沈诚频
- 作品数：5 被引量：5H指数：2
- 供职机构：复旦大学上海医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 肝癌细胞分泌蛋白质的多种提取方法比较被引量：2
- 2010年
- 由于分泌蛋白在重大生理和病理过程中的重要角色和功能,使得分泌蛋白质组的研究备受人们关注.高效提取分泌蛋白质是分泌蛋白质组学研究的第一步,也是关键的一步.本研究首次比较了3种常用的提取方法:超滤法、沉淀法和透析法.以具有高自发性转移潜能的人肝癌细胞系LM3为研究对象,采用3种方法平行提取分泌蛋白,发现超滤法的提取效率最高;蛋白质经过溶液酶解,在线的一维反相高效液相色谱分离和ESI-MS/MS质谱鉴定,共鉴定了360个非冗余蛋白,其中有34,110和29个蛋白分别只在超滤法、沉淀法和透析法提取的样品中被鉴定到,沉淀法占优势,3种方法互相补充.360个蛋白中,有42个分泌蛋白为首次被鉴定到,扩大了已有的人肝癌转移细胞分泌蛋白数据库.
- 曹晶沈诚频张军姚鋆申华莉刘银坤陆豪杰杨芃原
- 关键词：肝癌分泌蛋白蛋白提取超滤
- 一种鉴定糖基化肽段的方法及装置
- 本发明公开了一种鉴定糖基化肽段的方法，其包括步骤：质谱图过滤；获取单电荷质量数；构建质量数网络；理论库检索。本发明还公开了一种糖基化肽段的鉴定装置，其包括：质谱图过滤单元，获取单电荷质量数单元，构建质量数网络单元，理论库...
- 贺福初杨芃原张扬沈诚频刘铭琪陈瑶函
- 利用谱图校正提高色谱-质谱联用的分析效率
- 2014年
- 在使用对二甲基亚砜(DMSO)和NEDD8激活酶抑制剂(MLN4924,MLN)刺激的人脐静脉内皮细胞(HUVEC)内的蛋白质进行分析的过程中,利用Progenesis LC-M S软件对色谱图进行了保留时间的校正,并比较了同组分多次重复实验中的谱图相似率及两种刺激下细胞内蛋白质色谱图的相似度。样品经双酶切处理后,加入QconC AT标准蛋白质混合物作为参照,经高效液相色谱-串级质谱分离,后续又对谱图进行了校正与分析。经过谱图校正,将蛋白质鉴定结果从7 000个左右提高到8 000个以上,提高了蛋白质的鉴定效率。在利用谱图计数进行相对定量时,还分析了DMSO和MLN分别刺激HUVEC后细胞内的蛋白质差异在1 000个左右,并给出了校正后的色谱总离子流图的相似度比较。相比其他方法更为简单快捷和流程化,具有高通量高灵敏度的优点。
- 陆文渊张扬沈诚频殷薛飞刘晓慧杨芃原
- 关键词：蛋白质分析
- 一种鉴定糖基化肽段的方法及装置
- 本发明公开了一种鉴定糖基化肽段的方法，其包括步骤：质谱图过滤；获取单电荷质量数；构建质量数网络；理论库检索。本发明还公开了一种糖基化肽段的鉴定装置，其包括：质谱图过滤单元，获取单电荷质量数单元，构建质量数网络单元，理论库...
- 贺福初杨芃原张扬沈诚频刘铭琪陈瑶函
- 文献传递
- 乙酰化蛋白的质谱鉴定研究被引量：3
- 2008年
- 报道了两种生物质谱技术ESI-MS和MALDI-MS在鉴定乙酰化修饰蛋白BSA-ac中的应用研究结果.乙酰化修饰蛋白通过特征碎裂峰m/z126.1或MS/MS质谱图中相差一个赖氨酸的相邻b或y离子之间170Da分子量的差异确证赖氨酸乙酰化修饰,并且后者提供具体修饰位点信息.研究提示ESI-MS和MALDI-MS两种质谱技术均可用于鉴定实际复杂样品中的乙酰化蛋白,且在乙酰化蛋白的鉴定中各有其优点.
- 祝叶萍樊惠芝沈诚频姚鋆周新文杨芃原
- 关键词：翻译后修饰质谱
