江鹏斐
- 作品数：11 被引量：73H指数：5
- 供职机构：中国农业科学院兰州兽医研究所更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划中国农业科学院院长基金甘肃省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 口蹄疫病毒基因组内部核糖体进入位点一级和二级结构分析被引量：7
- 2002年
- 以口蹄疫病毒 (foot-and -mouthdiseasevirus,FMDV)强毒China/ 99株牛舌水泡皮为材料 ,用RT -PCR法提取RNA及扩增目的cDNA ,然后与 pGEM -TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和 EcoRI酶切鉴定。用DNAstar软件比较了内部核糖体进入位点 (IRES)的序列差异 ,并用RNAdraw软件绘制和分析了该区段的二级结构。 8株FMDVIRES核苷酸序列比较表明该区段较为保守 ,并对非保守区域进行了分析。二级结构分析表明 ,FMDVIRES至少有 3种二级结构图形 :第一型有 5个结构域 ,与Pilipenko等报道的一致 ;第二和三型分别有 6和 11个结构域 ,与Pilipenko等报道的结果不同。无论FMDVIRES二级结构如何不同 ,但单链区大部分核苷酸序列或基序相同 ,如AACUCC、GAAA、CUUU、AGG、AACC、GUAA等。茎环柄部核苷酸对维持二级结构的空间构像具有十分重要的作用 ,环中或单链区序列 (基序 )在维持其功能方面具有很重要的作用 。
- 张显升赵启祖刘在新江鹏斐常惠芸陈应理李冬魏怀录谢庆阁
- 关键词：口蹄疫病毒基因组内部核糖体进入位点
- 口蹄疫病毒非结构蛋白P3区的基因序列及分析被引量：7
- 2002年
- 以口蹄疫Akesu/ 5 8分离株的 5 3代牛舌皮病料为材料 ,采用RT PCR法 ,扩增和克隆了两个约 1.5kb的DNA片段。核酸序列测得结果对接后 ,涵盖了全部P3区的基因序列。口蹄疫Akesu/ 5 8分离株基因组P3区的核酸序列共计 2 ,72 4nt,包括一个终止密码子TAA ,共编码 90 7个氨基酸 ;其中非结构蛋白 3A的基因是 45 9nt,编码 15 3个氨基酸 ;3个 3B(VPg)基因分别是 6 9、72和 72nt,氨基酸分别为 2 3、2 4和 2 4;3C是 6 39nt,2 13个氨基酸 ;3D是1,413nt ,471个氨基酸。各蛋白间由Glu/Gly(Ser)连接。序列比较显示 :3A的C端易变 。
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- 关键词：口蹄疫病毒基因序列
- 口蹄疫病毒株China/99L区段核苷酸序列测定及比较分析
- 2002年
- 以口蹄疫病毒株China/ 99RNA为模板 ,反转录并扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,提取的重组质粒用电泳、PCRampos和EcoR1酶切法鉴定。该毒株与A10、O1K、O1Campos和TW 45毒株的核苷酸序列差异率分别为 15 .2 7%、15 .5 6 %、15 .5 6 %和 15 .49% ;氨基酸序列差异率分别为 8.2 9%、8.76 %、9.2 2 %和 10 .14%。五个毒株的L/P1连接处均为苷氨酸 (Gly) /异亮氨酸 (Ile)。序列比较表明 ,T C、A G和A C转换率较高 ,是点突变的热点核苷酸 ,是影响氨基酸稳定的因素之一。第 43 5 3、95 10 5、10 8 111、146 15 3、16 1 173、183 188和 182 187区域极有可能是L蛋白酶的活性中心 ,第 48位的H、5 1的C、6 5位的E、95位的H、10 9位的H、138位的H、148位的H和 16 5位的E可能是L蛋白酶的活性位点 。
- 张显升赵启祖刘在新刘相涛常惠芸江鹏斐陈应理李冬魏怀录谢庆阁
- 关键词：核苷酸序列测定
- 2000年世界口蹄疫流行大事记被引量：4
- 2001年
- 江鹏斐赵启祖等
- 关键词：口蹄疫
- 应用口蹄疫病毒非结构蛋白区分感染动物和注苗动物被引量：12
- 1999年
- 江鹏斐谢庆阁
- 关键词：口蹄疫病毒动物传染病非结构蛋白注射疫苗
- 口蹄疫病毒株China/99 P3区一级结构及与参考毒株的比较分析被引量：4
- 2002年
- 用RT -PCR法 ,以口蹄疫病毒China/ 99感染的牛舌水泡皮为材料 ,扩增目的cDNA ,与pGEM TEasy载体连接并转化JM1 0 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,猪源毒在 3A基因内缺失 1 0个密码子 ,与牛源毒的核苷酸和氨基酸序列差异较大。A G和T C的转换率较高 ,而且A G转换导致氨基酸变异的几率大于T C转换 ,它们是影响氨基酸稳定的因素之一。China/ 99P3区编码产物在第 8、1 2 0、1 2 1、1 2 7、1 32、1 93、493、50 1和 538位具有特征性氨基酸 ,可能与该毒株的表型如毒力等有关。 3A基因突变率较高 ,3B、3C和 3D较低 ,3D最为保守 ,这对维持 3C和 3D蛋白酶和
- 张显升赵启祖刘在新江鹏斐常惠芸陈应理李冬魏怀录谢庆阁
- 关键词：口蹄疫病毒株
- 口蹄疫病毒2c基因的克隆与表达
- 江鹏斐
- 关键词：口蹄疫病毒克隆
- 口蹄疫病毒基因组IRES和Poly(C)之间功能未知区一级和二级结构分析被引量：2
- 2001年
- 用RT PCR法 ,以口蹄疫病毒 (FMDV )WH/ 99株牛舌水泡皮为材料 ,提取RNA及扩增目的cDNA ,然后与pGEM TEasy载体连接并转化JM 10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoRⅠ酶切鉴定 ;用DNAstar软件比较功能未知区的序列差异 ,以RNAdraw软件分析它们的二级结构。结果表明 ,7株FMDV的功能未知区序列长度介于 2 0 7— 2 5 6个核苷酸 ;序列分析表明 ,WH/ 99与AsiaⅠ 63 / 72、A2 4 /Cruzeiro、TWTY/ 97和TWCP/ 97的序列差异最大 ,预示此区段可能与病毒感染嗜性有关 ;二级结构分析表明 ,A2 4 /Cruzeiro、AsiaⅠ 63 / 72和TWCP/ 97均有 5个结构域 ,WH/ 99和TWTY/ 97具有 6个结构域。TWTY/ 97和TWCP/ 97二级结构的差异可能是TWTY/ 97功能未知区第 2 0位插入的“C”所致 ,而O1K/66和O1Campos仅有 3个结构域。 2株猪O型FMDV功能未知区 5′端存在着连续的核苷酸缺失现象 ,最多达 5 2个 ,唯有3株牛O型FMDV(O1K/ 66、O1Campos和WH/ 99)在上述位置无任何缺失。
- 张显升赵启祖刘在新常惠芸江鹏斐陈应理李冬魏怀录戈银生谢庆阁
- 关键词：口蹄疫病毒株RT-PCR
- 口蹄疫病毒强毒株China/99 P2区核苷酸序列测定及比较分析被引量：2
- 2002年
- 以口蹄疫病毒强毒株China/99RNA为反转录模板 ,用一对特异性引物扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,该强毒株与A12、O1K和TW 45毒株的核苷酸差异率分别为 7 78%、6 6 2 %和 13 19%。推导的氨基酸序列差异率分别为 1 2 3%、1 84%和 5 73%。 4个毒株序列比较发现 ,China/99、O1K和TW 45三毒株的 2A/2B连接处为甘氨酸 /脯氨酸 ,A12 为精氨酸 /脯氨酸 ,而且T C转换率和A G转换率较高 ,是点突变的热点核苷酸。氨基酸差异主要存在于 2B和 2C蛋白中 ,2A基因较为保守。 2B蛋白的第 1 4,6 3 6 7,73 78,83 91,116 12 1和 12 6 131区域 ,2A蛋白的第 4 9区域和 2C蛋白的第 9 13,2 2 2 5 ,91 96 ,15 0 15 9,179 188,2 0 1 2 0 7和 2 5 8 2 6 2区域可能是重要的活性中心。
- 张显升赵启祖刘在新江鹏斐常惠芸陈应理李冬魏怀录谢庆阁
- 关键词：口蹄疫病毒核苷酸序列
- 口蹄疫病毒2c基因的克隆及表达被引量：6
- 2001年
- 从O型口蹄疫病毒China98株病毒材料中克隆到了非结构蛋白 2C的基因 ,并成功地将该基因在大肠杆菌中进行了表达 ,为建立以基因工程产品为抗原、能区分人工免疫和自然感染动物的检疫方法提供了技术和材料条件。
- 江鹏斐刘在新赵启祖常惠芸谢庆阁
- 关键词：口蹄疫病毒检疫基因克隆基因表达口蹄疫
