宋桃伟
- 作品数：25 被引量：57H指数：5
- 供职机构：贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：贵州省农业科技攻关项目贵州省重大科技专项计划项目教育部促进与美大地区科研合作与高层次人才培养基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 山羊GHSR基因多态性及其与体重和体尺性状的相关性研究被引量：7
- 2013年
- 本研究旨在探讨GHSR基因SNP与山羊体重和体尺性状的关联性。试验以贵州白山羊和黔北麻羊为研究对象,采用DNA池结合PCR产物直接测序及PCR-SSCP技术检测GHSR基因的单核苷酸多态性。结果发现,在贵州白山羊和黔北麻羊GHSR基因外显子2和3′UTR区检测到2个SNPs位点G996A和T1424C,其中G996A位点为同义突变,表现为3种基因型,分别命名为GG、GA和AA,而在外显子1和5′UTR区未发现多态位点。基因型与体重体尺性状关联分析显示,黔北麻羊GG和GA基因型个体的体重显著高于AA基因型个体,胸深小于AA基因型个体(P<0.05),其余5个指标均差异不显著(P>0.05);在贵州白山羊中,GG基因型个体的体重、体斜长和管围均显著高于AA基因型个体(P<0.05)。研究结果提示:GHSR基因可能是影响山羊体重的主效基因或与主效基因连锁,G996A位点可望作为提高山羊个体体重的分子遗传标记。
- 宋桃伟罗卫星蔡惠芬刘彬孙岩岩
- 关键词：山羊单核苷酸多态性体尺性状
- 贵州山羊品种RERG基因的克隆及不同组织表达
- 2013年
- 选择与羊同源性较高的牛ras相关的雌激素调节的生长抑制因子(ras-related estrogen-regulated growth in-hibitor,RERG)基因组序列设计特异性引物,通过RT-PCR技术对RERG基因进行克隆测序及生物信息学分析。结果显示,克隆了羊RERG基因cDNA序列629bp,完整的开放阅读框(ORF)为20～620bp,其编码199个氨基酸。GenBank登录号分别为JN672576、JQ917222和JN580309。通过实时荧光定量RT-PCR技术分析RERG基因在贵州三大地方品种同一年龄段不同组织中的表达情况。结果表明,成年羊肺脏和脾脏表达量是最高,胸腺表达量最低,肌肉表达量为相对中度表达。为进一步研究地方品种羊生长性状的改善提供科学依据。
- 陈志罗卫星刘若余张依裕蔡惠芬石照应宋桃伟
- 关键词：CDNA克隆
- 羊MHC基因多态性与抗病性状的相关性研究进展被引量：5
- 2014年
- 羊主要组织相容性复合体(MHC)具有高度多态性,与羊的多种疾病抗性密切相关。MHC已是世界范围内的研究热点且已取得了很大的研究进展。介绍了羊MHC的结构与功能、国内外有关羊MHC的多态性研究现状及MHC与羊抗病育种的相关研究,并展望了MHC在羊抗病育种中的应用前景,为今后羊的抗病育种研究提供理论依据。
- 刘彬罗卫星蔡惠芬宋桃伟孙岩岩
- 关键词：MHC多态性抗病育种
- 山羊GHRL基因多态性及其与体重、体尺性状的关系研究被引量：6
- 2014年
- 采用PCR-SSCP技术对贵州黑山羊和贵州白山羊GHRL基因进行单核苷酸多态性检测,并分析其多态与体重、体尺性状间的关联性。结果发现,在GHRL基因外显子4处存在1个同义突变位点(C345T),表现为2种基因型,分别命名为CC和CT。基因型与体重、体尺性状关联分析结果显示,在贵州黑山羊(麦坪)群体中,CT基因型个体的体重、体高和胸围均显著高于CC基因型个体,而在贵州黑山羊(纳雍)和贵州白山羊群体中差异不显著。研究结果揭示,GHRL基因突变位点(C345T)影响贵州黑山羊生长性状可能性较大,该位点有望作为山羊生长性状的一个标记辅助选择位点。
- 罗开鹏宋桃伟孙岩岩刘彬罗卫星黄安志张许
- 关键词：贵州黑山羊贵州白山羊
- 贵州本地山羊TFB1M基因启动子区多态性生物信息学分析
- 2014年
- 目的:采用DNA池结合PCR技术,筛选TFB1M基因启动子区SNP位点,并分析其对启动子区的影响。方法:利用多种生物信息学软件预测TFB1M基因核心启动子范围、转录因子结合位点、CpG岛。结果:TFB1M基因启动子区发现1个SNP位点G-234A。TFSEARCH软件预测结果显示TFB1M基因启动子区转录因子ADR1与Sp1位置调换,且ADR1位置的提前导致TFB1M基因转录效率增高。结论:G-234A位点可能影响TFB1M基因转录,试验结果为进一步分析TFB1M基因启动子区功能奠定基础。
- 孙岩岩罗卫星谢海强宋桃伟刘彬蔡惠芬
- 关键词：SNP启动子
- 贵州白山羊和黔北麻羊TFAM基因部分外显子多态性研究被引量：4
- 2013年
- 利用黔北麻羊和贵州白山羊构建品种DNA池,设计1对引物分别扩增其TFAM基因第2外显子及第1内含子部分序列。PCR产物纯化后进行双向测序,DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息学软件分析SNPs位点对TFAM基因RNA二级结构和TFAM蛋白二级、三级结构的影响。结果表明:在羊TFAM基因中筛选到5个SNPs:T1005C、G1099C、A1130C、G1164C、T1287C,其中T1005C为同义突变,G1099C为错义突变,导致编码的甘氨酸(Gly)变为半胱氨酸(Cys);A1130C、G1164C、T1287C 3个突变位点均位于内含子区。SNPs位点对TFAM基因RNA二级结构和TFAM蛋白结构有一定影响。
- 谢海强杨永强宋桃伟孙岩岩刘彬罗卫星张依裕刘若余
- 关键词：TFAMSNPS肌内脂肪沉积黔北麻羊贵州白山羊
- 山羊前列腺素内过氧化物合酶2基因的多态性检测及生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 本试验以贵州省3大地方山羊品种贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊和2个省外地方品种关中奶山羊和内蒙古绒山羊为研究对象,采用DNA池结合PCR直接测序法对山羊前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase2,PTGS2)基因进行单核苷酸多态性检测。结果表明,在5个山羊品种中共检测到6个SNPs位点:A96G、C20T、A239G、T192C、T164A和G91C,其中,A96G和T164A分别位于外显子7和外显子8中,且均为同义突变,其余4个变异位点位于内含子中。生物信息学分析显示,外显子7和8中的2个SNPs位点均导致了mRNA二级结构的改变。
- 宋桃伟罗卫星蔡惠芬刘若余陈志惠嫣婷
- 关键词：山羊单核苷酸多态性生物信息学
- GHSR基因变异及其与贵州黑山羊体重体尺的关联研究被引量：3
- 2014年
- 本实验以82只贵州黑山羊为研究对象,采用DNA池结合PCR产物测序及PCR-SSCP技术检测GHSR基因的单核苷酸多态性,探讨GHSR基因SNP与山羊体重、体尺性状的关联性。结果表明:在GHSR基因外显子2′和3′UTR区分别检测到1个SNP位点(G996A和T1424C),而在外显子1′和5′UTR区未发现多态性;G996A为错义突变位点,表现为3种基因型,分别命名为GG、GA和AA,其基因型频率分别为0.2317、0.5122和0.2561,等位基因G和A的频率分别为0.4878和0.5122;χ2适合性检验表明,贵州黑山羊GHSR基因外显子2等位基因的分布符合HardyWeinberg平衡。基因型分型后个体体重体尺性状间差异显著性分析显示,GG基因型个体的体重与AA基因型个体的体重间差异显著;GA基因型个体的体高和体斜长与AA基因型个体间均存在显著差异(P<0.05);而3种基因型个体的胸围、管围间的差异不显著(P>0.05)。综上说明,G996A位点突变与贵州黑山羊体重、体高和体斜长间有一定的相关性,但与胸围、管围间没有明显的关联。
- 朱冠群罗卫星吴仙韩勇孔德顺宋桃伟
- 关键词：体尺性状贵州黑山羊
- 贵州山羊品种RERG基因多态性与生长性状的相关性被引量：5
- 2013年
- 【目的】研究贵州地方山羊品种黔北麻羊、贵州白山羊和贵州黑山羊ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor(RERG)基因第2、3和4外显子的多态性及其与生长性状的相关性。【方法】本试验通过PCR-SSCP技术和直接测序法,对3个品种外显子SNPs位点进行检测,利用一般线性模型分析其与生长性状的关联性。【结果】3个供试群体中在第4外显子上都检测到4个SNPs位点,即56 bp(C/G)、826 bp(A/G)、1 434 bp(T/C)和1 798 bp(A/T)。最小二乘法分析结果表明,AA型和BB型的体重对AB型达到差异极显著水平(P<0.01),CC型和DD型的体重对CD型达到差异显著水平(P<0.05),EE型和FF型的体重对EF型达到差异极显著水平(P<0.01)、1 798 bp(A/T)位点各基因型间差异不显著。【结论】RERG基因的56 bp(C/G)、826 bp(A/G)和1 434 bp(T/C)多态性位点可作为生长性状的候选分子标记。
- 陈志罗卫星刘若余蔡惠芬承杰宋桃伟张依裕
- 关键词：PCR-SSCP生长性状
- 简易控温PCR-SSCP凝胶电泳装置
- 本实用新型公开了一种简易控温PCR-SSCP凝胶电泳装置，包括凝胶电泳仪（1）、凝胶电泳槽（8）和凝胶电泳箱，凝胶电泳槽（8）位于凝胶电泳箱身（3）内，凝胶电泳槽（8）与凝胶电泳箱身（3）内壁之间有间隙（7），凝胶电泳槽...
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- 文献传递
