张仁敏
- 作品数:12 被引量:59H指数:5
- 供职机构:东南大学学习科学研究中心更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金江苏省科技支撑计划项目江苏省卫生厅重点科研课题更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 孤独症肠道菌群结构及病因学的初步研究
- 孤独症(autism spectrum disorders,ASD)是儿童广泛性发育障碍中最为典型最为常见的一种疾病,以语言障碍、交流障碍、刻板兴趣和行为为特征。一般在3岁前发病,该病的患病率较高,而且近年呈明显的上升趋...
- 张仁敏
- 关键词:孤独症变性梯度凝胶电泳高效液相色谱法动物模型病因学
- 2型糖尿病小鼠食道菌群的结构分析被引量:9
- 2011年
- 人体内庞大的微生物群体对人体有着巨大的影响.越来越多的数据表明,肠道菌群与肥胖症、糖尿病等代谢性疾病的发生密切相关.食道菌群结构对研究胃肠道及整个消化系统菌群结构至关重要.针对10只2型糖尿病模型小鼠及10只正常对照小鼠食道样本,进行变性梯度凝胶电泳(DGGE)和克隆测序分析食道菌群结构.结果发现,实验组小鼠与对照组小鼠食道菌群多样性指数与丰富度指数存在显著差异,均匀度指数无显著差异.说明正常小鼠较2型糖尿病小鼠食道菌群种类及数量较大,优势菌种类及相对含量相似.测序结果显示,正常小鼠食道内含乳杆菌属细菌,而患病小鼠食道内不含乳杆菌属细菌或含量极低.提示乳杆菌属细菌与2型糖尿病密切相关,实验结果对研究糖尿病发病机理及并发症治疗有重要意义.
- 胡芳魏婷婷杜彩贺周东蕊张仁敏张红琳陆祖宏
- 关键词:2型糖尿病
- PCR-DGGE指纹图谱技术分析2型糖尿病模型小鼠胃微生物菌群结构被引量:6
- 2012年
- 糖尿病患者多出现胃肠道功能紊乱,如急性胃炎、胃溃疡,以及胃动力低下,胃排空延迟、胃内细菌过度滋长等,进一步导致肠道疾病。研究糖尿病胃内容物菌群结构变化对研究糖尿病发病机理及并发症治疗具有重要意义。该项研究采用变性梯度凝胶电泳技术,对10只2型糖尿病模型小鼠及10只正常对照小鼠进行胃内容物和粘膜样本菌群结构研究。结果表明,实验组小鼠与对照组小鼠胃内容物和粘膜菌群条带数、多样性指数、丰富度指数、均匀度指数与优势度指数均无显著差异,且相似度系数差异不明显。而特异条带测序结果显示正常小鼠胃内含乳杆菌,实验组小鼠胃内乳杆菌含量很低甚至检测不到。提示胃内乳杆菌与2型糖尿病密切相关。
- 杜彩贺胡芳魏婷婷张仁敏张红琳周东蕊陆祖宏
- 关键词:2型糖尿病小鼠
- 肠道菌群结构多样性初筛研究被引量:5
- 2010年
- 目的:探讨研究肠道菌群结构的初筛方法,为进行有效、高质量的高通量测序奠定基础.方法:用粪便采样器采集健康儿童粪便进行粪便标本预处理后,采用酚—氯仿方法提取样本菌群基因组DNA,并进行16S rDNAV3区片段PCR扩增,扩增产物用变性梯度凝胶电泳法(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)检测分析.结果:采用该方法成功地扩增出16S rDNA V3区230bp的片段,经DGGE的方法可以比较出不同儿童粪便样本菌群结构的不同.结论:基于16S rDNA V3区的PCR-DGGE技术能够应用于研究肠道微生物多样性,对于肠道微生物的研究起到了初筛的作用.
- 杜彩贺周东蕊肖飞张仁敏魏婷婷胡芳
- 关键词:RDNAPCR变性梯度凝胶电泳
- 乳腺癌中NDRG-1基因甲基化状态研究被引量:6
- 2008年
- 目的研究NDRG1基因启动子区甲基化状态,探讨NDRG-1基因甲基化在乳腺癌发生中的作用。方法采用双色荧光杂交微阵列基因芯片技术对33对乳腺癌标本和癌旁组织标本NDRG-1基因启动子区甲基化状态进行研究。结果肿瘤标本和癌旁组织标本中NDRG-1基因启动子区CpG位点均有不同程度的甲基化,肿瘤组织中NDRG-1基因启动子区CpG位点甲基化率明显高于相应的癌旁组织(t=14.12,P<0.05)。结论NDRG-1基因启动子区过甲基化可能在乳腺癌的发生过程中起重要作用。
- 王立玮周东蕊房汝敬张仁敏陆祖宏何杰
- 关键词:乳腺癌甲基化
- NDRG-1基因甲基化与乳腺癌发生的关系被引量:7
- 2008年
- 目的对NDRG-1基因启动子区甲基化状态进行研究,探讨NDRG-1基因甲基化在乳腺癌发生中的作用。方法采用双色荧光杂交微阵列基因芯片技术对33例乳腺癌样本和癌旁组织样本进行NDRG-1基因启动子区甲基化状态研究。结果33例肿瘤样本和癌旁组织样本中NDRG-1基因启动子区CpG位点均有不同程度的甲基化,肿瘤组织中NDRG-1基因启动子区CpG位点甲基化率显著高于相应的癌旁样本组织(t=14.12,P<0.05)。结论DNA甲基化作为NDRG-1基因的重要调控机制,NDRG-1基因启动子区过甲基化可能在乳腺癌的发生过程中起重要作用。
- 王立玮何杰周东蕊房汝敬张仁敏陆祖宏
- 关键词:乳腺肿瘤甲基化
- 脆性X染色体综合征的临床检测方法研究
- 2011年
- 目的是建立一种简便、快捷的脆性X染色体综合征的临床检测方法.在常规PCR的基础上,采用热启动法,同时加入PCR增强剂Btaine、DMSO,对20例表型正常人群外周血样本进行FMR1基因(CGG)n重复序列检测.结果表明,改良后的FMR1基因PCR扩增技术能够高效扩增CG富集区,采用该方法我们检测了20例外周血样本均获得目标片段,PCR扩增产物片段长度400~500bp(相当于n=20~53).因此,该方法简便、快速、经济而且重复性好,可用于群体普查和门诊快速筛查脆性X染色体综合征.
- 魏婷婷周东蕊张红琳付文忠张仁敏杜彩贺胡芳
- 关键词:脆性X染色体综合征FMR1基因PCR
- PCR-DGGE指纹图谱技术分析孤独症儿童肠道菌群结构
- 目的 应用PCR-DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis,变性梯度凝胶电泳)指纹图谱技术对孤独症肠道微生物菌群结构进行研究。材料和方法 分别提取正常儿童和孤独症儿童粪...
- 张仁敏周东蕊宋媛杜彩贺魏婷婷胡芳肖飞孙蓓丽谢雪英陆祖宏
- 关键词:PCR-DGGE肠道菌群孤独症
- 文献传递
- PCR-DGGE法在慢性胃炎病人舌苔菌群结构研究中的应用被引量:20
- 2011年
- 在早间未刷牙和进食的情况下,刮取胃炎病人与正常人舌苔,去除杂质,分离菌体,采用酚/氯仿法抽提细菌基因组DNA,并对其中16S rDNA V3可变区进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和变性梯度凝胶电泳(DGGE)测定.用Bionumerics软件对DGGE分子指纹图谱进行舌苔菌群结构相似性分析.实验结果表明,采用该方法成功地扩增出16S rDNA V3区片段,为230 bp.DGGE分子指纹图谱结果表明,正常人的舌苔菌群最高相似性为0.74,胃炎病人的舌苔菌群的最高相似性为0.52,正常人的舌苔菌群与胃炎病人的舌苔菌群相似性最高为0.38,即胃炎病人舌苔菌群结构发生了变化.
- 张红琳田凯旋周东蕊杜彩贺张仁敏陆祖宏
- 关键词:胃炎舌苔菌群结构
- 应用PCR-DGGE技术分析BKS-2型糖尿病模型小鼠盲肠内容物微生物菌群结构被引量:4
- 2012年
- 通过对BKS-DB 2型糖尿病小鼠盲肠内容物微生物群落结构的分析,探讨基因突变模型鼠肠道微生物群落与糖尿病发生的相关性。提取BKS-DB 2型糖尿病小鼠与同窝对照小鼠盲肠内容物细菌总DNA,PCR扩增16S rRNA基因V3区,DGGE方法检测扩增产物,并挑选特异条带测序,对图谱作UPGAMA聚类分析,运用SPSS软件分析多样性。结果显示,UPGAMA聚类分析表明,对照组样本之间相似度0.66-0.91,糖尿病组样本之间相似度0.61-0.88,两组之间最高相似度为0.51。特异性条带测序后经比对与Parabacteroides菌属亲缘关系最近。SPSS统计分析糖尿病组和健康对照组小鼠的DGGE条带数、多样性指数(H’)、丰富度(R)和优势度(D)的差异性显著,具有统计学意义(P<0.05)。糖尿病组小鼠与对照组小鼠的盲肠内容物微生物群落多样性存在差异,糖尿病对肠道微生物的多样性有影响。
- 魏婷婷胡芳杜彩贺张仁敏周东蕊张红琳陆祖宏
- 关键词:2型糖尿病