方钟燎
- 作品数：61 被引量：211H指数：7
- 供职机构：广西壮族自治区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广西壮族自治区科学研究与技术开发计划卫生部科学研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 基于丙型肝炎病毒NS5B区的巢式RT-PCR和基因分型的比较研究被引量：6
- 2016年
- 目的研究不同引物组合和病毒载量对丙型肝炎病毒（HCV）RNA逆转录和NS5B区巢式PCR反应效率,以及由于逆转录引物不同对基因分型结果的影响。方法用荧光定量PCR检测病毒载量。分别用Oligo（dT）15和随机引物pd（N）6将HCV RNA逆转录合成cDNA,用针对5’-NTR区的巢式PCR进行检测;分别用针对NS5B区的简单引物和简并引物组合进行巢式PCR,比较各组扩增效率。对NS5B区第2轮PCR产物测序并比较基因分型结果的一致性。结果用Oligo（dT）15引物逆转录和随机引物逆转录合成cDNA,5’-NTR区扩增的阳性率分别为87.5%和98.4%,差异有统计学意义（χ2=17.6,P〈0.001）。用HCV1/HCV2-122S/123A简单引物组合和ENO2/ENO4-NS5S3/NS5A5简并引物组合对Oligo（dT）15逆转录cDNA产物进行NS5B区的巢式PCR扩增,阳性率分别为11.5%和35.4%,差异有统计学意义（χ2=30.7,P〈0.001）;用上述两组引物组合对随机引物逆转录cDNA进行NS5B区巢式PCR扩增,其阳性率分别为45.3%和94.3%,差异有统计学意义（χ2=109.1,P〈0.001）。随机引物在不同载量病毒组中的逆转录反应阳性率差异无统计学意义（χ2=2.00,P〉0.05）;随机引物配合简并引物组合在不同载量病毒组NS5B区扩增的阳性率差异无统计学意义（χ2=5.18,P〉0.05）。经Oligo（dT）15引物和随机引物合成cDNA,用简并引物组合对NS5B区进行巢式PCR扩增,通过核酸测序确定HCV基因型完全一致。结论使用pd（N）6随机引物进行逆转录,结合ENO2/ENO4-NS5S3/NS5A5简并引物组合可实现对不同载量HCV的基于NS5B区的高效巢式PCR扩增和基因分型。
- 尹琦杨庆利方钟燎王学燕李海陈钦艳谭超罗洲
- 关键词：丙型肝炎病毒RT-PCR病毒载量
- 乙肝病毒基因变异与肝癌存在因果关系
- 方钟燎王学燕杨进业陈钦艳方孔雄韦少超
- 所属科学技术领域、简要背景、主要研究内容、发现点、科学价值、论文专著发表及同行引用评价情况。该研究属于预防医学领域。慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染是肝癌的主要病因，但其致癌机理仍未清楚。横断而研究结果表明HBV核心基因启...
- 关键词：
- 关键词：肝癌防治乙肝病毒地理流行病学
- 广西2005—2014年戊型肝炎流行病学分析被引量：10
- 2016年
- 目的了解广西戊型病毒性肝炎（戊肝）的发病趋势及流行病学特征,为制定防控措施提供科学依据。方法采用描述性流行病学方法对广西2005—2014年戊肝疫情监测资料进行分析。结果广西2005—2014年戊肝发病率逐年上升,2005年发病率为0.35/10万,2014年上升至3.29/10万,平均发病率1.74/10万。发病率较高的地区为梧州市、玉林市、桂林市、南宁市、防城港市等市。病例主要集中于冬春季（1—5月）。40~60岁病例较多,男女性别比3.01∶1,病例职业构成主要为农民、离退人员、家务及待业、工人等。结论广西2005—2014年戊肝发病率逐年上升,南宁等市是高发区,中老年男性、农民是发病高危人群。应重视戊肝疫情形势,采取以切断传播途径为主的综合防控措施,有效遏制戊肝流行。
- 谭超李海方钟燎王学燕陈钦艳杨庆利
- 关键词：戊型肝炎流行病学发病趋势
- 乙型肝炎病毒基因组前-前-S和前-X区基因分布的研究被引量：3
- 2005年
- 目的 研究不同基因型乙型肝炎病毒(HBV)前前S和前 X区核苷酸和氨基酸序列分布。方法 应用DNAstar软件中的MegAlign程序分析GenBank登记的35株和3株由本室测定的不同基因型HBV全序列中前- 前-S和前 X区基因分布情况,并用Blast软件对GenBank中5 98株HBV全基因组序列进行前- 前- S和前X区的核苷酸和氨基酸相似性分析。结果 除D基因型外,在各型HBV基因组中均存在前- 前-S区核苷酸序列,但仅在C、F和H型HBV基因组中存在前 -前- S区开放读码框架(ORF)。但前X区核苷酸序列及其ORF仅见于C基因型HBV。在GenBank登记的5 98株不同基因型HBV中,与推导的前-前- S区相似氨基酸序列有36株,而与推导的前X区相似的氨基酸序列有4 7株。结论 前 -前- S区序列存在于除D基因型以外的所有HBV基因型,而前 X区基因仅存在于C基因型HBV基因组中。
- 段学章庄辉杜珩方钟燎
- 关键词：乙型肝炎病毒基因组基因分布
- 广西HBsAg无症状携带者HBV前S基因缺失突变的分子流行病学研究被引量：1
- 2012年
- 目的了解广西HBsAg无症状携带者乙肝病毒(HBV)前S基因(PreS)缺失突变株的流行情况。方法按现况研究的原理,用三阶抽样法,在广西东、西、南、北、中各选定1个县,然后在每个县选择人口约1 000人的自然村,调查该村全人群HBV感染情况,用套式聚合酶链反应(nested PCR)对HBsAg阳性血清HBV前S基因扩增和序列分析。结果共调查4 513人,HBsAg总阳性率为8.7%(395/4 513),Pre-S基因缺失突变率为4.9%(17/350),男、女突变率(5.1%、4.5%)无显著性差异(2=0.07,P>0.05),25岁以下没有出现缺失突变,突变率在50岁年龄组最高,但各组间无显著性差异(P>0.05)。汉族人群突变率较高(6%);钦州突变率最高(7.5%),苍梧最低(1.5%),各民族之间、各县之间突变率均无显著性差异(P>0.05)。所有Pre-S缺失突变都是框内突变,82.4%(14/17)的突变发生在或涉及Pre-S2的5’端。Pre-S2起始密码发生突变率为6.9%(24/350)。基因型B、C、I和D前S基因缺失突变率分别为6.1%(7/114)、4.1%(9/221)、7.1%(1/14)和0(0/1),各组间无显著性差异(P>0.05)。结论广西HBV无症状携带者前S基因缺失突变率较低,PreS1的3’端和PreS2的5’端是缺失突变的好发部位,低年龄组罕见,突变与性别、民族、地理位置和基因型无关。
- 王学燕陈钦艳杨进业莫建军Tim J Harrison方钟燎
- 关键词：乙型肝炎病毒分子流行病学
- HBV/HIV共感染与单纯感染HBV 1762T/1764A突变及前S基因缺失的比较研究被引量：4
- 2017年
- 目的比较分析HBV/HIV共感染者与HBV单纯感染者肝癌相关HBV 1762T/1764A突变及前S基因缺失突变率。方法根据病例对照研究原理,收集未接受HBV及HIV抗病毒治疗的HBV/HIV共感染者和HBV单纯感染者血清标本,用分子生物学技术对血清HBV核心基因启动子(BCP)和前S基因进行分析。结果病例-对照共61对,平均年龄为(44.9±2.1)岁,共发现3个HBV基因型:基因型B、C和I。共感染者和单纯感染者的主要基因型均为B基因型,分别占63.4%(39/61)和50.8%(31/61)。共感染者肝癌相关HBV基因突变总率(52.5%)显著高于HBV单纯感染者(23.0%),差异有统计学意义(χ~2=11.307,P<0.05)。共感染者BCP的1762T/1764A双突变率(44.3%)显著高于HBV单纯感染者(χ~2=7.290,P<0.05)。同样,共感染者前S基因缺失率也显著高于HBV单纯感染者(χ~2=8.270,P<0.05)。随机从两组中各抽20例进行对比分析,结果显示共感染与高病毒载量有关,但是高病毒载量与肝癌相关HBV基因突变无关。肝癌相关HBV基因突变率不随CD_4^+细胞计数变化而变化。多因素分析结果表明,合并HIV感染与肝癌相关HBV基因突变(包括BCP双突变与前S缺失突变)有关。结论 HBV/HIV共感染可增加肝癌相关HBV基因突变率。
- 李开文梁淑家陈钦艳王学燕杨庆利何翔胡丽萍贾蕙华Anna Kramvis方钟燎
- 关键词：乙型肝炎病毒人类免疫缺陷病毒共感染基因变异流行率
- 乙肝病毒核心基因启动子双突变(T1762A1764)筛选肝癌高危人群价值的研究
- 方钟燎李国坚董柏青陈钦艳王学燕杨进业庄辉方孔雄黄坚
- 广西是世界肝癌高发区，手术仍是肝癌主要治疗手段，其存活率取决于早期诊断。因肝癌早期症状隐蔽，大多数病例发现时已进入晚期、失去治疗机会。用AFP和B超对全人群进行肝癌监测可发现早期肝癌，但成本过高，无法实施。先找出肝癌高危...
- 关键词：
- 关键词：肝癌防治手术治疗
- 广西乙型肝炎病毒感染及肝功能情况调查被引量：18
- 2013年
- 目的：了解广西乙型肝炎病毒感染及肝功能损害情况，为乙型肝炎防治提供科学依据。方法按现况研究的原理，用三阶抽样法，在广西东、西、南、北、中各选定1个县，然后在每个县选择人口约1000人的自然村，对全人群采取静脉血，用酶联免疫吸附试验（ ELISA）检测HBsAg，用速率法检测丙氨酸氨基转移酶（ALT）。结果调查人群HBsAg阳性率为8．80％（400/4547），男性HBsAg阳性率高于女性（P＜0．01），不同年龄组HBsAg阳性率差异有统计学意义（P＜0．01），15岁以下年龄组HBsAg阳性率较低（4．79％），15～19岁明显上升，30～34岁达到最高峰（15．97％），35岁以上人群随年龄增加HBsAg阳性率呈下降趋势，但仍处在较高水平。 ALT异常率为9．83％（326/3318），男性ALT异常率高于女性（P＜0．01），19岁以前ALT异常率较低，20～69岁一直维持在较高水平，70岁以后开始下降。 HBsAg阳性人群ALT异常率高于HBsAg阴性人群（P＜0．01）。结论广西仍是乙型肝炎病毒高流行区，肝功能异常率偏高，应继续加强乙肝疫苗接种，做好肝病防治工作。
- 陈钦艳方钟燎杨益超蒙晓宇杨庆利黎军林康明
- 关键词：乙型肝炎病毒乙型肝炎表面抗原肝功能丙氨酸氨基转移酶
- 2011—2021年广西戊型病毒性肝炎流行病学特征分析
- 2024年
- 目的分析广西戊型病毒性肝炎(简称戊肝)的发病情况和流行趋势,为制定戊肝防控策略提供依据。方法通过中国疾病预防控制信息系统传染病监测系统,收集发病时间为2011—2021年、现住址为广西的戊肝病例资料,并采用描述流行病学方法对报告病例的时间、地区、人群等分布特征进行分析。结果2011—2021年广西累计报告戊肝病例14699例,年均报告发病率2.75/10万,2020年报告发病率最低,为1.73/10万,2016年报告发病率最高,为3.27/10万。年均报告发病率前5位的地区分别为玉林市(5.22/10万)、防城港市(4.23/10万)、梧州市(3.94/10万)、贵港市(3.93/10万)、桂林市(3.48/10万)。报告病例数最多的月份是3月(1854例,占12.61%),上半年报告病例数(8498例)稍多于下半年(6201例)。男性病例10309例,女性4390例,性别比为2.35∶1;男性、女性的年均报告发病率分别为3.76/10万、1.73/10万。各年龄段均有发病,发病率随年龄的升高呈上升趋势,发病数最多的是50~59岁组(3507例,占23.86%)。职业分布中,农民发病人数最多(9726例,占66.17%)。结论近年来广西戊肝发病率总体呈先上升后下降趋势,玉林等地是高发地区,男性、农民、中老年群体是高发人群。应进一步加强对重点地区和重点人群的监测,积极开展健康宣传,以降低戊肝对群众的危害。
- 胡莉萍方钟燎王学燕陈钦艳张陆娟蒋智华
- 关键词：戊型病毒性肝炎流行病学特征
- 血清miR-483-5p是感染HBV基本核心启动子双突变(A1762T,G1764A)株人群潜在肝癌高危标记物被引量：1
- 2018年
- 目的探索同为感染HBV基本核心启动子(BCP)双突变病毒株的肝细胞癌(HCC)患者和HBs Ag无症状携带者血清中差异表达的miRNA。方法采用病例对照研究方法,分初筛阶段(miRNA测序)和验证阶段(q RTPCR),筛选组间差异表达的miRNA。初筛阶段招募HCC病例组18人,HBs Ag无症状携带者对照组25人;验证阶段招募200名研究对象,包括1个病例组(39人)和4个对照组(161人)。结果初筛阶段共发现58条差异表达的miRNA,包括39条已知的miRNA和19条新的miRNA。选择7条与肝脏疾病有关的miRNA进行验证,结果发现3条miRNA得到证实。miR-483-5p的ROC曲线下面积(AUC)有最大值(0.815,95%CI:0.750~0.880),若将诊断肝癌阈值设为6.7,其敏感性、特异性分别为89.5%、61.1%;将AFP诊断肝癌阈值设在20.8 ng/m L,AFP的敏感性、特异性分别为61.5%、92.0%。miR-483-5p的表达水平在感染HBV BCP双突变病毒株的无症状携带者组与HBs Ag阴性组间的差异没有统计学意义,但在感染BCP双突变病毒株的无症状携带者组与HCC患者组之间差异有统计学意义(P<0.05)。结论将miR-483-5p与AFP联合使用可提高AFP诊断HCC的敏感性。miR-483-5p可能作为进一步缩小用标记物BCP双突变筛查出来作为肝癌监测的高危人群范围的标记物。
- 王超彭涛陈钦艳胡莉萍王学燕任创创杨庆利陈茂伟方钟燎宋贵生
- 关键词：基本核心启动子
