林聪田 作品数:18 被引量:10 H指数:2 供职机构: 中国科学院动物研究所 更多>> 发文基金: 国家科技基础条件平台建设计划 中国科学院战略性先导科技专项 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 自动化与计算机技术 文化科学 更多>>
Bisby Core与生物分类树工具 林聪田 乔慧捷 王江宁 原帅 韩艳 纪力强俾斯比核心(Bisby Core)--一个新的生物分类学数据交换标准 随着信息技术的飞速发展,生物多样性相关的研究工作中获取和存储数据的手段愈加丰富。伴随而来的数据存储、共享和交换的需求急剧增加。用户的数据共享意识在不断提高。数据集成和融合的趋势愈发明显。在这种大趋势下,本文尝试从生物类群... 乔慧捷 林聪田 许哲平 陈彬 程金魁 王江宁 冯逍 张波 纪力强基于动物志的鸟类形态特征数据集 被引量:1 2021年 基于动物志的鸟类形态特征数据集是在对《中国动物志鸟纲第七卷》相关文字记录数字化处理后,利用专门工具对内容进行提取得到的。本数据集包含书中记录的夜鹰目、雨燕目、咬鹃目、佛法僧目、啄木鸟目(鴷形目)共计5目13科85种鸟类,其每条记录都是对各物种/亚种不同性别各发育阶段的形态、生物学、分布、量衡度等形态描述数据中单一形态特征的提取,以形状、颜色、纹理为主。本数据集为这些类群鸟类生物地理、系统进化等生物学研究提供了基础数据,也为自然语言处理和理解研究提供了珍贵的语料资源。 薛延韬 王江宁 林聪田 林聪田 丁晓庆 韩艳关键词:形态学 鸟纲 自然语言处理 野外监测图像的小型动物辅助识别方法 王江宁 乔慧捷 林聪田 纪力强文献传递 中国生物物种名录的编辑和出版进展 纪力强 王利松 乔慧捷 林聪田 韩艳 覃海宁 刘瑞玉 马克平生物多样性数据Gap分析工作流 被引量:2 2017年 生物多样性科学研究、保护与持续利用离不开准确、详实的生物多样性分布数据。近年来,随着计算机信息技术与生物多样性信息学的发展,生物多样性数字化数据得到快速、大量积累。同时也难免存在一些问题,例如数据来源众多、标准不统一、质量参差不齐,影响其共享与充分利用,并且在类群覆盖、采样时间和地理分布上存在一定的空缺(Gaps),导致目前的生物多样性数据能否全面客观地描述生物多样性存在疑问。生物多样性数据Gap分析(Biodiversity Data Gap Analysis,BDGA)的目的就是对现有数据进行完整性和可靠性评估,为今后的生物多样性调查与研究工作提供决策支持,帮助相关研究人员在应用生物多样性数据时对数据客观性和可用性进行判断。本研究旨在探讨如何建立BDGA工作流,着重阐述BDGA的基本方法、相关工具与流程。 黄雄伟 林聪田 纪力强关键词:数据集 GAP分析 网络生命大百科中文版的实现 纪力强 林聪田 王江宁 韩艳 冯逍 原帅关键词:中文环境 PSDS 2.0:一个基于GIS和多个模型的生物潜在分布地预测系统 被引量:3 2010年 根据对生物分布地预测模型和软件发展现状的分析和总结,本研究在PSDS1.0的基础上提出并实现一个基于GIS且具有多个代表性模型的生物分布地预测系统(PSDS2.0)。PSDS2.0系统继承了1.0的环境包络和聚类包络模型,进一步引入了限制因子包络、马氏距离、支持向量机等新模型,并针对本领域中模型比较与选择的难点增加了迭代交叉验证的多模型选择功能。系统还实现了灵活定制和评估伪负样本的功能,通过用只需要正样本的I类模型预测的结果对随机产生的伪负样本进行评估,减小其落入适宜地区的概率,进一步提高需要正负样本的II类模型的准确率。GIS功能在PSDS2.0中也得到加强,被应用于数据准备及结果分析等重要环节。文章最后以白冠长尾雉(Syrmaticus reevesii)为例,运用PSDS2.0系统预测其在中国范围内的潜在分布地,并对各种模型的预测结果进行评估和比较。 林聪田 纪力强动物疫病信息系统的开发及禽流感数据分析 随着动物疫病在全球的不断爆发,科学工作者们急切盼望得到更多更全的疫病数据,普通大众也想了解更多的动物疫病知识,以计算机技术为核心构建动物疫病信息系统正是解决当前这种需要的可行途径。本文就动物疫病信息系统的开发进行了详细的... 林聪田 张尚武 邓浩 乔慧捷 王江宁 纪力强关键词:动物疫病 禽流感 文献传递 基于鸣声模型的云南柳莺地理种群关系分析 2017年 将录自北京、甘肃、四川和陕西7个地区共117段云南柳莺(Phylloscopus yunnanensis)的鸣唱样本分别提取短时特征Mel倒谱系数(MFCC),利用系统聚类方法,构建云南柳莺不同地理种群鸣声特征之间的树状关系图,并对云南柳莺地理鸣声差异产生机制的可能因素(地理距离、海拔等)进行探讨。这是基于鸣声短时特征的物种识别在研究同一物种不同地理种群关系中的首次尝试。结果显示,其鸣声地理差异与距离之间没有显著相关性(Pearson,r=﹣0.036,P=0.762,n=117),但与海拔存在显著的相关性(Pearson,r=﹣0.836,P<0.001,n=117)。 郑岩 王江宁 王天山 林聪田 孙悦华 纪力强关键词:MEL倒谱系数 海拔