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曾理
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5
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供职机构:
中国科学院深圳先进技术研究院
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相关领域:
生物学
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合作作者
成杰峰
中国科学院深圳先进技术研究院
冯圣中
中国科学院深圳先进技术研究院
孟金涛
中国科学院深圳先进技术研究院
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中国科学院
作者
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曾理
4篇
冯圣中
4篇
成杰峰
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孟金涛
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2篇
2016
2篇
2013
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一种基于De Bruijn图的并行基因拼接方法
本发明涉及基因测序技术领域,提供了一种基于De Bruijn图的并行基因拼接方法,包括:S1.并行构建分布式De Bruijn图;S2.剔除错误路径;S3.基于深度图遍历方法对De Bruijn图进行化简;S4.合并co...
曾理
成杰峰
孟金涛
涂志兵
冯圣中
文献传递
子图匹配装置及子图匹配的方法
一种子图匹配装置,用于在大规模图中查找出与带环图匹配的子图,包括:生成树模块、匹配模块、判断模块以及集合模块。生成树模块根据最小生成树算法找到带环图的生成树;匹配模块自底向上对数据图进行生成树匹配,寻找与生成树匹配的树L...
曾理
成杰峰
冯圣中
文献传递
一种基于De Bruijn图的并行基因拼接方法
本发明涉及基因测序技术领域,提供了一种基于De Bruijn图的并行基因拼接方法,包括:S1、并行构建分布式De Bruijn图;S2、剔除错误路径;S3、基于深度图遍历方法对De Bruijn图进行化简;S4、合并co...
曾理
成杰峰
孟金涛
涂志兵
冯圣中
文献传递
子图匹配装置及子图匹配的方法
一种子图匹配装置,用于在大规模图中查找出与带环图匹配的子图,包括:生成树模块、匹配模块、判断模块以及集合模块。生成树模块根据最小生成树算法找到带环图的生成树;匹配模块自底向上对数据图进行生成树匹配,寻找与生成树匹配的树L...
曾理
成杰峰
冯圣中
文献传递
基于分布De Bruijn图遍历的基因拼接算法的并行构建和化简方法
目前基因拼接软件中应用最广泛的技术是基于De Bruijn图的基因拼接算法.随着第二代基因测序仪的大量使用和基因测序在工业中的广泛应用,常常需要对长达数十亿bp长度的基因组测序数据进行处理.针对海量的基因测序数据,快速、...
ZENG Li
曾理
CHENG Jie-Feng
成杰峰
MENG Jin-Tao
孟金涛
TU Zhi-Bing
涂志兵
FENG Shen-Zhong
冯圣中
关键词:
并行计算
基因测序
生物信息学
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