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马氏珠母贝磺基转移酶PmCHST9基因的分子特征与表达分析被引量：18: 2015年; 糖胺聚糖在抗病毒、消炎和抗氧化等免疫反应发挥重要作用。磺基转移酶(sulfotransferase)是糖胺聚糖生物合成的关键酶,Carbohydrate sulfotransferase 9(CHST9)可以将磺酸基从3'-磷酸腺苷酰-5'磷酸硫酸盐(PAPS)转移到半乳糖残基非还原末端的4位碳上。为研究CHST9在马氏珠母贝免疫调节中的作用,本研究克隆得到马氏珠母贝CHST9(Pinctada martensii CHST9,Pm CHST9)c DNA全长序列并检测其在不同组织中的表达模式。利用RACE技术,得出Pm CHST9序列全长1 388 bp,其中5'UTR为122 bp,3'UTR为192 bp,开放阅读框(ORF)为1 074 bp,编码357个氨基酸;Pm CHST9氨基酸序列分子量为42 889.2 Da,等电点为9.28,脂溶性系数为81.32,总平均亲水性为-0.493;氨基酸序列分析得出Pm CHST9具有典型的磺基转移酶-2结构域和一个跨膜结构域;多序列比对结果显示Pm CHST9与其它物种的CHST9同源性较低;荧光定量PCR检测结果表明Pm CHST9在鳃中表达量最高,其次是足和肝胰腺。综上所述,Pm CHST9可能参与马氏珠母贝的免疫调节作用,为进一步阐述Pm CHST9在马氏珠母贝中的免疫机制提供基础资料。; 郝瑞娟郑哲王庆恒王庆恒焦钰邓岳文; 关键词：马氏珠母贝分子特征

马氏珠母贝TOR基因cDNA的克隆与组织表达分析被引量：1: 2014年; TOR(target of rapamycin)是一类进化上非常保守的蛋白激酶,参与调节多种生化代谢,协调蛋白质的生物合成和降解。本研究采用c DNA末端快速扩增技术(RACE),克隆获得了马氏珠母贝TOR基因c DNA全长序列(pm-TOR);同时利用荧光定量技术检测了pm-TOR基因m RNA在马氏珠母贝各个组织中的表达含量。结果表明:pm-TOR基因c DNA序列全长9 220 bp,开放阅读框(ORF)长7 488 bp,编码2 495个氨基酸,5'非翻译区(5'UTR)长157 bp,3'UTR长1 575 bp。氨基酸序列同源比对分析显示pm-TOR氨基酸序列与其他物种具有较高的保守性,与牡蛎(Crassostrea gigas)的TOR的序列相似度为79%。荧光定量PCR数据分析显示,TOR基因的m RNA在马氏珠母贝血液、性腺、肝胰脏、外套膜、闭壳肌和鳃组织中均有表达,其中肝胰脏和性腺中表达量较高,血液中表达量较低。本研究为进一步阐述TOR在马氏珠母贝中生长和发育调控中的作用提供理论基础。; 田群莉邓岳文杜晓东焦钰黄荣莲王庆恒; 关键词：马氏珠母贝基因克隆 REAL-TIME PCR

一种马氏珠母贝育珠贝休养方法: 本发明公开了一种马氏珠母贝育珠贝休养方法，属于水产养殖技术领域；通过将完成植核手术的育珠贝移到休养水池养殖，育珠贝养殖密度为100‑120个/m<Sup>3</Sup>，吊养水深为1.0‑1.2米，保持微波充气，从手术后...; 郑哲王庆恒杨创业廖永山梁飞龙邓岳文焦钰

马氏珠母贝组蛋白H1基因家族的鉴定及功能分析被引量：1: 2022年; 组蛋白H1参与高级染色质结构的形成,除结构作用外,组蛋白H1还通过翻译后修饰或特定变体等影响染色质功能和动力学,并具有参与生物免疫反应以及控制细胞增殖等功能。本研究通过构建系统进化树和多序列比对等方法比较分析了马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)、长牡蛎(Crassostrea gigas)和人(Homo sapiens)等9个物种的组蛋白H1基因家族,分析了马氏珠母贝中的组蛋白H1基因在不同发育阶段以及植核后不同时间血细胞转录组中的表达变化,旨在揭示马氏珠母贝中组蛋白H1基因家族的分子进化和功能。结果表明,马氏珠母贝基因组包含23个组蛋白H1基因变体,呈现了该生物的特异性扩张。对马氏珠母贝、长牡蛎和人的组蛋白H1的氨基酸序列进行多序列比对,结果显示,组蛋白H1在物种间的保守性较高。在马氏珠母贝不同发育阶段的转录组中检测到12个组蛋白H1基因转录本,3个组蛋白H1基因在原肠胚期、早期担轮幼虫期、D型幼虫期、担轮幼虫、D型幼虫、投饵前D型幼虫、早期壳顶幼虫期、眼点期、变态后时期和稚贝期表达量升高,1个组蛋白H1基因在卵期和受精卵期显著性高表达,说明组蛋白H1在发育过程中形成了不同的表达机制,产生功能分化,在不同的发育阶段由不同H1基因发挥不同的功能。在血细胞转录组中表达了11个组蛋白H1基因,在植核后3~6 d有9个组蛋白H1基因的表达量有明显增加,在植核后6~12 h,有2个组蛋白H1基因显著性高表达,在植核后12 d其组蛋白H1基因的表达量都基本恢复到植核前水平,进一步证实不同的组蛋白H1基因的功能分化特征。上述结果表明组蛋白H1基因在马氏珠母贝基因组中产生了特异性扩张并形成功能分化,参与调控马氏珠母贝的发育和植核免疫过程。本研究为进一步探究组蛋白H1基因在马氏珠母贝中的功能提供理论基础。; 梁雪茹曹艳飞杨帅焦钰杜晓东; 关键词：马氏珠母贝基因家族基因组分析

脂多糖刺激对马氏珠母贝血细胞DNA甲基化修饰的影响被引量：3: 2020年; 【目的】研究马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)血细胞基因组DNA的甲基化修饰情况及其在脂多糖(LPS)刺激后的变化,为探究甲基化修饰在珍珠贝免疫防御中的作用提供理论基础。【方法】运用甲基化敏感扩增多态性法(MSAP)分析马氏珠母贝血细胞(正常养殖贝)以及注射LPS后(6、12、24 h)基因组CCGG位点甲基化的修饰水平变化,并对甲基化修饰位点进行回收测序。【结果】共获得1 102个清晰可辨的DNA条带,其中全甲基化位点条带215个,半甲基化位点条带127个,非甲基化位点条带760个。对照组血细胞基因组CCGG位点的甲基化修饰比例为23.76%,注射LPS后,甲基化比例为28.10%~48.25%,注射6 h时最低,12 h时最高;对特异性片段测序后,经Blast比对,得到5条存在甲基化修饰的基因序列,其中2条具有注释信息,分别是干扰素调控因子(Interferon regulatory factor)和磷脂酶BL2(Putative phospholipase B-like 2)。【结论】马氏珠母贝血细胞基因组CCGG位点的甲基化修饰参与调控LPS诱导的免疫反应,在免疫防御中发挥重要作用。; 焦钰梁金婵谷泽丰张鹏飞张鹏飞罗少杰; 关键词：马氏珠母贝免疫防御

miR-210在马氏珠母贝外套膜矿化机制中的结构和功能预测被引量：3: 2016年; 为进一步探究Pm-miR-210在马氏珠母贝贝壳形成的作用,利用miR-RACE技术验证Pm-miR-210的成熟体序列并进行序列分析,通过生物信息学分析来获得Pm-miR-210的前体序列,并进行组织定量和靶位点预测。结果表明,Pm-miR-210的miR-RACE结果与高通量测序结果一致,利用转录组数据库与Pm-miR-210成熟体序列比对,获得的前体序列长度为80 bp并具有典型的颈环结构。多序列比对结果显示,Pm-miR-210成熟体序列的种子区域在不同物种间具有极高的保守性。荧光定量结果得出,Pm-miR-210在外套膜边缘膜和中央膜中均有表达,但表达量差异不具统计学意义(P>0.05)。靶向预测分析结果显示,钙调蛋白(calmodulin)、钙调磷酸酶-A亚基(calcineurin A subunit)、N19以及Shematrin-3为Pm-miR-210的候选靶基因。; 潘晓艳郑哲田荣荣焦钰杜晓东; 关键词：马氏珠母贝

马氏珠母贝IKKε同源基因的克隆及表达分析被引量：9: 2014年; IKKε(inhibitor of NF-κB kinasesε)是NF-κB(nucleur factorκB)信号通路中的关键成员,参与调控细胞的分化、发育、凋亡及免疫反应。本研究根据马氏珠母贝转录组数据库中注释为IKKε的unigene序列设计引物,应用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得了马氏珠母贝(Pinctada martensii)IKKε基因cDNA的全长序列(PmIKKε)并对其序列特征进行分析;同时利用荧光定量PCR(Real-time PCR)技术检测了马氏珠母贝六个组织中PmIKKε基因mRNA的表达。结果表明:PmIKKε基因cDNA全长2 843 bp,其中5'UTR为116 bp,3'UTR为516 bp,含有27 bp polyA,开放阅读框为2 211 bp,编码737个氨基酸残基。预测其分子量为85.07 kD,等电点为6.17。多序列比对显示PmIKKε与其它物种IKKε有较高的同源性,与牡蛎的序列相似性有45%。软件分析结果显示PmIKKε的N端含有一个蛋白激酶功能结构域和一个MAPKK(mitogen-activated protein kinase kinase)的激活位点,C端含有一个亮氨酸拉链(leucin zipper,LZ)和一个螺旋-环-螺旋结构(helix-loop-helix,HLH)。荧光定量PCR分析表明PmIKKε在马氏珠母贝肝胰脏、性腺、血淋巴、鳃、外套膜、闭壳肌六个组织中均有表达,肝胰脏中表达量最高。本研究为进一步阐述PmIKKε在马氏珠母贝生长、发育及先天性免疫中的作用提供理论基础。; 焦钰杜晓东王庆恒黄荣莲邓岳文; 关键词：PINCTADA 基因克隆荧光定量PCR

一种类胡萝卜素含量高的马氏珠母贝养殖新品系的培育方法: 本发明公开了一种类胡萝卜素含量高的马氏珠母贝养殖新品系培育方法。本发明的培育方法基本步骤包括亲本挑选、群体构建、幼体培育、海区养殖和多代群体选择步骤，可培育出类胡萝卜素含量高的马氏珠母贝养殖新品系；获得的新品系中，96%...; 邓岳文王庆恒杜晓东黄荣莲焦钰雷超吴小芬梁飞龙李俊辉; 文献传递

马氏珠母贝载脂蛋白基因Pm-APOL3克隆、表达量与类胡萝卜素含量相关分析被引量：5: 2016年; Apolipoprotein L3(APOL3)是新发现的一种高密度脂蛋白,属于载脂蛋白L基因家族的成员之一,具有运载脂类物质进行生化代谢的功能。本研究利用c DNA末端快速扩增技术获得了马氏珠母贝APOL3基因(Pm-APOL3)c DNA全长序列,分析其序列及功能特征,检测Pm-APOL3基因在不同组织的表达,并分析了金黄壳色群体与养殖群体类胡萝卜素含量与Pm-APOL3基因表达量的相关性。结果表示,Pm-APOL3基因c DNA全长874 bp,开放阅读框(ORF)为357 bp,编码118个氨基酸,包含475 bp的5'UTR,42 bp的3'UTR,相对分子量为12.795 5 ku,等电点为4.71。该蛋白质的不稳定指数为34.09,属于稳定蛋白质,疏水性分析表明其亲水性平均系数为0.74,属疏水蛋白,信号肽预测结果表示其不含信号肽,为非分泌蛋白。荧光定量PCR分析表明Pm-APOL3基因在鳃、外套膜、闭壳肌与肝胰脏均有表达,其中肝胰脏表达量显著大于其它三个组织(p<0.05)。金黄壳色群体类胡萝卜素含量与Pm-APOL3基因表达量均显著大于养殖群体(p<0.05)。本研究结果表明Pm-APOL3是参与马氏珠母贝类胡萝卜素代谢重要基因。; 陈雪欣雷超彭慧湃王庆恒焦钰焦钰邓岳文; 关键词：马氏珠母贝类胡萝卜素

长链非编码RNA编码的Pm-miR-133调控马氏珠母贝RhoA基因的表达: 在脊椎动物中,Mir-133调控心肌细胞和骨骼肌细胞的增殖和分化。本研究利用miR-RACE技术验证了pm-miR-133序列的准确性并通过stem-loop qRT-PCR检测其在闭壳肌、性腺、肝胰腺、外套膜、足和鳃中...; 郑哲黄荣莲田荣荣焦钰杜晓东; 关键词：RHOA 马氏珠母贝; 文献传递

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焦钰

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