子结构之间的联系.研究结果表明:丙氨酸二肽分子处于C7eq构型(Φ/Ψ=-80°/80°)时具有最低能量值,且分子易形成β折叠、PPII、C5及C7等能量较低的稳定构型.通过简正模式分析,得到分子3N-6个振动模式的吸收光谱,并通过势能分布分析方法对分子骨架上酰胺振动吸收带的特征振动模式进行了指认.重点考察分子骨架上酰胺-I带振动光谱参数与分子构型变化之间的相关性,建立振动光谱参数与蛋白质二级结构之间的联系,为在化学键水平上研究蛋白质的结构及其发挥作用的机制提供科学依据.
- 蔡开聪留珊红刘的文林深
- 关键词：从头算振动光谱
